上海南方基因科技有限公司成立于2000年8月，公司由上海生物芯片有限公司和国家人类基因组南方研究中心共同出资组建而成。

上海南方基因科技有限公司位于上海浦东张江高科技园区生物医药产业基地，总投资2355万元人民币。公司团队由具有丰富基因组研究经历和平台技术研发和管理及经营经验的人员组成。

公司已加入上海研发公共服务平台共享网络，为国内外的生物医药行业科研单位、医学院校和医药企业以及欧美的大型制药公司提供了基因测序、STR全扫、SNP发掘、SNP分型和关联分析、mRNA表达谱、甲基化水平检测等技术服务，客户包括：GSK、Lilly、Merck、Prifer、强生等国际大型制药公司，平台每年完成近1万例样本的检测实验和技术服务。另外，公司还承接了国家863计划、973项目和全国各高校研究院所的大量科技攻关项目的技术服务，建立了GLP（GoodLaboratoryPractice）管理体系。目前公司每年累积服务量在1200机时以上，用户在20家以上。