随着科学的进步，病原宏基因组测序（mNGS）被越来越多的人所认可和接受，此技术可以对病原微生物做及时有效的分析，避免用药失误，错过最佳治疗时间，做到精准医疗。下面我们先来看几个例子：

患者，女，24岁，右侧腋窝疼痛1周，发热5天入院，反复发热，发热原因一直未明，使用多种抗生素效果不好，后送检病原宏基因组测序（mNGS），回报汉氏巴尔通体感染，更改抗生素后，患者症状缓解，一周后出院。

患者，男，61岁，以“肝癌术后8月，复发一月余”为主诉入院，该患者过往有结核病史，怀疑复发感染，使用多种药物不见好转。后经送检肺组织病原宏基因组测序（mNGS），回报结果考虑患者鸟-胞内分枝杆菌感染，排除结核分枝杆菌感染，给予正确抗感染药物治疗，一周后患者各项指征趋于正常，体温平稳，未诉特殊不适，患者出院。

患者，女，41岁，高烧一周不退，体温最高至40℃，头晕、头疼、咳嗽，肺部大面积感染，各种抗感染药物治疗无效。结合肺泡灌洗液NGS结果、查血结果等相关辅助检查, 考虑重症肺炎、鹦鹉热衣原体感染。由于鹦鹉热衣原体治疗周期较长，因此医生继续使用之前的抗感染治疗方案， 4天后患者体温逐渐恢复正常，症状好转，继续治疗一周后患者康复出院。

可见，对于不明原因的疾病，及早的进行感染病原微生物高通量的检测，是一种行之有效的办法，为医生早期诊断提供机会，为患者赢得治疗的时间，又能减少医疗费用。

那么，什么是病原微生物？
 

病原微生物是指可以侵犯人体，引起感染甚至传染病的微生物，或称病原体。病原体中，以细菌和病毒的危害性最大。 病原微生物指朊毒体、寄生虫（原虫、蠕虫、医学昆虫）、真菌、细菌、螺旋体、支原体、立克次体、衣原体、病毒。
 

医学检验中采集病原微生物用于mNGS的样本有哪些类型？

样本类型主要有静脉血、脑脊液、肺泡灌洗液、痰液、胸水和腹水、咽部分泌物、局灶穿刺物、组织等多种类型。

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病原微生物进行测序前处理中关键的一步是什么？

采集完样本后，首先要对病原微生物进行测序前处理，前处理过程中关键的一步是核酸提取，因为病原微生物核酸提取效果的好坏，会直接影响到后续测序的成败。MP Biomedicals的FastPrep^®快速样品制备仪在病原微生物核酸提取中具有优秀的表现：

MP快速样品制备仪系列产品上市十几年以来，经过客户和市场的验证，已被上万篇文章引用，在业内具有良好的口碑。

下面我们来看下FastPrep^®快速样品制备仪在医学检验中的案例:

 

案例一：从感染TB的小鼠肺，肝和脾中分离活的TB

检测目的：从感染的组织中分离完整的TB

应用：细菌培养

样本类型：小鼠/大鼠肺，肝，脾

实验仪器：FastPrep-24^TM  5G；裂解介质M（肺），裂解介质D（肝，脾）

实验步骤：小鼠肝，脾，裂解介质D，6 m/s，研磨 30 ~60 sec

 

案例二：组织活检感染的微生物诊断

检测目的：从感染的活检标本中分离微生物

应用：细菌培养

样本类型：组织活检

实验仪器：FastPrep-24^TM  5G；12×15 mL适配器；8~10颗 氧化锆珠（裂解介质M）

实验步骤：

1. 将1~2 g 的活检样本放入15 mL 裂解介质M中；

2. 加入5 mL葡萄糖肉汤培养基；

3. 6.5 m/s，40 sec进行研磨；

4. 研磨后，取出管子，弃掉珠子；

5. 接种培养基，将匀浆后的活检样本移入无菌玻璃器皿中储存。

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相关文献

RobinLombard, Emilie Doz, Florence Carreras, Mathieu Epardaud, Yves LeVern,Dominique Buzoni-Gatel, Nathalie Winter IL-17RAin Non-Hematopoietic Cells Controls CXCL-1 and 5 Critical to RecruitNeutrophils to the Lung of Mycobacteria-Infected Mice during the AdaptiveImmune Response，PLOS ONE |DOI:10.1371/journal.pone.0149455, 2016.