感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病，快速、准确的诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提。随着分子检测技术的不断发展和完善，分子检测在病原微生物感染诊断及治疗监测上的临床应用日益广泛，已成为一些重要的感染性疾病的诊断和疗效评价中不可缺少的重要工具。
随着基础研究的深入与技术的进步，病原微生物的认知程度和检测市场也不断增长，为了适应未来发展需求，AMTK推出了系列病原微生物分子检测方向的自动化解决方案，整个流程方便快速、自动化程度高、结果精确、污染率低，很好的服务于血站、医院、疾控中心、第三方医学检验所等机构。
       目前常用的病原微生物分子检测方法主要包括：基于PCR的电泳法、实时荧光定量PCR（QPCR）、数字PCR、基因芯片技术、测序技术（Sanger测序技术、焦磷酸测序技术、高通量测序技术）等。今天给大家分享的AMTK病原微生物自动化解决方案主要基于 QPCR和NGS检测方法。       QPCR技术已经广泛应用于已知病原微生物的定性和定量检测、基因分型、耐药性基因检测等方面，一方面用于个体病情评估、疗效预测、预后判断等，在感染性疾病的个体化治疗中具有重要的临床应用价值；另一方面用于了解病毒的流行状况, 监测病毒的流行型别, 发现病毒传染源, 对于制定有针对性病毒性传染性疾病的防控策略和措施具有重要意义。
方案一：高通量QPCR检测自动化解决方案
该方案一次可完成96-192 个样本的检测
1、病原微生物QPCR检测流程图

2、工作站配置
配置说明

3、案例分享
（1）EB病毒QPCR检测
16个样本分别人工和AMTK工作站进行提取和QPCR体系构建，其中工作站平行3次实验，数据对比如下：


结论：EB病毒的自动化提取效果与人工提取无显著差异，样本浓度达到测试要求。
（2）HPV病毒QPCR检测
2个样本原液和梯度稀释4次，分别人工和AMTK工作站进行HPV提取，QPCR检测结果如下：


结论：实验组AMTK和对照组人工的QPCR检测结果无显著差
方案二：原管上样QPCR检测自动化一体机解决方案
该方案实现样品处理全流程自动化
1、QPCR检测流程图

2、主机配置

3、案例分享
（1）HPV核酸提取检测数据
32个宫颈脱落细胞保存液原管上样，AMTK LH-1808工作站进行HPV核酸提取，提取后DNA的检测结果如下：
结论：AMTK LH-1808原管上样及核酸提取浓度均一性、浓度和纯度在合格范围内。
  如今，NGS已经迅速成为临床实验室的重要检测平台，延展提高了经典微生物方法的检测能力。NGS技术在病原微生物检测上的应用，主要作用有：（1）病原体快速鉴定（特别是对未知或者无法培养的病原）；（2）通过病原体基因组变异，研究病原体随时间的变异情况，有助于疫情起源追踪与疫情监测；（3）研究病原体的种属信息、耐药情况、毒力因子、与宿主的相互作用等，提供快速精准诊断依据、辅助疾病治疗与防控，促进药物的合理使用。
方案： NGS全流程检测解决自动化方案
该方案可完成1-32 个样本的NGS检测
1、病原微生物NGS检测流程图：



2、​工作站配置












3、案例分享
16个样本分别人工和AMTK LH-1406工作站进行核酸提取和文库构建，文库QPCR定量结果如下：

数据显示：AMTK LH-1406工作站与人工提取和文库构建后的QPCR结果无明显差异。
 
    奥美泰克在病原微生物分子检测方面提供了系列样本前处理的自动化解决方案，不仅节省人力成本，缩短检测时间，而且保证样本结果的均一性和准确性。未来，奥美泰克随着病原微生物检测市场规模的不断增长，将整合更多智能化功能模块，如离心、血浆分离、QPCR
分析系统等，将优质、高效、一体化的自动化方案呈现给客户。
 
 
参考资料

1. 感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南。

      2、华大王威博客—NGS与病原体生物鉴定。