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PEAKS Online 13蛋白质组学分析平台新版本发布

2026-01-09     来源:本站     点击次数:79

PEAKS®Online是Bioinformatics Solutions Inc. (BSI)专门为高通量蛋白质组学设计的分析平台,具有超高的计算性能,并由深度学习赋能,为超大规模的DDADIA和蛋白质学分析提供支持。

PEAKS® Online 13 重构DDA与DIA分析流,通过算法优化实现了工作流的简化与易用性的提升。借助用户界面的升级、数据与系统稳定性的提升,简化参数设置,助力用户将蛋白质组学分析提升至全新高度!


 
PEAKS® Online 13 新版本升级
01.架构全面升级重构
所有界面重新设计,系统稳定性显著增强,项目管理功能优化,工作流及参数选择大幅简化,为用户提供更加友好、高效的分析体验。


02.结果透明化呈现
新增的特征峰(Feature)列表,可与de novo only等其他Tab结合,查看每个鉴定序列对应的所有MS1特征峰关联信息,方便用户对鉴定结果进行校验与确认。


03.提升 DIA 性能,实现深度挖掘
DIA数据库搜索速度显著提升,蛋白质组鉴定结果更加精准。为突破传统蛋白质组学局限,PEAKS率先推出支持序列变异鉴定的DIA从头测序算法,助力实现更深层的生物学发现。


 04. 自定义非标记定量
用户可深入分析样本间的肽段/蛋白丰度差异。升级后的DDA Proteome workflow中,通过PEAKS PTM和SPIDER发现的未知修饰和突变肽段也可参与LFQ定量。
结果可视化新增样本相关性散点图和密度比率图。DIA蛋白质定量方法可灵活选择,可选择基于前3条独特肽段或所有独特肽段的MaxLFQ算法进行计算。归一化策略新增保留时间依赖型(RT Dependent)和全局型(Global)两种选项。

05. 优化DDA 和 DIA DeepNovo 多肽组分析流
DDA DeepNovo Peptidome workflow中的Gene Tab展示鉴定的多肽与基因的匹配关系,弥合了蛋白质组学与基因组学的研究鸿沟。
DIA DeepNovo Peptidome workflow在准确性与速度方面均进行了优化,现支持用户自定义“候选列表”,形式可选择谱图库(Spectral Library)或包含样本中预期存在肽段的肽段列表(Peptide List)。
此外,结果中新增了蛋白质列表展示,便于多肽与蛋白对应。


 


作为生物信息学的领军企业,BSI专注于蛋白质组学和生物药领域,通过机器学习和先进算法提供世界领先的质谱数据分析软件和蛋白质组学服务解决方案,以推进生物学研究和药物发现。我们通过基于AI的计算方案,为您提供对蛋白质组学、基因组学和医学的卓越洞见。旗下著名的PEAKS®️系列软件在全世界拥有数千家学术和工业用户,包括:PEAKS®️ Studio,PEAKS®️ Online,PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB,ProteoformXTM ,DeepImmu®️免疫肽组发现服务和抗体综合表征服务等。
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