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罗氏 GS Junior 测序平台用于动物保护研究

2012-03-09     来源:本站     点击次数:2137

GS Junior测序平台用于动物保护研究
 
罗氏新近与美国一国家动物园进行合作,将
Roche GS Junior测序系统投入到隶属该动物园的动物保护及进化遗传学中心的研究工作中。该中心将依靠二代测序平台的高深度DNA测序能力,开展新的动物的疾病耐受性、群体遗传学、 分子生态学研究。
 
该动物保护生物研究所研究重点在于深入了解物种、保护物种、培养物种保护学家,尤其在动物生态研究及管理、动物健康及繁殖领域有所专长。研究人员将利用GS  Junior测序系统对于威胁动物繁衍的危险致病原进行研究,项目内容包括:
  • 获得Chytrid Fungus的基因组图谱,这一致死性真菌在全球范围内造成大量两栖类动物死亡
  • 完成大象EEHV1(elephant endotheliotropic herpes virus)高致病性病毒株的测序
  • 绘制扩散迅速的鸟疟(avian malaria)病毒的基因组图谱,是夏威夷鸟类的死亡原因之一
GS Junior通量非常合适微生物基因组的研究,因此正适合上述项目的开展,而其长读长的优势能很好的分辨高度变异的病毒、细菌基因组,对于病原体检测以及病毒或细菌的比较基因组研究都非常重要。合作双方希望通过这些项目将二代测序的巨大潜力引入到更多研究及保护地球各个物种的领域中,为保护生态体系做出贡献。
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