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单细胞测序分析及单细胞转录组上机实训培训班通知

2019-07-09     来源:本站     点击次数:11185

 
各有关单位:
随着新一代单细胞测序技术的快速发展，在准确度大大提高的前提下, 进一步降低测序成本。由此不断产生出巨量的分子生物学数据，这些数据有着数量巨大、关系复杂的特点，以至于不利用计算机根本无法实现数据的存储和分析。随着生物信息学作为新兴学科迅速蓬勃发展，正在改变人们研究生物医学的传统方式，单细胞技术以及数据分析技术已成为探索生物学底层机制和研究人类复杂疾病诊断、治疗及预后的重要工具，广泛应用于生命科学各个领域，是21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国生物信息学特别是单细胞测序的发展，提高从业人员的技术水平，由中科成创（北京）生物技术有限公司举办“单细胞测序分析及单细胞转录组上机实训”培训班具体事宜通知如下：
 
一、培训目标及特点：
本培训以单细胞测序技术的应用与数据分析、单细胞转录组为主题，精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员。学员通过与专家直接交流，能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路，在研究技术方面领悟更多。
二、培训对象：
大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员；生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。
三、时间地点：2019年8月16日——8月19日    山东青岛（时间安排：第1天报到，授课3天）
四丶培训内容：
 
单细胞测序技术与应用
1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。
2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。
3. 近年单细胞方向高分文章思路解析。
4. 单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍。
 
 
Linux及R语言入门与实操
1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。
2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。
3. R语言语法介绍及常用命令。
4. 数据处理功能及统计应用。
5. R语言画图实操。
 
 
单细胞转录组数据分析思路及流程
 
1. 单细胞实验处理、建库及测序。
2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等分析思路。
3. 单细胞转录组转录因子及功能通路解析。
4. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物、微生物等领域的研究内容及思路。
 
 
 
单细胞转录组数据分析实操
 
1. 常规单细胞组学数据比对。
2. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。
3. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。
4. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。
5. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。
6. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。
多组学整合分析和结果解读
1. 转录组，基因组，表观分析介绍。
2. RNA和 ATAC-seq等多组学整合分析。
3. 常规10X单细胞ATAC数据测序原理简介、分析流程介绍。
4. 单细胞免疫组库测序技术及应用。
5. 组学分析常用数据库介绍及使用。
 
单细胞转录组轨迹、通路、转录因子等分析及绘图实操
 
1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。
2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。
3. 通过SCENIC软件进行转录因子预测分析。
4. tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。
五、报名办法及费用： 
每人￥3980元（含报名费、培训费、资料费、证书费）
团队报名：4+1优惠。（5位其中1位免除费用）
所报名参加学员赠送一个8G U盘（内含上课所有使用软件与课件资料）
食宿可统一安排，费用自理。各单位人员报名参加，报名回执表请回传至会务处即可。
如单位有内训需求，请将内训方案传至会务组，根据单位需求安排相应专家进行授课
六、颁发证书：
参加本次培训通过考试审核可获得《生物信息工程师》结业证书。报道时携带两张蓝底1寸照片，一张身份证复印件交给现场会务老师。
 
七、 联系方式：                                 
联系人：张琦   177 4456 9660                               
报名邮箱：zkcc_BIS@vip.163.com    
 
中科成创（北京）生物技术有限公司
二零一九年七月二日
 
参考附件：报名回执表.doc 
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