图1:基于EvaGreen®染料方法的基因组DNA绝对定量
对未进行片段化的人基因组DNA进行倍比稀释,浓度范围从1000-0.2copies/μL,使用NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统进行绝对定量,使用1.5XEvaGreen®,1XPerfeCTa @ UNG Tough mix,扩增片段大小为104bp的EGFR基因片段。为了保证重复性和稳定性我们进行了三次重复(R2= 0.9977)。在NTC(无模板对照)孔中没有观察到阳性微滴。
EVAGREEN®核酸绝对定量实验的建立
当使用EvaGreen®方法进行数字PCR实验时,需要注意,加入PCR mix的模板dsDNA浓度过高将导致较高的背景荧光。此外,EvaGreen®染料与dsDNA具有较高的亲和力,但同时也与存在mix中的寡核苷酸有较低的亲和力,导致背景荧光的增加。
根据您所需定量的DNA类型和数字PCR反应体系,需要预估实际的动态范围。有关如何建立EvaGreen®实验的更多信息,可登录我们网站 http://stillatechnologies.com。
图2:EvaGreen®绝对定量散点图
对未片段化的人类的基因组DNA进行倍比稀释后,浓度范围1000-0.2copies/µL,使用NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统进行绝对定量,使用1.5XEvaGreen®,1XPerfeCTa @ UNG Tough mix,扩增片段大小为104bp的EGFR基因片段。
灰色点:阴性微滴,蓝色点:阳性微滴。
RFU:相对荧光强度。