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OCT包埋胶/样本包埋/空间代谢组学/单细胞核测序/珍贵样本保存方案

2026-04-28     来源:本站     点击次数:45

如果你的样本极其珍贵,样本保存就更为关键。
以下是样本保存的几种方案
 
第一:组织分割分区保存
如果样本量允许,可以将组织分成几份。
  • 一份按常规液氮速冻,用于普通分子实验。
  • 一份用组织冻存液梯度冻存或直接制备成单细胞悬液冻存,为单细胞测序留路
  • 一份用OCT包埋,干冰速冻后-80℃保存,用于空间转录组或冰冻切片。
这样即使后续研究方赂变化,也有对应的样本可用。
 
第二:优先考虑单细胞核的保存方案
如果组织本身很少无法分割,又想兼顾单细胞和常规测序,液氮速冻的组织,后续可以做单细胞核测序
 
第三:优先考虑空间组学的保存方案
如若后续做空间组学的可能性更大,建议优先采用OCT包埋干冰速冻的方式。

第四:石蜡包埋样本的利用,对于已经石蜡包埋的样本,既可以做空间转录组测序,10x HD、Xenium 、华大Stereo-FFPE,也有单细胞测序方案10x Flex,可以从福尔马林固定的石蜡样本中,提取细胞核进行单细胞测序,这为大量临床存档样本的再利用提供了技术支撑,但需要专用试剂盒和优化的解离步骤,需要注意的是,组织固定的时间,一般建议是18-24小时,不能固定过久。
此外,无论采用哪种保存方式,详细的实验记录都很重要,包括:离体时间,速冻方式,保存温度,是否使用OCT,冻存时间长短等,这些信息,在后续实验出现异常或失败时,能帮助判断,问题是出在样本本身还是实验操作上。
 
对于珍贵样本,建议在正式实验前先做少量测试,确定质量可行后,再推进大规模实验。

以上资料供大家叁考,若有需要补充或分区更为细致,可沟通交流;
采用鑫乐包埋胶(货号xinle-hc0019)代替OCT包埋可提供做空间代谢可能。另外,OCT和鑫乐胶包埋的样本,除了做空间组学,还可以用于单细胞核转录组测序,如有需要可联系上海鑫乐生物。

 
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