5'RACE试剂盒
产品及特点 |
研究真核基因的最基础的工作之一就是确定其转录终止位点,目前最通用的方法是5′-RACE法,RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)是Frohman发明的、通过PCR快速克隆cDNA末端的技术,它在不建立cDNA文库的前提下,利用已知cDNA序列设计引物,通过往两端延伸和扩增获得其5′-端序列。本试剂盒就是根据5′-RACE原理而开发,它具有下列特点:
5′-RACE的原理如下图:
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规格及成分 |
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自备试剂 |
Poly(A) RNA(或总RNA)、基因专一性引物A、B、C、75%乙醇。注意:自备的基因专一性引物A,B,C的相对位置应该跟本手册产品介绍中的示意图一致。 |
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运输及保存 |
低温运输、-20℃保存、有效期一年。 |
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使用方法 |
1. 变性模板RNA:将1 μg mRNA或5 μg 总RNA加入到一个RNase-free的PCR管中,补RNase-Free水到9 μL,65℃保温5分钟后短暂离心,立即放冰上待用。如果RNA浓度偏低,体积超过9 μL,可以使用本公司的核酸浓缩剂(需另购,产品编号为110801-30)浓缩到所需的体积。 2. 设置RT反应(用户可以根据需要设阴性对照):在上步的含变性后的RNA模板的PCR管中,按顺序加入:
3. 37℃保温60分钟, 42℃保温30分钟, 50℃保温10分钟,最后75℃保温10分钟使逆转录酶变性。 4. 短暂离心5秒后待用。 5. 在PCR管中加入40 μL微量核酸沉淀剂(本产品含不溶的核酸助沉剂,用前需要充分摇匀再取用),震荡混匀。 6. 室温12000 rpm离心15分钟,小心吸弃上清。 7. 加入1mL 自备75%乙醇,室温12000 rpm离心5分钟,小心吸弃上清。 8. 短暂离心数秒,小心吸弃残留液体后,稍微晾干后加入10 μL RNase-free水,充分吹打溶解,得到cDNA溶液。注意:为保证加尾效率,溶解cDNA的RNase-free水最好不要超过10 μL。 9. 加尾反应:在10 μL cDNA溶液中加10 μL 2×TdT Buffer(含dATP)和1 μL TdT酶,轻柔吹打混匀。 10. 37℃保温15分钟进行加尾反应,然后75℃保温3分钟灭活末端转移酶。 11. 加入0.5 mL RNase-free水稀释加尾反应体系。此稀释液将作为PCR的模板。 12. 第一轮PCR:用不同量的稀释后的加尾反应液设置PCR反应(样品组最好设用量梯度,单位:μL)。
13. 按下列条件进行PCR(注:应根据实际情况选择适当的退火温度)。 第1次循环:94℃ 5分,48-52℃ 2分,72℃ 4分 第2-30次循环:94℃ 40秒,52-60℃ 1分,72℃ 3分 最后延伸:72℃ 15分 14. 取10-20μL PCR产物进行琼脂糖电泳电泳检查PCR结果,如果一条清晰的条带,则可以不做后续的第二轮PCR,而直接进行DNA测序或TA克隆。 15. 第二轮PCR:如果第一轮PCR没有一条清晰的条,则带从4管PCR产物中各取1μL分别加入到20 μL RNase-free水中进行稀释,然后各取1 μL分别作为4管第二轮PCR的模板:
16. 按下列条件进行PCR:第1-30次循环(94℃ 40秒,52-60℃ 1分,72℃ 3分),最后延伸:72℃ 15分 17. 取10-20μL 第二轮PCR产物进行琼脂糖电泳,一般都会有一个样品有清晰的条带出现,则可以直接进行DNA测序或TA克隆。 |
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关联产品 |
3′-RACE试剂盒(CAT#:101104),改良型5′-RACE试剂盒(CAT#:110301) |
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北京天恩泽生物技术有限公司拥有国内最齐全的核酸纯化类产品线,专门从事分子生物学试剂的研究、开发和销售,承接各种定向产品开发、OEM生产和分子生物学技术服务,包括疑难样品的核酸纯化、PCR、克隆、DNA测序、引物合成和全基因合成。
北京天恩泽是由留美十年的归国博士徐堤先生2004年底创建。徐堤博士1985年毕业于四川大学遗传学专业并获得遗传学学士学位,1991年毕业于北京协和医科大学(即后来的中国协和医科大学)并获得生物化学硕士学位,参与过地贫基因的PCR和测序工作。1997年毕业于美国德克萨斯州University of Texas Medical School并获Microbiology and Molecular Genetics博士学位。1998-2001在美国加州Roche Molecular Systems,Inc.(瑞士Roche药业集团购买Cetus公司及其PCR专利后专门成立的开发PCR临床诊断产品的子公司)担任开发部Principal Scientist和HBV血筛项目经理(2000-2001年),对分子生物学产品的开发有丰富的实战经验。
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