免费注册10x中国线上用户会，赢生信云分析福卡！
2021-12-10 来源:怡美通德公众号 点击次数:2797
值得注意的是，国内科研学者使用10x Genomics技术也已经发表了300余篇高分文章。单细胞及空间多组学技术在科研及临床转化领域得到了广泛应用，中国科研人员使用10x单细胞及空间多组学产品在肿瘤、免疫、新冠等不同领域如何应用，10x公司明年又将带来哪些新产品，2021年10x Genomics中国单细胞及空间多组学用户峰会开幕在即，一年一度的学术盛会，今年我们相约云端，怡美通德携手10x Genomics诚邀您共享饕餮盛宴，分享行业前沿，共话学术进展！
每张怡美通德生信云分析福卡包含500元基础服务费（云平台和10x分析软件的使用咨询和指导）和168元分析费用。每张福卡均为定制实体卡，包含不同的专属账号和密码，收到实体卡后可按卡片上的操作说明激活使用。
关于云分析福卡
- 云分析功能特点
① 低使用门槛：帮助生信分析零基础使用者方便使用常用的单细胞生信分析软件工具
② 可拓展：可随时添加更多更新的生信软件分析工具，自主建立分析流程
③ 无需硬件投入：无硬件投资，节省数十万元服务器成本
④ 节省使用经费：按需使用，灵活计费，经济实惠
⑤ 便于数据共享协同合作进行生信分析
⑥ 伴随使用咨询指导服务
⑦ 可选运算配置：CPU:1-128核，内存最高可达1.5TG
⑧可选CPU 类型：Intel Xeon (Cascade Lake) Platinum 8269/8269CY，Intel Xeon (Cooper Lake) Platinum 8369，3.3/3.8GHz等
⑨ 存储空间：10TB （相当于8000 Gbp的数据）
⑩ 最大数据传输速度：10M/s （每小时传输25Gbp的测序数据文件）
⑪ 操作系统：Linux
⑫ 运算速度：使用Cell Ranger分析一个样本单细胞转录组测序数据（~100Gbp）约2小时
- 10x分析软件的使用说明和指导
所有获得此卡的客户将会获得10x软件的使用指导，以培训班形式进行，培训班计划于2022年2月举办。目前已安装布署了Cell Ranger，Space Ranger 等单细胞及空间转录组生信分析工具。
Ø 拆分数据
从BCL文件格式转化为10x cellranger 需要的fastq文件
Ø 得到表达矩阵
Cell Ranger可将Fastq文件进一步处理，并分别统计各序列文件的质控信息。利用RNA-seq比对软件STAR(spliced Transcripts Alignment to a Reference),将经过下机处理的Read2和参考基因组进行比对，并区分出外显子区，内含子区和基因间区，并统计注释到转录本基因组上的reads个数，得到表达矩阵，并可以进行二级分析，包含PCA降维分析，Graph-based聚类分析，K-Means聚类分析，差异分析等
Ø 合并样本
不同的处理得到的数据，可以通过cellranger aggr进行合并，并考虑到测序深度的影响，得到统一的基因表达矩阵
Ø 精细化分析
通过cellragner reanalyze 设定一些参数，比如指定某群特定barcode进行后期分析，去除某些特定基因，使其不参与后期分析
Ø 可视化分析
Loupe Broswer 软件，可以以图形方式方便查看数据结果，得到细胞聚类图，基因在细胞聚类图上的表达图及小提琴图、热图’等，并可以根据已知细胞类型的marker对细胞进行注释。也可用Loupe Broswer做某些类之间的差异分析，得到更多的差异基因，做一些探究性的工作。
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10x Genomics是一家生命科学技术公司，致力于对生物学进行研究，理解和掌握从而促进人类健康。该公司的综合解决方案包括用于分析生物系统的仪器、试剂耗材和软件，其所能提供的分辨率和规模与生物学的复杂性相匹配。10x Genomics的产品已被全球的研究人员所采用，其中包括全球100强研究机构和全球20强制药公司，并被3000多篇有关肿瘤、免疫学和神经科学等发现的研究论文引用。公司的专利组合包括超过1100项已发布的专利和专利申请。
北京怡美通德科技发展有限公司是10x Genomics的官方授权代理商，如果您想了解更多关于10x Genomics的信息，欢迎联系我们，电话: 010-84409661，Email: marketing@emtd.com.cn。