10月16日之前 |
10月16日之后 |
会员:3900元/人 |
会员:4300元/人 |
非会员:4100元/人 |
非会员: 4500元/人 |
第一天全天 |
基于微流控技术的单细胞分析 |
微流控技术与单细胞分析概述
基于微流控技术的单细胞样品制备(稀有细胞微流控分选、 单细胞捕获与分析、微芯片式细胞培养)
单细胞的微流控检测(基于亲和反应、基于细胞物理特性) 与分析技术
微流控细胞分析技术在生物医学(肿瘤早期检测、其他领域)
中的应用 |
理论 |
第二天上午 |
单细胞测序技术与应用 |
单细胞组学技术发展历程和原理介绍。
单细胞测序技术在科研领域的应用。
近年单细胞方向高分文章思路解析。
单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍。 |
理论 |
第二天下午 |
Linux 及 R 语言入门与实操 |
常规基础 Linux 命令入门讲解及实操训练。
R 语言简介及安装,RStudio 的安装及使用说明。
R 语言语法介绍及常用命令。
数据处理功能及统计应用。
R 语言画图实操。 |
实操 |
第三天上午 |
单细胞转录组数据分析思路及流程 |
单细胞实验处理、建库及测序。
单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等分析思路。
单细胞转录组转录因子及功能通路解析。
单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物、微生物等领 域的研究内容及思路。 |
理论 |
第三天下午 |
单细胞转录组数据分析实操 |
常规单细胞组学数据比对。
10X 官方单细胞软件Cellranger 讲解及实操。
从基因表达矩阵开始到marker 基因筛选全过程讲解及实操。
通过 Seurat 软件进行PCA 及tSNE 降维。
单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。
通过 Seurat 及GSVA 等进行单细胞转录组差异分析。 |
实操 |
第四天上午 |
多组学整合分析和结果解读 |
转录组,基因组,表观分析介绍。
RNA 和 ATAC-seq 等多组学整合分析。
常规 10X 单细胞 ATAC 数据测序原理简介、分析流程介绍。
单细胞免疫组库测序技术及应用。
组学分析常用数据库介绍及使用。 |
理论 |
第四天下午 |
单细胞转录组轨迹、通路、转录因子等分析及绘图实操 |
通过 Monocle 软件进行单细胞转录组拟时间分析。
通过 DAVID 及 metascape 网站进行通路富集分析。
通过 SCENIC 软件进行转录因子预测分析。
tSNE,小提琴图,热图,网络图,GO、KEGG 富集图,GSEA 等图形绘制。 |
实操 |