【EMBO Reports】Induction of a transcriptional adaptation response by RNA destabilization events
RNA 去稳定化事件诱导转录适应（TA）反应

转录适应（Transcriptional Adaptation，TA）是一类重要的细胞调控机制，可由 mRNA 去稳定化突变引发，表现为特定基因转录水平的上调。该现象最早于斑马鱼研究中被报道，后续在线虫、家蚕、小鼠和人类等多个物种中均得到验证。然而，触发 TA 的分子机制尚不明确，目前存在两种主流假说：其一，mRNA 序列上的提前终止密码子直接启动 TA；其二，mRNA 衰变过程本身或其产物引发这一转录适应反应。

作者单位：德国马克斯·普朗克研究所

期刊：EMBOReports

发表年份：2025年

样本：小鼠NIH3T3细胞

分析设备：美国 Orflo Technologies，Moxi Z 库尔特流式细胞计数仪

本研究以小鼠 NIH3T3 细胞为模型，采用三种手段特异性破坏 Actg1 mRNA 的稳定性：Cas9 诱导的提前终止密码子突变（以触发无义介导的 mRNA 衰变）、Cas13d 介导的 mRNA 切割，以及 T3H48 核酶介导的前体 mRNA 切割，并据此构建多组对照实验。通过 RT-qPCR、Westernblot 和 ATAC-seq 分别检测 Actg1、Actg2 的 mRNA 及前体 mRNA 表达水平、ACTG1 蛋白水平以及染色质可及性变化。细胞计数采用美国 Orflo Technologies 的Moxi Z 库尔特流式细胞计数仪，用于 ATAC-seq 文库制备前的细胞准确计数。

结果显示，三种 RNA 去稳定化方式均能有效降解 Actg1 mRNA 并上调 Actg2 表达。Cas9 诱导的突变细胞中 Actg2 位点染色质可及性增加，而 Cas13d 切割和核酶切割细胞中未见此变化，表明染色质重塑并非 Actg2 上调的必要条件。这些结果证实了 RNA 去稳定化事件本身即可触发转录适应反应。

本研究揭示了 RNA 去稳定化事件本身即可触发转录适应或转录适应样反应，拓展了对转录适应触发机制的理解。

原文链接：https://doi.org/10.1038/s44319-025-00427-3

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