SBC单细胞转录组测序及生信分析培训班报名通知
2019-09-27 来源:本站 点击次数:11712
自今年6月第一期单细胞转录组测序及生信分析培训班成功举办以来，陆续收到新用户询问单细胞测序的培训课程，结合第一期学员的反馈和建议，SBC兹定于2019年10月24日-26日再次举办第二期进阶版的单细胞转录组测序及生信分析培训班。针对学员们的不同需求，本次培训班为期三天，包含基础课程（第1天）及进阶课程（第2-3天）两部分。
课程内容涵盖10Xgenomic单细胞测序原理、样本准备、分析流程及原理、R语言基础、高级分析以及实验设计策略等。本次培训班特别邀请到上海交通大学系统生物医学研究院副研究员邹欣博士在第三天的课程中授课。
诚挚邀请各位老师报名参加，本次培训班实行小班制（限额20人）。
主办单位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心
培训日期：2019年10月24日-26日
培训地点：上海市浦东新区张江高科技园区李冰路151号1号楼
培训地点：上海市浦东新区张江高科技园区李冰路151号1号楼
一、 日程安排（暂定）
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日期 |
时间 |
主题 |
课程内容 |
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10月24日
第一天 |
08:45-09:00 |
签到、领取资料 | |
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09:00-09:10 |
开课致辞 | ||
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09:10-10:00 |
非编码RNA研究概述及数据解读 | ||
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10:00-11:00 |
R语言基础 |
基本概念：向量、数组和矩阵、函数；数据导入、编辑、数据结构转换；文件图表生成、导出 | |
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11:10-11:40 |
R语言进阶：统计检验，差异基因计算 | ||
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13:00-14:00 |
ggplot2详解（柱状图、饼图、boxplot、小提琴图、密度曲线图，散点图，差异基因可视化（火山图）等） | ||
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14:00-14:40 |
如何画非常牛的hclust层次聚类图 | ||
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15:00-15:30 |
heatmap详解&韦恩图详解 | ||
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15:40-16:40 |
GEO数据库详解及常用文章绘图（误差线图、生存曲线图、jitterplot） | ||
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10月25日
第二天 |
08:45-09:00 |
签到、领取资料 | |
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09:00-09:10 |
开课致辞 | ||
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09:10-09:55 |
单细胞测序介绍 |
单细胞测序技术的发展及10Xgenomic单细胞测序原理介绍 | |
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10:00-10:30 |
样本准备
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单细胞样本准备及常见问题 | |
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10:40-11:30 |
Demo实验 | ||
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13:10-13:40 |
10X单细胞转录组分析原理及流程介绍 | ||
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13:45-14:00 |
10XGenomoics 单细胞转录组数据分析介绍与上机实操 |
Cellranger运行环境、服务器配置，如何从fastq生成表达矩阵等系列结果; Loupe Cell Browser软件使用 | |
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14:05-15:40 |
单细胞转录组数据多样本比较分析介绍与上机实操 |
使用Seurat进行全套单细胞转录组数据分析演练：常见7类分析图：DimPlot_Integret、DotPlot、FeaturePlot整合图等的代码解析 | |
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15:45-16:15 |
单细胞转录组结果报告解读 | ||
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16:20-17:00 |
10X单细胞ATAC-seq分析流程及原理介绍 |
CellRanger-ATAC运行、运行过程中使用算法介绍及结果解读； Loupe Cell Browser软件运行、ChIPseeker对peaks结果注释、Cicero介绍 | |
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10月26日
第三天 |
09:00-09:40 |
单细胞ATAC结果报告解读 | |
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09:55-11:30 |
单细胞数据中的噪声干扰以及解决方案
特邀嘉宾：上海交通大学副研究员邹欣博士 | ||
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13:00-14:00 |
高级分析案例分析；流程演练+实操过程答疑 |
1、Monocle的原理算法介绍；2、高分文章案例数据集作图：拟时序分析等 | |
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14:10-15:00 |
单细胞RNA测序数据的聚类工具比较介绍 |
聚类方法比较（包括Seurat、Cell Ranger、SC3、ascend、RaceID） | |
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15:30-16:30 |
单细胞测序技术的应用与实验设计思路解析 | ||
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16:30-16:40 |
颁发证书、合影 | ||
二、费用及优惠
1、培训费用：
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培训课程 |
课程时间 |
培训费 |
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基础班 |
10月24日（共1天） |
1000元/人 |
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进阶班 |
10月25日-26日（共2天） |
2000元/人 |
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实战班 |
10月24日-26日（共3天） |
2800元/人 |
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注：以上费用包含培训费、资料费、培训期间午餐费。 | ||
2、报名优惠：
· 所产生的培训费用可在后续订购SBC服务产品时抵扣等额的合同款项（每份服务合同只能抵扣一人次），有效期至2020年3月31日为止。
· 团体报名（同一单位2人及以上）享受9折优惠价。
· 以上2项优惠条件可同时享受。
三、报名方式：
点击此处立即报名，或扫码报名，本次培训班限额20名，报名截止日期至2019年10月17日，报满将提前截止。
四、交通信息
培训地点：上海市李冰路151号1号楼
交通线路：地铁2号线金科路站或张江高科站换乘公交1090路、1113路李冰路爱迪生路站
五、报名咨询：
咨询电话：400-100-2131（周一至周五9:00-17:00）；138 1640 6711
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