PEAKS GlycanFinder 3.5全新迭代!
近日,PEAKS GlycanFinder 3.5新版本发布,本次版本升级增加多项强大的新功能,工作流也进行了全面优化,助力您的糖基化研究再上新台阶。

聚糖从头测序辅助数据库搜索
PEAKS® GlycanFinder 独有的聚糖从头测序辅助数据库搜索(Glycan De Novo Assisted Database Search)工作流,将聚糖从头测序与糖肽数据库搜索深度整合,在大幅提升糖肽鉴定灵敏度的同时,可发掘数据库未收录的全新糖肽。
该流程通过两种独立方法对每一张二级质谱谱图进行双重评估,既提升了鉴定结果的置信度,也拓展了糖蛋白质组的覆盖深度,同时支持基于糖组成与糖链结构的两种解析模式。


聚糖从头测序
全新的聚糖从头测序(Glycan De Novo)工作流可直接解析完整糖肽,并利用肽段骨架测序和聚糖测序,实现未知蛋白序列与未知聚糖的发现。
示例中展示了通过该功能鉴定到的一个数据库中未包含的全新糖链。

糖基化肽组学分析
这是一套 PEAKS® GlycanFinder 专有的特色分析工作流:无需任何聚糖数据库,即可实现HLA肽段中未知糖表达谱的全面表征。
针对一项乳腺癌细胞系doxorubicin耐药性研究的数据,使用PEAKS® GlycanFinder 进行重分析,结果中验证了该N-糖基化的肽的鉴定,该肽可能作为耐药性研究的潜在生物标志物。

InChorus:跨搜索引擎共识结果
升级后的 InChorus 功能可整合多个聚糖搜索引擎的结果,同时高亮展示多搜索引擎共识鉴定与单搜索引擎独有发现的糖肽。
该工具可提取外部搜索引擎输出结果中的糖肽谱图匹配(GlycoPSM)数据,可视化展示每个肽谱匹配(PSM)在谱图层面的重叠情况,并提供一个共识评分,用于衡量糖肽-谱图匹配结果在多搜索引擎间的一致性与置信度。
