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第一天 9:00-17:00 主题:小分子药物设计
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08:00 - 08:50
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签到 | 安装软件
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08:50 - 09:00
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主办方致辞
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09:00 - 10:15
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MOE基础介绍
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A.MOE窗口介绍;
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B.利用MOE获得和保存数据;
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C.MOE数据库介绍和化学信息学;
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D.小分子化合物的构象搜索;
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10:15 - 10:30
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茶歇 | 交流
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10:30 - 12:00
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药物设计中的药效团建模
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A.在MOE中构建药效团模型;
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B.在药物设计中使用药效团;
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12:00 - 13:30
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午餐 | 休息| 海报交流
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13:30 - 14:15
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蛋白结构预处理
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A.蛋白结晶结构修正、质子化;
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B.结晶水处理;
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14:15 - 15:15
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基于结构的药物设计
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A.分子对接;
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B.抗糖尿病药物阿格列汀的全新药物设计;
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15:15 - 15:30
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茶歇 | 交流
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15:30 - 16:00
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激酶应用
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16:00 - 17:00
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基于片段的药物设计
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A.骨架替换;
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B.片段连接;
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C.片段生长;
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D.BREED;
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17:00 - 17:30
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AutoGPA----MOE中的3D QSAR
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第二天 9:00-17:00 主题:蛋白建模及生物药设计
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9:00 - 10:15
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蛋白比对、叠合及相似结构搜索
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A.处理PDB文件;
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B.处理蛋白构象;
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C.基于保守区域的蛋白叠合;
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D.基于结合口袋叠合蛋白;
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E.基于配体叠合蛋白;
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F.蛋白相似结构域搜索;
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10:15 - 10:30
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茶歇 | 交流
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10:30 - 12:00
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蛋白同源建模
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A.普通同源建模
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B.GPCR建模
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12:00 - 13:30
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午餐 | 休息 | 海报交流
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13:30 - 15:15
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抗体建模及设计
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A.抗体结构概览
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B.抗体建模
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C.互补决定区Loop构象采样
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D.经典保守残基分析
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15:15 - 15:30
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茶歇 | 休息
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15:30 - 17:00
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蛋白设计
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A.丙氨酸扫描
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B.二硫键扫描
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C.抗药性突变扫描
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D.序列设计
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E.蛋白沉聚性质分析
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F.蛋白属性计算
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第三天 9:00 - 17:00 定制开发、批量流程化及动力学模拟
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9:00 - 10:45
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SVL语言及开发范例介绍
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10:45 - 11:00
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茶歇 | 交流
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11:00 - 12:00
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SVL语言及开发范例介绍
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12:00 - 13:30
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午餐 | 休息 | 海报交流
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13:30 - 15:00
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MOE在KNIME环境下的工作流构建
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15:00 - 15:15
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茶歇 | 休息
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15:15 - 17:00
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动力学模拟
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