单细胞转录组测序及生信分析培训班报名通知
2019-05-23 来源:本站 点击次数:5925
单细胞测序技术近年屡次被评为生物科研热点，文献发表也呈现迅猛增长趋势。Nature期刊最近评出2019年最值得期待的7项生物技术，扩展单细胞生物学（Expand single-cell biology）位列其中之一。SBC引进的10x Genomics Chromium™平台，基于GemCode™微流控技术进行单个细胞分选，可一次性获得大量单细胞的基因表达数据，从而达到在单细胞水平进行表达测序的目的。
为帮助科研工作者深入了解单细胞测序技术，SBC兹定于2019年6月28-29日在上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心举办单细胞转录组测序及生信分析培训班。希望通过此次培训让学员全面了解单细胞测序技术的实验原理、应用，并上机模拟操作Demo数据的生信分析等。诚邀报名参加，本次培训班实行小班制（限额20人，报满截止）。
主办单位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心
培训日期：2019年6月28日-29日
培训地点：上海市浦东新区张江高科技园区李冰路151号1号楼
培训地点：上海市浦东新区张江高科技园区李冰路151号1号楼
一、日程安排：
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时间 |
主题 |
课程内容 |
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6月28日 |
单细胞测序技术介绍 |
单细胞测序技术的发展及10Xgenomic单细胞测序原理介绍 |
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样本准备 |
单细胞样本准备及常见问题 | |
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Demo实验 | ||
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R语言基础 |
R基本概念：向量、数组和矩阵、函数；R从文件读取数据、根据需要编辑、转换数据结构；文件图表等的生成导出 | |
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10X单细胞转录组分析流程及原理介绍 |
Cellranger运行环境、服务器配置，如何从fastq生成表达矩阵等系列结果；Seurat的使用、算法解析等 | |
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10X单细胞转录组分析上机操作 |
在R交互环境运行Seurat、向量准备、画图函数使用、数据结构解剖处理等；R画图包括PCA、tSNE、VlnPlot、PCHeatmap等 | |
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6月29日 |
单细胞转录组结果报告解读 |
单细胞转录组结果报告解读 |
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10X单细胞ATAC-seq分析流程及原理介绍 |
cellranger-atac运行、运行过程中使用算法介绍及结果解读 | |
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10X单细胞ATAC-seq分析上机操作 |
Loupe Cell Browser软件运行、ChIPseeker对peaks结果注释、Cicero介绍 | |
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单细胞高级分析 |
Monocle的原理算法介绍；
高分文章案例数据集作图：拟时序、谱系分析等 | |
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单细胞测序技术的应用与实验设计思路解析 |
单细胞测序技术的应用与实验设计思路解析 |
二、费用及优惠：
1、培训费用：2000元/人，包含培训费、资料费、培训期间午餐费。
2、报名优惠：
· 所产生的培训费用可在后续订购SBC服务产品时抵扣等额的合同款项（每份服务合同只能抵扣一人培训费用），有效期至2019年12月31日为止。
· 团体报名（同一单位2人及以上）享受9折优惠价。
· 以上2项优惠条件可同时享受。
3、其他说明
· 以汇款凭证(截图、扫描件)或实际到款为成功报名
· 学员需自己携带笔记本电脑参加上机课程（电脑配置及软件要求：报名成功后通知）。
· 早晚餐、交通及住宿费用等请自理。
三、报名方式：
四、汇款信息：（汇款时请注明：培训班+姓名）
名称：上海生物芯片有限公司
开户行：中国银行上海浦东分行
账号：4572 5921 5312
五、报名咨询：
上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心
2019年5月21日
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