芯片与生物信息学

Affymetrix芯片服务

基本信息
服务名称:
Affymetrix芯片服务
英文名称:
Affymetrix Service
参考报价:
询价热线 021-58955370
总点击数:
8990
更新日期:
2020-03-13
服务类别:

服务详情
提供以下产品的技术服务

人基因组表达谱芯片
(1) Human Genome U133 Plus 2.0 Array
(2) Human Genome U133A 2.0 Array
(3) Human Genome Focus Array
(4) Human X3P Array

小鼠基因组表达谱芯片
(1) Mouse Genome 430 2.0 Array
(2) Mouse Genome 430A 2.0 Array

大鼠基因组表达谱芯片
(1) Rat Genome 230 2.0 Array
(2) Rat Expression Set 230

其他物种基因组表达谱芯片
拟南芥ATH1基因组芯片、枯草芽孢杆菌反义基因组芯片、大麦基因组芯片、牛基因组芯片、犬基因组芯片、线虫基因组芯片、鸡基因组芯片、果蝇基因组芯片、大肠杆菌基因组芯片、玉米基因组芯片、苜蓿基因组芯片、绿脓杆菌基因组芯片、恶性疟原虫/按蚊基因组芯片、白杨基因组芯片、猪基因组芯片、恒河猴基因组芯片、水稻基因组芯片、金黄色葡萄球菌基因组芯片、大豆基因组芯片、甘蔗基因组芯片、西红柿基因组芯片、葡萄基因组芯片、小麦基因组芯片、爪蟾基因组芯片、酵母基因组芯片、斑马鱼基因组芯片

外显子研究芯片——Affymetrix GeneChip® Human Exon 1.0 ST (sense target) Array

SNP分析芯片—Affymetrix Mapping Array
(1) Mapping 500K Array Set
(2) Mapping 100K Set
(3) Mapping 10K 2.0 Array
 
公司简介
上海伯豪生物技术有限公司为科研及临床工作者提供技术外包服务。服务涵盖:单细胞组学服务、基因组学服务、转录组学服务、蛋白组学服务/代谢组学服务、功能组学服务、微生物组学服务、生信数据分析等一条龙技术服务、试剂采买及相关配套整体服务解决方案。
       上海伯豪生物技术有限公司(以下简称:SBC)是上海生物芯片有限公司-生物芯片上海国家工程研究中心根据国内外研发外包发展的需要,整合旗下系统化技术平台、商业化服务体系、高素质服务团队等资源成立的致力于研发外包服务公司。 
上海伯豪生物技术有限公司拥有五大微阵列芯片服务平台(SBC、Affymetrix、Agilent、NimbleGen和Illumina芯片平台),三大第二代测序服务平台(ABI SOLiD 5500、Illumina Solexa、和Roche 454测序平台)以及ABI定量PCR、ABI 3730测序等验证服务平台。正在为多达18家跨国制药企业(包括排名前10位的跨国制药企业中的8家)和1133家国内科研机构、医院提供基因表达谱、基因分型、比较基因组学、DNA甲基化、miRNA、生物信息分析等技术服务。
多年来,SBC凭借高标准的技术平台和多样性的服务等竞争优势,向国内外企业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案,9年来承接项目数3018个,用户单位1133家,地域遍及全国27个省市自治区。生物芯片服务市场占有率达到40%以上,全面推动了中国基因组学服务产业的发展。
上海伯豪生物技术有限公司技术平台在获得广大客户青睐的同时,也得到合作伙伴的高度评价,公司不仅是Affymetrix公司在中国第一家认证的服务提供商,同时也是Agilent公司和ABI公司在国内认证的服务提供商,且先后被授予“Agilent公司亚太区最佳服务供应商”和“Affymetrix公司优秀服务商”称号。相信上海伯豪生物技术有限公司凭借高端的现代化仪器设备、多项成熟完善的技术平台、高素质的技术团队、国际水平的商业化服务流程、积极进取的经营理念,为广大客户提供持续、高效和稳定的技术支持和服务,从而成长为中国生物技术领域的研发外包旗舰企业。 

经营范围

       生物芯片、实验室试剂及相关设备的研发、生产、销售,生物医药技术专业领域的技术服务、技术转让、技术咨询,从事货物与技术的进出口。 【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】。

科研服务​
基因组
全外显子组测序 
全基因组重测序 
SNP位点分型 
中低通量SNP检测-一代测序 
Affymetrix CytoScan HD芯片检测服务 
Affymetrix OncoScan FFPE芯片检测服务
基于Fluidigm BioMark系统的基因分型检测 
Taqman探针法基因分型检测 
 
转录组
单细胞RNA测序
ceRNA芯片 
全转录组测序 
lncRNA芯片
miRNA芯片 
lncRNA测序
Agilent表达谱芯片 
Affymetrix表达谱芯片
真核转录组测序
原核转录组测序 
small RNA测序
环状RNA测序(circRNA测序)
RNA de novo测序
基于Luminex 200系统的QGP核酸多重检测 
基于Fluidigm BioMark系统的基因表达分析
miRNA定量 
mRNA/lncRNA/circRNA定量
PCR Array
转录因子分析及网络构建 
 
表观组
Illumina 850k甲基化芯片
安捷伦甲基化捕获测序(MC-seq) 
全基因组Bisulfite甲基化测序(WGBS)
甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP-seq)
染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)
DNA羟甲基化测序 
焦磷酸测序 
 
蛋白组
蛋白芯片-Milliplex液相悬浮芯片
蛋白芯片-FullMoon蛋白芯片 
 
微生物组
宏基因组测序 
微生物基因组de novo测序
微生物16S/18S/ITS等扩增子测序
 
生信分析
转录因子分析及网络构建 
基因相互作用网络图
共表达网络图(Coexpression Network) 
加权基因共表达网络分析(WGCNA)
microRNA与靶基因网络图 
microRNA-GO-network 
microRNA-pathway-network 
信号通路调控网络构建(Pathway-Network)
趋势分析
lncRNA和mRNA共表达分析
功能层次网络构建
ceRNA调控网络
基于mRNA表达的GSEA分析
时间序列的共表达网络
分子建模预测
Canonical pathways analysis
Diseases and Bio Functions
基因的信号通路网络图 
上游调控分析 
调控机制分析
 
功能组
CRISPR/Cas9基因敲除服务 
CRISPRi服务
细胞转染(瞬时/稳定转染)
细胞表型检测
细胞功能预测和信号通路研究工具箱
相互作用研究和验证
动物实验(基因敲除/基因敲入/转基因大小鼠)
RNAi服务

技术平台
生物样品分析平台
公司样本中心采用LIMS系统进行样本全程管理,年分析样本30000多例。
 
微阵列芯片服务平台
已建立了Shbio芯片、Affymetrix芯片、Agilent芯片、Illumina芯片等微阵列技术服务平台。 
 
新一代测序服务平台
上海伯豪生物技术有限公司自2009年起先后建立了ABI SOLiD新一代测序服务平台和Illumina新一代测序服务平台,拥有Illumina HiSeq2500 V4,HiSeq2500 V3,Illumina GAIIx,ABI Ion PGM,ABI SOLiD5500和ABI SOLiD4。 
 
单细胞测序平台
基于SMART-seq技术,可对来源于人、小鼠、大鼠、果蝇、斑马鱼、牛、羊等物种的样本提供单细胞测序。拥有单细胞测序的主流平台——BD Rhapsody,10 X genomics。 
 
生物标志物平台
公司在生物标志物研究上拥有从临床实验设计,样本处理,高通量筛选,标志物算法开发、验证、维护,临床检测服务及体外诊断试剂盒生产的一站式服务。
 
分子检测平台
该平台主要进行中低通量的核酸检测服务,主要包括Sanger测序技术,焦磷酸测序技术,荧光定量PCR技术,PCR array等服务。本平台主要检测仪器ABI3730XL,ABI 7900HT,ABI750,Fludigm BioMarkHD,Qiagen PyroMark Q96,Agilent Mx3005P等。 
 
生信分析平台
公司定制了天梭TS10000高性能集群,该集群在设计上专注于提高HPC应用的运行效率,增强系统的可扩展性,致力于提升系统的总体的计算能力、加速节点间的数据交换和系统的I/O带宽。同时,公司还根据实际运算需求,开发了不同级别的软件应用,促进系统内部服务器、存储、应用之间最大限度趋近协同运算。整体硬件设计采用了“高性能计算节点+高速网络+高效能存储”的整套定制方案。并开发了SBC Analysis System(SAS系统)等基于web页的在线生物芯片自助分析系统,为客户提供生物信息解决方案。 

售后服务
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