10x Genomics发布新品：首款Visium仪器CytAssist
2022-06-24 来源:怡美通德公众号 点击次数:4825 近几年，空间转录组技术发展如火如荼，由于其应用前景广阔，已成为生命科学领域的研究热点。作为一家飞速发展的公司，10x Genomics公司一直致力于研发新技术，不断推出新产品，扩充产品线，其开发的Visium空间基因表达解决方案将组织学与空间分辨率的全转录组分析相结合，可在组织背景下对基因表达进行定位和定量。
FFPE样本是临床上十分常见的研究材料，可以长期保存病理样本，由于其可以溯源如疾病诊断、预后等临床信息，有很高的临床科研价值，但核酸降解严重、存在分子交联，使其成为珍贵但同时富有挑战的样本类型。为了解决FFPE样本降解严重的问题，10x Genomics于2021年推出了Visium FFPE基因表达解决方案初代产品，可以对长期保存的FFPE组织样本的全转录组进行分析，并具有完整的组织覆盖度，可重新分析长期保存的生物库样本以发现生物标志物，或开展回顾性研究和纵向研究。
为了解锁更多场景下的FFPE样本，如被贴在普通玻片上的归档样本、大面积的组织样本、计划先对样本进行初筛选定感兴趣区域后再进行后续实验等，10x Genomics于近日发布了首款Visium仪器CytAssist，这是一款小型台式仪器，它可以将普通玻片上FFPE组织的转录组分析物转移到10x Visium基因表达玻片上，从而架起组织学与基因组学的桥梁。
FFPE样本是临床上十分常见的研究材料，可以长期保存病理样本，由于其可以溯源如疾病诊断、预后等临床信息，有很高的临床科研价值，但核酸降解严重、存在分子交联，使其成为珍贵但同时富有挑战的样本类型。为了解决FFPE样本降解严重的问题，10x Genomics于2021年推出了Visium FFPE基因表达解决方案初代产品，可以对长期保存的FFPE组织样本的全转录组进行分析，并具有完整的组织覆盖度，可重新分析长期保存的生物库样本以发现生物标志物，或开展回顾性研究和纵向研究。
为了解锁更多场景下的FFPE样本，如被贴在普通玻片上的归档样本、大面积的组织样本、计划先对样本进行初筛选定感兴趣区域后再进行后续实验等，10x Genomics于近日发布了首款Visium仪器CytAssist，这是一款小型台式仪器，它可以将普通玻片上FFPE组织的转录组分析物转移到10x Visium基因表达玻片上，从而架起组织学与基因组学的桥梁。
10x Genomics提供从仪器设备、试剂耗材到分析软件的完整解决方案。此款助力型仪器与H&E染色或免疫荧光染色（IF）的FFPE样本兼容，配套使用的Visium玻片具有2个捕获区域，每个捕获区域面积为6.5mm*6.5mm或者11mm*11mm，两款开源的用户友好型软件Space Ranger及Loupe Browser可进行下游数据处理分析及可视化展示。
对置于普通标准载玻片上的FFPE样本进行脱蜡和成像处理后，进行解交联和探针杂交，然后将两张标准载玻片和一张含两个捕获区域的Visium玻片放入CytAssist仪器中，使标准玻片上的组织切片与Visium玻片上两个捕获区域的顶部对齐。仪器捕获明场图像以提供空间定位用于校准及数据分析，然后将转录组分析物与Visium玻片杂交，从而实现组织转录组分析物从普通玻片到Visium玻片的转移，后续探针延伸及文库构建等操作与Visium FFPE标准流程相同，在仪器外即可完成。
10x Genomics还对Visium FFPE的初代产品进行了升级，升级到v2.0版本的产品包含全新设计的玻片和试剂，可适配于Visium CytAssist仪器。
升级后的Visium FFPE v2.0产品具有以下几个特性：
① 升级后的玻片对组织的粘附性更高，不用再做预测试即可开展正式实验
② 采用了新的探针设计，对于约90%的基因设计了三对探针对，对于一些高表达的基因设计了一对探针，具有高灵敏度和高特异性
③ 提供商业化的35种蛋白组合试剂盒，可以对同一FFPE样本进行转录组和蛋白质的同时分析，对基因表达检测的同时检测几十种蛋白
④ 检测范围拓宽：质检标准为DV200>30%，可检测更多高降解度的样本
⑤ 配置升级：新增加了大面积11mm*11mm捕获区域，解锁更多可能性。
① 升级后的玻片对组织的粘附性更高，不用再做预测试即可开展正式实验
② 采用了新的探针设计，对于约90%的基因设计了三对探针对，对于一些高表达的基因设计了一对探针，具有高灵敏度和高特异性
③ 提供商业化的35种蛋白组合试剂盒，可以对同一FFPE样本进行转录组和蛋白质的同时分析，对基因表达检测的同时检测几十种蛋白
④ 检测范围拓宽：质检标准为DV200>30%，可检测更多高降解度的样本
⑤ 配置升级：新增加了大面积11mm*11mm捕获区域，解锁更多可能性。
Visium CytAssist仪器和FFPE v2.0产品现在均已接受订购，早下单早发货！欢迎通过如下方式联系我们，电话: 010-84409661，Email: marketing@emtd.com.cn。
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