森西赛智科技作为生命科学工具一站式解决方案服务商,专注生命科学仪器领域多年,拥有20多年技术积累和丰富的产品应用案例,吸引了众多嘉宾前来交流咨询。期待将更多、更好的产品和技术介绍给各位专家、学者!
图2. 森西赛智产品展示。
Vizgen中国区总经理张晓亮先生做了精彩的专题报告,报告题目:超高分辨原位单细胞空间转录组技术MERFISH 2.0简介与应用进展,从技术和应用角度出发,介绍了新一代单细胞空转平台MERSCOPE UltraTM和新开发的MERFISH 2.0TM空转技术,此前沿新技术可显著提高MERFISH在各种样本中,特别是在RNA质量较低的FFPE组织样本中的检测灵敏度,重塑空间生物学研究图景!我们期待将更多、更好的产品和技术介绍给各位专家、学者,共同推进空间生物学发展!
一、什么是MERFISH技术?
美国Vizgen公司的MERFISH“Multiflexed Error Robust Fluorescence In-Situ Hybridization(多重抗误差荧光原位杂交)”技术,结合smFISH(单分子荧光原位杂交技术)和亚细胞成像的优势,通过使用组合标记、序列成像和抗误差的条形码编码技术来扩展smFISH的功能,从而大幅提高了多重检测能力,能够实现真正意义上基因可视化的原位单细胞空间转录组学分析,为研究人员开启了了解每个细胞内转录组组成与分布的窗口。
MERFISH技术诞生于美国哈佛大学庄小威院士实验室,于2015年首次发表,此后已累计发表了300多篇经过同行评审的文章,每年都有更多令人兴奋的发现。凭借可靠、有价值的数据集以及值得信赖的数据质量,该技术让科学家对空间基因组学分析充满信心,从而推动生物学研究。
二、新一代MERFISH 2.0技术
新一代的MERFISH 2.0设计,以及其优化的样本制备工作流程可以极大地提高样本中的转录本的检测灵敏度,大幅度提升RNA质量较低的,如保存年限较长的FFPE组织样本中的RNA的检测效率和灵敏度!
MERFISH 2.0工作流程引入了:
(1)改进RNA锚定方式以确保RNA片段的共定位,这对于维持转录本的完整性以及探针的可及性至关重要;
(2)优化编码探针结合以最大程度提高目标位点的占有率,从而增加读出探针结合的概率;
(3)增加和每个编码探针结合的读出探针数量,显著增强荧光信号,针对性增加信噪比。
三、MERSCOPE Ultra分析系统
基于MERFISH 2.0技术的MERSCOPE Ultra“大视野超高分辨单细胞原位空间组学分析系统”具有高通量多重检测能力、高细胞处理通量、支持样本类型灵活、检测灵敏度高和空间分辨率高等优点。
MERSCOPE系列为肿瘤学、免疫学、神经科学、发育生物学、植物学、传染病、细胞和基因治疗等领域基于组织的基础研究和医学转化提供了变革性的视角,也是加速药物发现和开发的重要工具。
MERSCOPE的技术特点:
空间分辨率极高:单分子分辨率<50nm,在亚细胞水平上定位RNA转录本;
灵敏度高:能检测到其它方法(单细胞测序等)检测不到的低表达基因;
成像面积大、更快的分析速度:MERSCOPE Ultra:成像面积≥3.0cm2;
高度多重:同一切片上同时检测上千重基因与多个蛋白;MERFISH 2.0 技术适合长期保存/低质量的FFPE样本;
开放性与灵活性良好:针对课题可以灵活自主选择所需基因,专用平台高效设计基因panel。
四、PRIMO定制化细胞微环境制备系统
法国Alvéole公司的PRIMO“定制化细胞微环境制备系统”,它是创新性定制细胞模型的工具,能在微米级别的尺度下,用非接触、无掩膜的光学蚀刻方法制备细胞模型、以具有超高灵活度和再现性的生物工程手段实现体外微环境的定制,同时可对其机械力学和生化特性进行设计微调,具有高度的灵活性、可控性和可重复性。选择电脑中任意一张图案,PRIMO都能将它投射到细胞培养基质上,利用非接触式、无掩模的光刻技术,在软件和光敏试剂的帮助下获得任意图案的2D蛋白涂层或3D水凝胶或微流控结构,可用于2D微图案化、3D细胞球构建、3D水凝胶构建和类器官芯片构建,可广泛应用于类器官的研究。
PRIMO有三种设计方法:
(1)第一种设计:微图案建构(Micropatterning)。
先在基质上包裹一层防污涂层(antifouling layer),阻碍蛋白质粘附。选择电脑中任意一张图案,在LEONARDO软件作用下,PRIMO都能利用非接触式、无掩模的光刻技术,用UV光将它投射到细胞基质上,在PLPP光敏引发剂帮助下,防污涂层被降解,蚀刻出微图案,蛋白可粘附在蚀刻出的微图案上,细胞粘附在蛋白上,可适应于基质上定制的生物化学、表面形貌和硬度等特征,形成定制的细胞模型。适用于细胞微环境研究。
(2)第二种设计:水凝胶建构(Hydrogel Structuration)。
在氧气不足的条件下,UV光照射,可使水凝胶固化;水凝胶固化的高度随UV照射强度增加而增加。结合UV-图像照射和气体可渗透的微反应器,可获得4种水凝胶的工程方法:完全多聚化(total polymerization)、Z轴控制的多聚化(z-controlled polymerization)、光剪切(photo-scission)和修饰(decoration)。单独应用或结合应用就可以解决水凝胶工程化问题。适用于3D细胞培养和类器官制备。
(3)第三种设计:微流道建构(Microfabrication)。
用UV光固化感光树脂/光刻胶(photoresist),再用PDMS(聚二甲硅氧烷)在固化的photoresist上倒模,形成带有微结构的PDMS芯片。适用于制造微流控芯片和类器官芯片。
图14. 微流道建构(Microfabrication)示意图。
五、PRIMO应用领域
(1)2D微图案建构应用:研究血管化类器官、细胞迁移/趋触性、细胞黏附、细胞分裂、细胞极性、生物力学、2D细胞标准化培养、冷冻电镜的标准化细胞制备等;
(2)3D水凝胶建构应用:研究类器官、3D细胞标准化培养、肿瘤球培养等;
(3)3D微流道建构应用:研究微流控芯片、类器官芯片、细胞共培养、组织工程等。
六、关于森西赛智科技
森西赛智(北京/上海/广州/成都)拥有超过20年的生命科学和生物技术领域的自主研发和国际品牌代理经验,专注于国内整合和推进全球产品进入中国的研发市场,产品线覆盖分子、蛋白、细胞、组织、小动物、生物工艺和自动化等领域。森西赛智在全国各主要城市都有销售或售后服务网点,相关工作人员均接受原厂培训,具有雄厚的技术支持基础,可以为客户提供专业周到的服务。自成立以来,“森西赛智科技有限公司”已为5300+客户提供优质的产品和服务。
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