批培养/补料/ATF灌流三种工艺方案全验证
摘要:本文基于PBS Biotech与GeneFab联合发布的白皮书,验证了PBS垂直轮生物反应器的CAR-NK扩增工艺。经0.1L小试参数优化、3L中试对比三种培养模式,结果显示灌流工艺可使细胞扩增倍数提升2.6倍,细胞杀伤效力优于静态培养,且系统线性放大性优异,为CAR-NK临床级规模化生产提供数据支撑。
关键词:垂直轮生物反应器、PBS Mini、CAR-NK、PBS 3L、ATF灌流工艺、补料批培养、PBS垂直轮生物反应器、CAR-NK高密度扩增、工艺放大、批培养、NK细胞扩增
随着NK细胞免疫疗法在肿瘤、自身免疫病等领域的临床推进,如何实现稳定、可放大的临床级细胞扩增,成为行业普遍关注的核心问题。传统静态培养体系存在操作繁琐、污染风险高、批培养一致性差、放大难度大等短板,难以匹配商业化生产需求。
近期,PBS Biotech联合GeneFab发布专项白皮书,以人外周血来源CAR-NK为研究对象,在PBS垂直轮生物反应器(点击查看)体系内,系统验证了批培养、补料批培养、ATF灌流三种培养策略的扩增表现,完成了从0.1L小试到3L中试的全流程工艺验证,为CAR-NK规模化生产提供了实测数据参考。

图1.PBS Mini垂直轮反应器系列,包括PBS Mini基座(非一次性)和一次性耗材两部分,其中耗材有0.1L和0.5L两种耗材规格。
一、研究设计:覆盖从小试到中试的全流程验证
该研究中采用经辐照K562滋养层激活、逆转录病毒转导的CAR-NK细胞,分别在PBS-0.1Mini(100mL工作体积)与PBS-3(3L工作体积)垂直轮生物反应器中开展实验,核心评估维度包括:

图2.补料批培养培养与灌流培养体系下,NK细胞从活化、扩增至冻存的工艺流程示意图
二、PBS Mini 0.1L小试:初步锁定核心工艺参数
PBS Mini 0.1L作为低成本的缩小模型,可快速完成工艺参数筛选,降低中试开发风险。研究针对搅拌转速、接种密度两大核心变量开展了系统优化:
1.搅拌转速:30-50rpm为较优区间
研究测试了10、30、50、100rpm四档转速:
| Figure | Donor | Culture Duration | Feeding Strategy | Seeding Density (cells/mL) | Agitation Speed | Total Viable Cells (D10) | Fold Expansion |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3A/B | DA | 12 | Batch | 100 x 103 | 10 RPM | 1.2 x 108 | 17 |
| 30 RPM | 3.1 x 108 | 36 | |||||
| 50 RPM | 2.9 x 108 | 30 | |||||
| 3C/D | DB | 10 | Batch | 50 x 103 | 50 RPM | 1.5 x 108 | 31 |
| 100 RPM | 1.2 x 108 | 24 | |||||
| 50 ➜ 100 RPM shift | 1.2 x 108 | 25 | |||||
| 3E/F | DB | 10 | Fed-Batch | 50 x 103 | 50 RPM | 2.5 x 108 | 50 |
| 100 x 103 | 50 RPM | 1.9 x 108 | 19 | ||||
| 250 x 103 | 50 RPM | 4.5 x 108 | 18 | ||||
| 400 x 103 | 50 RPM | 2.5 x 108 | 13 |
表1.PBS-0.1中参数评估与扩增结果
2.接种密度:低接种密度实现更高扩增倍数
测试了5×10⁴、1×10⁵、2.5×10⁵、4×10⁵cells/mL四档接种密度(补料批培养模式):
此外,培养基中添加1g/LPluronicF-68作为剪切保护剂,可进一步降低搅拌过程中的细胞损伤,提升培养体系稳定性。

图3A-B.30rpm与50rpm搅拌转速下的细胞扩增倍数,约为10rpm组的2倍。培养12天后,葡萄糖浓度降至约1.5g/L,乳酸浓度升至约1.4g/L。

图3C-D.100rpm恒速与50→100rpm变速搅拌条件下,终细胞密度相近;而50rpm恒速条件下细胞扩增效果较优。10天培养周期结束时,葡萄糖浓度降至约2g/L,乳酸浓度升至约0.8g/L。细胞生长通常在此代谢水平下进入平.台期,与细胞密度变化趋势一致。

图3E-F.50×10³cells/mL的较低接种密度可实现较高的扩增倍数。10天培养结束时,50×10³cells/mL与100×10³cells/mL接种组的代谢谱特征相近。
三、PBS-3L中试:补料批培养可明显提升细胞产量
基于小试优化参数,研究将工艺放大至3L规模,并对比了批培养与补料批培养两种培养策略:
实验结果显示,补料批培养策略通过补充营养、稀释代谢废物,有效延缓了生长平.台期,总细胞产量优于批培养模式;同时0.1L小试与3L中试的细胞生长动力学、代谢趋势高度一致,验证了PBS垂直轮反应器的线性放大特性,工艺参数可直接迁移,大幅降低放大风险。

图4.细胞扩增结果分析图。该组图谱包含三部分内容:(A)非灌流培养批培养的细胞密度变化曲线;(B)经FLEX2代谢分析仪检测的葡萄糖、乳酸浓度变化(实线代表葡萄糖,虚线代表乳酸);(C)三个培养批培养的细胞计数及扩增倍数统计。结果证实:相较于批培养模式,采用补料批培养换液策略可获得更高的细胞产量
代谢数据显示,当葡萄糖浓度降至约2.0g/L、乳酸浓度超过1.0g/L时,细胞生长开始进入平.台期,这一阈值也为后续灌流工艺的启动时机提供了参考依据。
四、ATF灌流工艺:扩增产量提升2.6倍
为进一步实现工艺强化,研究在3L反应器上搭配RepligenATF2系统,开发了灌流培养工艺,灌流速率设定为1.5L/天(0.5VVD)。

图5.灌流培养操作工艺图谱。(A)4号批培养(R4-DB-灌流)与5号批培养(R5-DB-灌流)的细胞密度变化曲线,图中标注各阶段灌流启动节点;(B)葡萄糖与乳酸代谢浓度变化曲线(实线代表葡萄糖,虚线代表乳酸);(C)细胞收获总量、细胞扩增倍数对比;其中4号批培养接种密度为250cells/μL,5号批培养接种密度为300cells/μL;(D)灌流运行计划表(VVD:每日罐体工作体积换液量)。
1.扩增效率大幅提升
相较于同供体的补料批培养工艺,灌流模式下细胞扩增倍数提升2.6倍,较高活细胞密度达5×10⁶cells/mL,3L体系单批培养总活细胞量可达1.5×10⁹。
2.细胞质量无明显影响
通过凋亡检测验证,灌流启动前后细胞健康状态无明显差异,健康细胞占比稳定在60%以上,说明垂直轮温和的流体环境+ATF低剪切截留模式,不会对NK细胞造成额外损伤。

图6.5号灌流培养批次(R5-DB-Perfusion)细胞健康状态评估。对灌流启动前后的细胞健康状态进行检测对比,结果表明灌流启动前后细胞整体健康水平基本一致。
3.代谢环境更稳定
灌流可持续补充新鲜营养并移除乳酸等代谢废物,使培养体系的葡萄糖、乳酸浓度维持在稳定区间,避免了批培养培养中代谢废物积累导致的生长抑制。
研究同时指出,以细胞密度/代谢水平作为灌流启动依据,比固定天数启动更具经济性,可提升培养基利用效率。
五、功能验证:反应器扩增细胞杀伤效力更优
细胞扩增数量之外,功能活性是临床价值的核心。研究通过LDH杀伤实验,对比了PBS反应器与静态G-Rex培养体系扩增的CAR-NK细胞效力:
结果表明,垂直轮反应器的动态培养环境,不仅能提升细胞产量,还有助于维持甚至增强CAR-NK细胞的肿瘤杀伤功能。此外,扩增后的细胞CAR表达水平正常,经冻存复苏后活性符合要求,适配临床制备的全流程需求。

图7.静态G-Rex培养体系与5号灌流培养批次(R5-DB-Perfusion)的细胞相对效力(RP)对比。(A)接种后第7天,PBS-3反应器与G-Rex培养体系的细胞相对效力;(B)接种后第8天,PBS-3反应器与G-Rex培养体系的细胞相对效力。

图8.单一供体(供体B)来源CAR-NK细胞在垂直轮生物反应器(VWB)中的细胞密度变化。(A)PBS-3与PBS-0.1反应器的补料批培养结果显示,二者生长动力学特征一致,验证了工艺线性放大的一致性;(B)PBS-3反应器中补料批培养与灌流培养的对比表明,采用灌流换液策略可有效提升细胞产量。
六、总结与展望
本次研究系统验证了PBS垂直轮生物反应器在CAR-NK扩增中的可行性与优势:
同时该白皮书也客观指出,目前的工艺尚未达到体系上限,通过进一步优化培养参数、采用基于实时代谢的反馈式灌流策略,细胞密度与产量还有进一步提升的空间。
整体而言,这套“垂直轮反应器+ATF灌流”的CAR-NK扩增工艺,为细胞治疗企业提供了一套可复制、可放大、合规性强的规模化生产解决方案。

本文基于PBS Biotech与GeneFab联合发布的专项白皮书资料由其中国提供商上海曼博生物整理,用于科研信息分享、实验参考等。上海曼博生物可提供PBS Biotech PBS Mini、PBS-3等垂直轮生物反应器、0.1L与0.5L一次性耗材及CAR-NK临床级规模化扩增相关产品与技术支持。