
(二)样本前处理:FFPE 和 FF 两套手册,参数千万别混
官方分别发布了 FFPE 手册 和 FF 手册。最容易出错的地方先划重点:

质检三类方法,官方强烈推荐在实验前做:
▪DV200:评估 RNA 完整性,DV200 < 30% 与低转录本密度相关
▪DAPI 染色:评估细胞核质量(是成功预测指标,但非绝对保证)
▪H&E 染色:观察组织损伤与伪影
质检必须做在不用于正式实验的连续切片上。
(三)实验设计阶段:帮你把钱花在刀刃上
玻片选择(用户问得最多,最关心)
官方测试了 4 款推荐玻片,但明确说明:

前两款性能基本相同,选货期好的那个即可。它们特别推荐用于:结缔组织多的组织(如乳腺、结肠)、纤维化组织、高脱片风险组织,以及既往在 Atera 或 Xenium 上出现脱片的组织。
还有 5 款玻片被明确列为不推荐(Matsunami TOMO、MutoPureChemicals Micro Slides、Trajan Series 2、CitoTest PCl、StatLab Millenia Command),原因集中在脱片和刻蚀纹路干扰卡夹密封两类。
玻片通用兼容要求(4 条硬指标):尺寸必须为 75.4 ± 0.5 × 25.2 ± 0.4 × 1.05 ± 0.10 mm、表面高粘附且亲水、无干扰密封的标签或刻蚀、无切角。官方特别说明:任何未经 10x 测试的玻片,一律归为"不推荐"。
以上内容依据官方文件整理,正式实验前请结合具体项目说明和样本实际情况进行确认。
号外号外
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