近日，BSI发布ProteoformX^TM，ProteoformX^TM是一款功能强大且用户友好的软件平台，采用MAM策略，支持从蛋白质组学研究到生物药分析等各种proteoform层面的分析任务。软件提供集成的分析工作流程，符合CFR法规要求，可在各类临床及生物制药应用场景中保障数据完整性与安全性，并满足合规审计的要求。

 New Peak Detection 模块可对含有非天然氨基酸(UAA）/非天然核苷酸(UN)、具有环状结构和/或支链结构的分子进行鉴定与定量分析。并对生物药代谢产物、产品相关杂质及分子水平的变化进行追踪监测，通过人工校验完美适配药物研发工作流。
 

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• 复杂多肽分子精准鉴定与定量

支持自定义非天然氨基酸（UAA）/非天然核苷酸(UN)，兼容线性、支链、环状肽结构；提供支链位点、二硫键开环位点、环肽裂解碎片专属 MS2注释，突破传统质谱仅支持经典氨基酸、线性肽的分析局限。

• 生物药代谢动态变化全程追踪

精准监测生物药代谢产物、产品相关杂质及分子水平变化，跨样本定量追踪分子含量变化趋势，实现复杂多肽类生物药的全流程精准分析与表征。

• 人工核验与结果报告输出

内置质量验证工具，可计算不同裂解位点理论分子量，快速校验序列输入准确性；支持特征峰手动编辑，修正自动检测的遗漏/误判，高灵敏度识别并捕获低丰度降解产物的微弱信号，保障质控数据精准可信。通过产物分子特征碎片离子（Confirmation Ion）提供目标分子鉴定谱图证据。

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01-对含有非天然氨基酸(UAA)/非天然核苷酸(UN)的具有环状和/或支链结构的多肽分子表征分析

• 可自定义非天然氨基酸（UAA）与非天然核苷酸（UN），完成非经典残基序列及质量匹配，突破经典氨基酸分析限制；
• 支持线性、支链、环状肽全结构解析，提供环肽线性化输入语法；
• 为支链位点、二硫键开环位点、环肽裂解碎片提供专属 MS2 注释；
• 结合 MS1与 MS2 数据实现精准定性定量，高效表征复杂多肽类生物药。

02-生物药代谢物/杂质分子水平上的变化监测

• 支持多时间点样本批量分析，自动生成完整肽段、降解产物、相关杂质的丰度变化趋势，直观呈现分子降解与变化规律；
• 依托软件内置算法精准识别新增特征峰，有效规避降解产物浓度偏低、峰形干扰、基质效应导致的特征峰漏检；
• 内置保留时间偏移校准功能，完成批量样本特征峰自动对齐，保障跨样本定量数据一致性；
• 定向追踪药物主成分、关键修饰肽、相关杂质的含量波动，为药物稳定性与安全性评估提供可靠数据支撑。

03-人工核验与结果报告输出

• 软件提供自动化质量验证，内置理论分子量计算工具，一键校验序列输入准确性，自动生成不同裂解位点的理论质量值，规避分析误差。

   

• 自动特征峰检测可能因降解产物浓度偏低、峰形拟合偏差或基质效应等因素，遗漏部分特征峰信号。特征峰编辑功能专为解决此类问题而设计，支持用户在目标谱图中，对检测有误或此前未被识别的特征峰进行手动精准选取与定义。点击特征峰编辑按钮，即可进入手动调整特征峰的操作界面。

 
软件支持基于特征峰检测结果，MS2谱图注释和碎片离子质量理论值计算的结果核验，搭配特征峰手动编辑功能修正自动检测偏差，保障结果报告的准确性。添加自定义 Confirmation Ion 用于补充软件自动鉴定的结果，辅助人工复核，进一步提升鉴定结果的可信度。同时软件符合生物制药CFR法规要求，可直接用于研发申报与质控归档。

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作为生物信息学的领军企业，BSI专注于蛋白质组学和生物药领域，通过机器学习和先进算法提供世界领先的质谱数据分析软件和蛋白质组学服务解决方案，以推进生物学研究和药物发现。我们通过基于AI的计算方案，为您提供对蛋白质组学、基因组学和医学的卓越洞见。旗下著名的PEAKS^®️系列软件在全世界拥有数千家学术和工业用户，包括：PEAKS^®️Studio，PEAKS^®️Online，PEAKS^®️GlycanFinder, PEAKS^®️AB，ProteoformX^TM,DeepImmu^®️免疫肽组发现服务和抗体综合表征服务等。