RNA提取主要用到的试剂以及相关原理介绍
2024-08-06 来源:本站 点击次数:511
RNA提取主要用到的试剂以及相关原理:
Trizol主要成分:苯酚和异硫氰酸胍;原理是裂解细胞,促使核蛋白体解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。
氯仿:分子量较大的有机溶剂,可抽提酸性苯酚;氯仿密度大,使有机相和水层分离。RNA提取过程中,苯酚与蛋白结合进入有机相中,使蛋白与RNA脱离,RNA进入水相。在EP管中会出现上层是RNA,中层白色的是DNA,下层是蛋白质。
异丙醇:其-OH为亲水基团,与水更好的结合从而使RNA脱水产生沉淀。
DEPC水:RNA酶抑制剂和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性。
RNA提取步骤:
1. Trizol裂解细胞或组织,充分裂解;
2. 氯仿抽提,每管200ul氯仿,剧烈晃动混匀,冰上静置10min;
3. 12000rpm,4℃离心15min;
4. 小心吸取上清液(一般吸取400ul)至于新的EP管中,可看到溶液分三层,上层澄清透明的是含RNA的水相,中层白色絮状物是DNA,下层粉红色是含蛋白质的有机相。
5. 加入等体积(400ul)的异丙醇进行脱水,上下颠倒10~15次,轻柔的混匀,冰上静置10~30min;
6. 12000rpm,4℃离心10min;
7. 离心后可看见管壁有白色沉淀,如若没有,可重复步骤6,再离心;后弃掉上清液,缓缓倒出上清液,注意不要将沉淀倒出,加入75%乙醇(无水乙醇:DEPC水=3:1)上下颠倒,直至沉淀离开管壁(清洗RNA沉淀)
8. 12000rpm,4℃离心5min;
9. 再次清洗(弃掉上清液,缓缓倒出上清液,注意不要将沉淀倒出,加入75%乙醇,上下颠倒,直至沉淀离开管壁;
10. 12000rpm,4℃离心5min;
11. 弃掉上清液,将EP管倒扣在干净的滤纸上,吸干EP管内残留的液体,保证管内仅剩RNA沉淀;
12. 加入一定量的DEPC水(根据RNA沉淀的大小加,一般10~20ul),瞬离,轻弹EP管,保证沉淀溶于DEPC水中后,再次瞬离,RNA完全溶解后,至于-80℃保存。