PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型识别系统
PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型识别系统介绍
现可免费申请试用
免费申请试用方法:
1、关注“PFGE脉冲场凝胶电泳图谱分析”微信公众号
搜索微信公众账号,进行关注。(微信号:PFGE_CHINA)
2、编辑信息,进行留言
留言信息:单位名称+姓名+联系电话
3、工作人员核实信息,注册账号
我们会在一个工作日内进行电话回访,核实信息后为您提供注册账号服务。
4、打开浏览器输入网址,开始使用
输入工作人员告知的网址,开始使用。
注:自注册成功之日起,试用期为3个月。
一、系统简介
“PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型识别系统”是基于国家十二五重大科技专项开发的专业软件系统。
系统主要功能是PFGE图谱分子分型在线识别和处理,提供二叉层级聚树,MLVA、MLST字符类型的最小生成树,SEQUENCE基因片段类型的亲缘树计算和图形绘制,用于分析菌株之间的相关性,协助追踪感染来源以及有效控制疫情。
系统结合了计算机技术、分子生物学、统计学、图像识别技术、地理信息技术,能够对微生物的分子分型数据进行专业处理和分析,准确识别出相似性。
系统于2015年6月通过由国家疾控中心、解放军疾病预防控制所、军事医学科学院、清华大学以及国内著名医院等单位组成的专家组验收。专家组认为本系统在疾控行业、食品卫生行业、医院以及科研部门均有较强的易用性和稳定性,业务逻辑清晰,功能齐全,且具自主知识产权,安全可控;系统申报2项发明专利,并已获得12个软件著作权。
二、系统解决的主要问题
1、疾控行业:送检样本细菌的相似性判定和带型编码、疾病暴发的溯源分析、疾病分布特征分析和预警分析。在发生感染和疫情时,可以帮助业务人员尽早定位感染来源,提高疫情调查、追踪和控制的效率。
2、医疗机构:院内感染问题、医学研究。
3、食品检疫:对食品中常见致病微生物进行分子分型分析、食源性疾病微生物的溯源。
4、农业和林业:家畜和动物携带治病菌的溯源、引发动物流行性感冒的研究和监控、动物、环境和饲养员耐药菌的研究。
三、系统特点
1、优秀的成本控制:采用B/S模式,一次性部署即可搭建成功,在采购成本、升级成本、维护成本上,具有压倒性优势。
2、高效的计算能力:拥有计算功能强大的分析计算服务,可以一次性聚类1000株菌,并在15秒内完成。
3、强大的客户端绘图能力:客户端提供直观的图形展示和良好的交互体验,操作简便,分析结果一目了然。
4、良好的易用性:全中文操作界面,简单易用,确保用户可以快速上手。
5、可靠的用户信息安全保障:自主知识产权软件,为用户的信息安全提供可靠的保障。
6、实验数据的积累:系统在使用过程中会积累下多样化的实验数据,数据积累的数量越多、年份跨度越广,则分析结果的准确性越高。
四、系统使用效果对比
1、使用前
(1)细菌的识别定性采用传统的物理和化学检测,识别准确度相对差。
(2)细菌的识别分型结果,不能在相关机构中统一认可。
(3)疾病暴发、食品中毒、院内感染发生时,不能及时应对情况,造成诊断延迟,失去了最佳的处置时机。
(4)没有相关的分子分型数据留存,不利于医疗研究和诊断经验数据积累。
2、使用后
(1)细菌的识别定性与国际接轨,识别准确度高。
(2)识别结果可以在不同机构之间比较,识别结果权威性高。
(3)当疾病暴发、食品中毒、院内感染发生时,机构可以直接采集样本,分析识别定性。
(4)能够积累大量的细菌分子分型数据,提高机构在重大疫情中的溯源成功率,提高机构的知名度。
五、系统主要功能示例
1、PFGE指纹图谱数据在线处理
2、二叉层级聚类树计算和图形绘制
3、最小生成树计算和图形绘制
4、亲缘树计算和图形绘制
“PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型识别系统”是基于国家十二五重大科技专项开发的专业软件系统。是PFGE脉冲场凝胶电泳图谱中文分析软件。
系统主要功能是PFGE图谱分子分型在线识别和处理,提供二叉层级聚树,MLVA、MLST字符类型的最小生成树,SEQUENCE基因片段类型的亲缘树计算和图形绘制,用于分析菌株之间的相关性,协助追踪感染来源以及有效控制疫情。
公司成立于1996年5月,总部设在北京。公司是专门从事计算机软件研发、应用、服务的智能密集型高新技术企业,以大型行业应用软件开发和系统集成为核心,集自主开发的行业通用软件产品、网络信息安全软件产品、大型网络应用软件组合平台、中间件软件产品及应用工具于一体,涵盖了系统软件、支撑软件、行业应用软件等各个层次,可为大型应用系统工程提供全方位支持。公司拥有多年从事软件工程实施、国内外合作开发及推广的丰富经验,是北京市新技术产业开发试验区新技术企业,国家发展计划委员会、信息产业部、商务部、国家税务总局认定的“国家规划布局内的重点软件企业”,“国家火炬计划北京软件产业基地”骨干企业,“AAA级信用企业”,北京市软件企业。