2024年PEAKS中国第二届用户会完美闭幕
2024-07-26 来源:本站 点击次数:2117
会议回顾
2024 年 7 月 18 日，Bioinformatics Solutions Inc. 在上海成功举办了“PEAKS®中国第二届用户会”。此次会议邀请了国内资深用户分享运用 PEAKS®软件进行各类研究的综合数据分析经验，包括高通量蛋白组、糖蛋白组学、免疫肽组学和临床研究等。
PEAKS®系列软件作为业界知名的一站式蛋白质谱数据分析平台，一直引领质谱技术发展前沿，不断优化算法、迭代产品，以满足相关研究领域工作者的各类分析需求。PEAKS®将深度学习算法全面应用在各数据分析流程中，包括PEAKS®特有的DeepNovo和免疫肽组工作流；整合谱图库搜索，直接序列数据库搜索和从头测序的DIA数据分析工作流；同时深度学习也赋能DDA数据的分析。不断优化的算法，使灵敏度和准确度都有进一步的提高，特别DIA数据，在PEAKS®12 中更是提升约20%以上。
7 月 19 日，BSI 联合上海医学院公共技术平台举办了“PEAKS®第七届蛋白质组学数据分析及应用培训班”。培训班展示了 PEAKS®12 的最新功能及应用方向，为相关科研人员提供了交流学习的平台，促进了质谱蛋白质组学、生物制药等领域的研究与发展，受到了广大参与者的热烈欢迎和积极评价。
本次用户会首先由 Bioinformatics Solutions Inc. 的 CEO 单宝珍博士致开幕词。单博士在开幕词中介绍并感谢了特邀嘉宾的到来，感谢所有用户对我们PEAKS软件产品的支持，同时为大家介绍了BSI公司的背景和发展历程，我们聚焦在提供质谱技术与数据方案，通过发现和靶向蛋白质组学的研究，帮助用户揭示蛋白质的奥秘。BSI团队从数据层到知识库，落地在抗体和免疫多肽等免疫治疗的应用领域。
01
复旦大学生物医学研究院的张莹研究员分享了通过一种全新的OPA-S-S-alkyne化学探针，有效且选择性地靶向标记活细胞表面的赖氨酸，结合后续的点击化学和生物素标签富集，用于发现和识别出许多新的细胞表面高反应性氨基酸的整体方法，这对于理解细胞表面蛋白质的功能和药物开发具有重要意义。4月8日，陆豪杰/张莹团队联合在线发表的相关研究成果中，质谱数据的定性定量即使用PEAKS® Online完成。
02
复旦大学化学系/生物医学研究院乔亮研究员分享了基于深度学习和数据非依赖采集的糖蛋白质组学分析新方法，主要介绍了针对完整糖肽的DDA和DIA数据分别进行谱图解析的思路，并对比了不同质谱仪、不同的糖谱解析软件的对糖基化修饰鉴定的表现。其中，PEAKS® GlycanFinder对DDA糖肽、糖基化位点的鉴定深度均超过其他软件。
03
复旦大学生物医学研究院的申华莉研究员分享了标志物发现和疾病诊断新方法的研究进展，从蛋白质组学方法和临床诊断要求间的差距出发，在不同的人群队列中结合发现和靶向质谱方法，筛选蛋白标志物，以期建立基于蛋白质组学的多癌诊断新策略。
04
福建医科大学孟超肝胆医院副研究员邢晓华博士分享了基于蛋白质组学的肝癌精准诊疗方案，介绍了基于自有平台搭建的肝癌蛋白质组及翻译后修饰组学完善技术体系，建立肿瘤早期诊断新技术、新方法与精准医学方面的基础与临床转化研究的最新进展。
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2024 年 7 月 18 日，Bioinformatics Solutions Inc. 在上海成功举办了“PEAKS®中国第二届用户会”。此次会议邀请了国内资深用户分享运用 PEAKS®软件进行各类研究的综合数据分析经验，包括高通量蛋白组、糖蛋白组学、免疫肽组学和临床研究等。
PEAKS®系列软件作为业界知名的一站式蛋白质谱数据分析平台，一直引领质谱技术发展前沿，不断优化算法、迭代产品，以满足相关研究领域工作者的各类分析需求。PEAKS®将深度学习算法全面应用在各数据分析流程中，包括PEAKS®特有的DeepNovo和免疫肽组工作流；整合谱图库搜索，直接序列数据库搜索和从头测序的DIA数据分析工作流；同时深度学习也赋能DDA数据的分析。不断优化的算法，使灵敏度和准确度都有进一步的提高，特别DIA数据，在PEAKS®12 中更是提升约20%以上。
7 月 19 日，BSI 联合上海医学院公共技术平台举办了“PEAKS®第七届蛋白质组学数据分析及应用培训班”。培训班展示了 PEAKS®12 的最新功能及应用方向，为相关科研人员提供了交流学习的平台，促进了质谱蛋白质组学、生物制药等领域的研究与发展，受到了广大参与者的热烈欢迎和积极评价。
本次用户会首先由 Bioinformatics Solutions Inc. 的 CEO 单宝珍博士致开幕词。单博士在开幕词中介绍并感谢了特邀嘉宾的到来，感谢所有用户对我们PEAKS软件产品的支持，同时为大家介绍了BSI公司的背景和发展历程，我们聚焦在提供质谱技术与数据方案，通过发现和靶向蛋白质组学的研究，帮助用户揭示蛋白质的奥秘。BSI团队从数据层到知识库，落地在抗体和免疫多肽等免疫治疗的应用领域。
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复旦大学生物医学研究院的张莹研究员分享了通过一种全新的OPA-S-S-alkyne化学探针，有效且选择性地靶向标记活细胞表面的赖氨酸，结合后续的点击化学和生物素标签富集，用于发现和识别出许多新的细胞表面高反应性氨基酸的整体方法，这对于理解细胞表面蛋白质的功能和药物开发具有重要意义。4月8日，陆豪杰/张莹团队联合在线发表的相关研究成果中，质谱数据的定性定量即使用PEAKS® Online完成。
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复旦大学化学系/生物医学研究院乔亮研究员分享了基于深度学习和数据非依赖采集的糖蛋白质组学分析新方法，主要介绍了针对完整糖肽的DDA和DIA数据分别进行谱图解析的思路，并对比了不同质谱仪、不同的糖谱解析软件的对糖基化修饰鉴定的表现。其中，PEAKS® GlycanFinder对DDA糖肽、糖基化位点的鉴定深度均超过其他软件。
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复旦大学生物医学研究院的申华莉研究员分享了标志物发现和疾病诊断新方法的研究进展，从蛋白质组学方法和临床诊断要求间的差距出发，在不同的人群队列中结合发现和靶向质谱方法，筛选蛋白标志物，以期建立基于蛋白质组学的多癌诊断新策略。
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复旦大学生命科学学院张旭敏研究员分享了超高通量蛋白质组学研究新方案和数据分析的挑战，其团队开发的102-plex标记定量方法突破了传统两步标记法的限制，解决了定量干扰问题，使得等重同位素标记定量方法迈入了新高度。
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Bioinformatics Solutions Inc. CEO单宝珍博士从PEAKS AB单抗从头测序到PolySeq.AI的多抗从头测序方法切入，分享基于质谱的抗体发现方法。基于PEAKS® AB的单抗从头测序技术，通过多酶解的Bottom up数据和Intact 完整分子量的相互验证，自动化组装抗体蛋白的序列，而在多抗从头测序方法介绍中，多抗样品的复杂度急剧增加，如何通过多维度液相结合多维度质谱方法通过AI数据处理实现天然抗体的发现工作是PolySeq.AI技术平台的核心。
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作为生物信息学的领军企业，BSI专注于蛋白质组学和生物药领域，通过机器学习和先进算法提供世界领先的质谱数据分析软件和蛋白质组学服务解决方案，以推进生物学研究和药物发现。我们通过基于AI的计算方案，为您提供对蛋白质组学、基因组学和医学的卓越洞见。旗下著名的PEAKS®️系列软件在全世界拥有数千家学术和工业用户，包括：PEAKS®️ Studio，PEAKS®️ Online，PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB，DeepImmu®️免疫肽组发现服务和PEAKS®️ AB抗体综合表征服务等。
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