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转录组研究策略及RNA-seq数据分析6月专题培训班通知

2014-06-05     来源:本站     点击次数:3685

转录组研究策略及RNA-seq数据分析专题强化培训班
2014年6月15日-20日,中国·青岛 
 
转录组研究策略及RNA-seq数据分析专题强化培训班将于2014年06月15日-20日在青岛大学国际学术交流中心举办。本期培训班以第二代测序、第三代测序(单分子测序)在转录组学中的应用与RNA-seq数据分析为主题,精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程。理论课程由担任国家973计划(转录组方向)首席科学家、国家自然科学基金重点专项负责人于军、胡松年等多位研究员亲自授课,上机课程由实践经验丰富的一线科研人员带领学员亲自实践RNA-seq数据分析流程。本班因老师时间的问题一年只举办一次,欢迎各领域广大科研工作者和高校教师及研究生积极报名参加!
 
主办单位
北京路思达生物信息科技有限公司 
上海玮瑜生物科技有限公司
 
承办单位
上海陈珖文化传播有限公司
 
培训时间:2014年6月15日至20日(6月15日报到)
培训地点:青岛大学国际学术交流中心
 
 
课程安排                                                                      
时间
课程内容
学时
讲师
06月15日(周日)
全天
报到、注册
 
 
06月16日(周一)
9:00-12:00
转录组学发展前沿、科研思路及技术路线
3h
于军
06月16日(周一)
13:30~16:30
动物转录组项目研究讲解
3h
于军
06月17日(周二)
9:00-12:00
二代测序、三代测序在转录组学研究中的应用
3h
胡松年
06月17日(周二)
13:30~16:30
植物转录组、微生物转录组项目研究讲解
3h
胡松年
 
06月18日(周三)
9:00-12:00
二/三代测序仪原理介绍
转录组建库实验流程详解(包括文库选择,测序文库构建注意事项)
测序文库试剂的选择和使用心得等
3h
中科院专家
06月18日(周三)
13:30~16:30
转录组数据分析概述与经验交流
(1)介绍转录组数据分析的整体流程:包括de novo转录组分析、有基因组reference的转录组分析、microRNA分析等。
(2)转录组分析经验交流:包括测序量如何选择;测序质量如何评估;如何根据自己的实际情况选择mapping/denovo assembly软件;如何从转录组数据寻找生物学问题。
Linux常用基本命令
R语言应用简介
3h(上机)
中科院专家
06月19日(周四)
9:00-12:00
转录组denovo(无参考序列)测序数据拼接及分析:
利用trinity实现转录组denovo组装,并进行预测蛋白序列、筛选差异基因及计算表达量等功能分析的讲解。
3h(上机)
中科院专家
06月19日(周四)
13:30~16:30
基于二代RNA-seq的差异基因分析(参照序列):
主要利用tophat和cufflinks,cuffdiff以及cummeRbund 等工具,实现reads的mapping, 转录本的重构,转录本的表达量计算,差异基因分析以及利用cummeRbund图形化展示cuffdiff的分析结果。GO、KEGG富集等功能分析。
3h(上机)
中科院专家
06月20日(周五)
9:00-12:00
miRNA二代测序数据分析
1. miRNA数据mapping的原理介绍及软件使用
2. 靶基因预测原理介绍及软件使用
3. miRNA数据库介绍及使用
4. miRNA的功能分析
3h(上机)
中科院专家
 
相关事项:
A:注册费                                                                         
3600元/人(含培训费、上机费、电子版资料费,培训结束后免费赠送价值1600元的生物信息云平台使用权限(免费开放2周,培训后可继续进行巩固练习))。
 
优惠政策:
1.5月28日前汇款,注册费可优惠至3400元/人。
2.同一单位三人及以上同时报名注册费优惠至:3300元/人。
3.以上两种优惠不可同时使用。
 
外地学员住宿统一安排在青岛大学国际学术交流中心,住宿费用自理。酒店标准间价格:300元/间/天,与其他学员合住标准间价格:150元/间/天,合住按报到先后顺序安排,最后出现单数无法安排情况房间差价费用自理。
6月16日至6月20日会务组为学员提供免费工作午餐,培训期间早餐及晚餐自理。  
 
B:付款信息(电汇或转账)                                                        
账户名称:北京路思达生物信息科技有限公司
账户号:321230100100073558
开户行:兴业银行海淀支行
转账或者汇款时请仔细核对账户名称及账号,并在汇款用途处注明:姓名
 
C:联系方式                                                                        
金老师
TEL: 15021364017
E-mail:zdyy620@163.com  QQ:348280957
名额有限,按学员付款先后顺序安排上课及上机位置。上机实践需自带笔记本电脑,电脑对系统及配置无特殊要求。
 
报名表点此下载
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