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讲座预告:第六届PEAKS蛋白质谱数据分析培训班

2022-02-15     来源:本站     点击次数:3558

培训简介:
质谱的技术发展,极大程度地推动了蛋白质组学的发展。无论是单个蛋白的表征、单细胞蛋白质组,还是到大规模的临床蛋白质组学,离不开多属性的质谱方法和对应的数据分析。本届蛋白质谱数据分析培训班将由豆谷科技与中国质谱学术大会组委会联合举办,旨在从质谱方法及数据分析,到最新的蛋白组学的应用,为从事蛋白组学的科研人员和学生提供一个学习和交流的平台,诚挚地邀请您的参与!

主办单位:上海豆谷信息科技有限公司
                中国质谱学术大会组委会
培训时间:2022年3月17日(周四)
培训地点:杭州市萧山区义桥东方文化园-杭州太虚湖假日酒店附楼二楼百源厅

特邀嘉宾:
(按姓氏排名)


边海博,算法工程师,Bioinformatics Solutions Inc. 。在BSI公司从事算法研究工作,于2016年和2019年分别在浙江大学获得软件工程学士,在University of Waterloo获得数学硕士学位,主要研究方向为计算机科学、系统与网络。目前在PEAKS团队中研究蛋白质搜索算法并进行设计优化,特别是对DIA数据分析的算法有深入研究。


曹勇 博士,北京生命科学研究所。现为北京生命科学研究所董梦秋实验室博后。博士期间一共发表论文12篇,代表性工作包括:开发了新型靶向精氨酸的交联剂和为交联软件测评制备了可靠数据集,两项工作都以共同一作在Nature Communications发表。此外,还应用交联质谱技术辅助其他课题组解析蛋白质结构、表征蛋白质构象变化以及鉴定二硫键等,成果以共同作者发表在Nature、Nature Communications、Science Advances、PNAS等杂志上。曹勇博士在交联质谱领域有丰富的经验,所在的董梦秋老师课题组开发的交联肽段质谱鉴定技术被全球很多实验室采用。


董梦秋 博士,研究员,北京生命科学研究所。耶鲁大学博士,斯克利普斯研究所博士后,2007年回国,在北京生命科学研究所工作至今。董梦秋课题组以线虫为模型研究关于衰老的基础生物学问题,同时开发基于质谱的蛋白质组学技术,在两个领域都取得了突破性进展,相关文章发表在Nature、Nature Methods、Nature Communications、eLife、Aging Cell, Journal of Proteome Research、Analytical Chemistry 等期刊。课题组开发的交联肽段质谱鉴定技术是辅助解析蛋白质结构或蛋白-蛋白相互作用的有效工具,被全球很多实验室采用。在生物学方面,课题组目前的研究重点是解析线虫衰老的生物学过程,以系统生物学思想结合多组学手段回答衰老是什么、衰老是否由遗传程序控制等基本问题。


单宝珍 博士,CEO,Bioinformatics Solutions Inc.。加拿大Bioinformatics Solutions Inc.(BSI)的首席执行官,是PEAKS算法的设计开发核心成员。单博士1997年在南京大学获得化学博士学位,并于2009年在Western University获得计算机博士学位,在基于质谱的蛋白质组学的数据挖掘和统计分析(比如蛋白质/多肽鉴定和定量、抗体表征等)的相关研究和算法开发方面有近20年的丰富经验。


张耀阳 博士,研究员,中科院生物与化学交叉研究中心。于2004年和2006年在北京理工大学分别获得学士和硕士学位,2010年在德国马克斯普朗克精神病研究所和慕尼黑大学获得博士学位,随后在美国斯克利普斯研究所进行博士后研究。张耀阳研究员于2013年加入中国科学院生物与化学交叉研究中心,担任‘质谱与蛋白质组’研究组长的职位,并获得中科院“百人计划”支持。张耀阳研究员目前的研究主要集中在蛋白质质谱技术的开发及其在生物体系中应用。

培训内容:

8:30 - 9:00 签到
9:00 - 9:05 主办方致辞
9:05 - 9:25

李文婷 高级应用工程师
豆谷科技

· 蛋白质组学概览
· PEAKS安装软件

9:25 - 10:25

边海博 算法工程师
Bioinformatics Solutions Inc.

DIA数据分析全流程:
1.DIA de novo与de novo谱图库应用
2.DIA 直接序列数据库搜索
3.DIA 谱图库搜索
4.数据质控

10:25-10:40

茶歇

10:40--11:20

张耀阳 博士,研究员
中科院生物与化学交叉研究中心

特邀报告:蛋白质组学在药物靶标发现及
作用机制研究中的应用

11:20-12:00

李文婷 高级应用工程师
豆谷科技

肽段鉴定方法:
1.从头测序
2.序列数据库与蛋白推断
3.打分与大规模数据FDR质控

12:00-13:30 午餐  

13:30-14:15

李文婷 高级应用工程师
豆谷科技

翻译后修饰与突变

14:15-15:00

单宝珍 博士,CEO
Bioinformatics Solutions Inc.

完整糖肽分析:
1.糖基化及位点鉴定
2.寡糖链从头测序

15:00-15:15 茶歇  

15:15-16:00

董梦秋 博士,研究员
北京生命科学研究所
曹勇 博士
北京生命科学研究所

特邀报告:Chemical Cross-linking of Proteins 
Coupled with Mass Spectrometry

16:00-17:00

单宝珍 博士,CEO
Bioinformatics Solutions Inc.

蛋白相对定量:
定量方法新优化(DDA & DIA)

如何报名:
如果您计划参加,可以通过以下两种方式报名,由于座位有限,建议您提前报名!
1. 请点击豆谷官方网站上方“我要报名”即可!
2. 扫描填写下方报名表单报名参加!

报名后,我们会在一个工作日内通过微信或邮件回复您!

备注:如果您已经报名参加“2020年中国质谱学术大会”,可以免费参加本次培训班。
 

培训费用及相关事项:
1、培训班期间每位学员提供午餐和茶点,以及培训班期间的PEAKS Studio软件免费试用。
2、请参加人员自备笔记本电脑和鼠标,以便在培训当天由主办方安装软件。
3、收费标准为:1200元/人。
 

付款方式:

1.网上汇款或银行转账
我公司银行卡的信息为:
户名:上海豆谷信息科技有限公司
账号:31001632504052514304
开卡银行:建行上海宜山路支行

    2.支付宝付款

    名称:上海豆谷信息科技有限公司
    账号:43542942@qq.com


联系我们:
报名咨询:徐玉仙
Email:  sales@wandougu.com
电话: 021-54155562、13764231640


关于豆谷科技
上海豆谷信息科技有限公司是一家致力于为蛋白质组学和抗体生物药领域的科研工作者提供基于质谱的数据分析软件和服务整体解决方案的公司,是加拿大Bioinformatics Solutions Inc在中国的独家代理,负责软件全系列产品和服务的商务、销售和技术工作,主要包括:PEAKS AB及抗体测序与表征服务,PEAKS Studio、PEAKS Online等

关于BSI
BSI是世界领先的生物信息软件和服务公司,位于加拿大享有“硅谷”之称的安大略省滑铁卢市。BSI在质谱数据分析领域拥有多年的经验积累,为迅猛发展的基因组学,蛋白质组学和生物技术行业提供了世界领先的算法和软件解决方案及质谱分析服务。旗下著名的PEAKS软件平台在全世界范围内拥有上千家学术和工业界用户。2016年ASMS期间BSI又隆重推出的PEAKS AB软件平台更是一经推出即获得多家生物制药公司的青睐。

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