细胞STR鉴定-确保您的细胞“货真价实”的最佳标准
您知道吗?在科研实验中,一个小小的细胞STR鉴定可能就是你成功或失败的关键!您是否有这样的困扰,当您拿到细胞后,直接就做起了实验,结果实验做完,论文都写好了,突然发现细胞是错的,想想都头大,对吧?
别急,这就是细胞STR鉴定派上用场的时候。因此请记住拿到细胞后首先要确定细胞的身份-即获得细胞STR鉴定报告。STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列),也被称为细胞的DNA指纹,是长度为2~7个碱基对的重复DNA序列,广泛存在于基因组中,具有高度多态性,是用于确认细胞系身份和检测交叉污染的金标准技术。
STR鉴定的意义
1、细胞系身份确认:新建细胞系或从外部获取细胞时,确保细胞来源真实。
2、交叉污染检测:及时发现细胞培养中可能的污染,避免实验结果失真。
3、实验可靠性:保证实验数据可重复,防止因细胞错误导致的研究结论偏差。
4、期刊和基金要求:许多学术期刊和资助机构要求提供细胞STR分型数据作为投稿或申请条件。
细胞STR鉴定的核心步骤
1、PCR扩增:选择多个特定STR位点,通过聚合酶链式反应扩增目标序列。
2、毛细管电泳分离:利用电泳分离扩增产物,并通过荧光检测识别各等位基因重复序列的拷贝数差异。
3、生成STR分型图谱:形成细胞独特的STR指纹。
4、数据库比对:将分型结果与国际标准数据库(如ATCC、DSMZ、ExPASy)进行比对,匹配度≥80%通常认为细胞身份正确;若出现多等位基因峰或匹配度低,则提示可能存在交叉污染或错误标记。
由此看来细胞STR鉴定是广大科研工作者们开始养细胞之前的必备检测之一。目前所有人类细胞均有国际标准数据库(如ATCC、DSMZ、ExPASy)可进行细胞STR比对;而小鼠细胞STR数据库不全,目前只能进行少部分比对。
中国科学院上海细胞库提供的细胞均进行过细胞STR鉴定及种属污染鉴定以确保细胞的准确性,同时中国科学院上海细胞库也提供细胞STR鉴定和细胞种属污染鉴定服务,如科研老师需要可联系中国科学院上海细胞库。如果您在细胞鉴定上遇到问题,也欢迎您来咨询中国科学院上海细胞库或者留言!
细胞准备及送样流程
常规步骤进行细胞消化收集(悬浮细胞直接收集),1000rpm,离心5min。
弃上清。
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加入3-5ml PBS轻轻吹打,清洗细胞1次,1000rpm,离心5min,弃上清。
↓
加入0.5-1mL完全培养基重悬细胞沉淀,转移至1.5ml离心管或冻存管中
即可送样。
注意:不接受未离心的活细胞直接邮寄,但可直接提供已冻存的细胞。
数量要求:贴壁/悬浮细胞STR检测样本收样数量要求 :需收集约1*106个细胞
运输要求:用冰袋+安全泡沫盒运输,48小时内送达中国科学院上海细胞库,如大于48小时,用冷链运输。
细胞库收样地址:上海市徐汇区岳阳路320号中科院上海细胞库102房间,
蒋老师,17721059347;
填写后的电子版送样单请直接发送至邮箱:cellbank@sibcb.ac.n
地址:上海市徐汇区岳阳路320号
Tel:021-54920405
Email:cellbank@sibcb.ac.cn
微信公众号:CELLCELL
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