酵母双杂交文库
酵母双杂交文库 |
自1989年Field等人建立了第一个基于酵母的细胞内检测蛋白相互作用的系统以来,酵母双杂交系统已经越来越多的应用于鉴定新的蛋白与蛋白相互作用、鉴定蛋白级联底物以及鉴定突变对蛋白与蛋白结合的影响等。有文献统计,目前已知的蛋白质相互作用至少有一半是通过酵母双杂交实验发现的! 但是很多科研工作者都为酵母双杂文库中假阳性比较高的问题而烦恼着。欧易生物结合多年构建文库的经验,在现有酵母双杂交文库构建流程(CLONTECH专利的BD MatchmakerTM library)基础上加入独特步骤,使文库中高丰度表达基因明显降低,从而使筛选时假阳性率明显降低,为您的科研提供更多的便利!
酵母双杂交文库技术指标: 1、库容量≥106; 2、文库滴度≥107cfu/ml; 3、插入片段平均大于1kb(该数据以人类样本构建酵母双杂文库的结果为参照,如样品物种不同,且无参考数据,则我们不作出承诺); 4、减低高丰度表达基因10-100倍。
技术服务内容: A、均一化酵母双杂cDNA文库 总RNA提取、纯化→LD PCR 合成cDNA→cDNA均一化→均一化cDNA产物与线性化的AD质粒共转化于酵母感受态(真核生物同源重组修复)→所有转化液涂于40-100块 B、普通酵母双杂cDNA文库 总RNA提取、纯化→LD PCR 合成cDNA→cDNA产物与线性化的AD质粒共转化于酵母感受态(真核生物同源重组修复)→所有转化液涂于40-100块
材料要求: 为客户构建指定的酵母双杂交cDNA文库,由客户提供组织、细胞或总RNA。
服务完成时提供: A、详细实验报告 B、该酵母文库甘油冻存管
服务周期:获得合格的总RNA后,45个工作日
目前我们已经分别为中国科学院上海植物生理生态研究所、上海交通大学、浙江大学、浙江省农科院、山东省农科院等多家单位完成酵母双杂交文库构建服务,物种包括人、小鼠、水稻、拟南芥、牡丹、稻飞虱等。欢迎随时与我们联系!
附:酵母双杂交原理 酵母双杂交系统是目前研究蛋白-蛋白相互作用的主流方式之一,这种体外互作实验是在酵母这种真核细胞生物中进行的,很大程度上模拟了研究材料的体内环境。简而言之,该策略就是将编码诱饵蛋白(Bait)和靶蛋白(Target)的基因分别融合构建于带有酵母内源转录因子基因(例如GAL4)的DNA Binding Domain序列和Activation Domain序列的两个载体上(图A);由于GAL4调控目标启动子启动转录需要上述两个结构域空间上相互接近,即只有当诱饵蛋白与靶蛋白存在相互作用才能使得GAL4蛋白结构完整并启动报告基因的表达(图B)。 报告基因一般选择某营养物质的合成基因来弥补营养缺陷型酵母宿主菌的缺陷,或者是LacZ这样的可用于组化显色的基因。 特点与优点: 酵母双杂交系统的最主要应用是快速且直接分析已知蛋白之间的相互作用以及分离新的与已知蛋白作用的配体及其编码它的基因。酵母双杂交系统检测蛋白之间的相互作用具有以下优点: 1、相互作用的信号是在融合基因表达后,在酵母细胞内重建完整的转录因子结构的作用而给出的,省去了纯化蛋白质的繁琐步骤; 2、检测在真核活细胞内进行,可以在一定程度上代表研究材料细胞内真实情况; 3、检测的结果可以是基因表达产物的积累效应, 因而可检测存在于蛋白质之间的微弱的或暂时的相互作用; 4、酵母双杂交系统可采用不同组织、器官、细胞类型和分化时期材料构建cDNA文库, 能分析细胞浆、细胞核及膜结合蛋白等多种不同亚细胞部位及功能的蛋白。例如已报道成功分析了RAP1与RIF1ii、P21cip1与CDK2iii、p16与CDK4iv等之间的相互作用。本公司采用CLONTECH专利的BD MatchmakerTM library, 其LD-PCR策略使得所需材料的总RNA的起始浓度大大减少(1-2mg); 5、可以用来比对病变组织,更快的找到突变基因或者导致变异的蛋白,更快的找到攻克方向; 6、利用研究的已知蛋白基因为诱饵,在已经构建好的某组织材料特异表达的cDNA酵母AD文库中钓取可能的互作蛋白; 7、采用Yeast mating策略,实现酵母AD文库使用的反复性,在大规模高效筛选的同时缩减了研究成本。 |
上海欧易生物医学科技有限公司(简称:“欧易生物”),成立于2009年,经过十多年稳健发展,已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司,600名以上员工的生物科技领域集团型企业。
公司为大生命科学、大健康相关研究领域,以及医药、食品及日化企业的客户,提供从基础研究到药物靶点发现、药理药效及安全性评价、疾病分子标志物筛选、致病菌及耐药菌溯源等相关技术服务,全力加速客户研究、开发进程,大大提升客户研究、开发价值。
公司现已建成完整齐备的多组学检测服务平台和多组学联合大数据分析平台,提供基因组、转录组、表观组、微生物组、蛋白组、代谢组等全组学检测服务;并不断跟踪组学技术进展,近几年在单细胞测序技术、空间多组学技术(空间代谢组、空间转录组)、单细胞蛋白组技术、多组学联合分析等方面逐渐取得综合优势。
2017年,基于多组学领域多年的技术积累与沉淀,进入分子诊断领域,聚焦生殖遗传,主攻染色体遗传病、单基因遗传病以及不孕不育相关遗传病,搭建闭环式的出生缺陷防控分子诊断技术体系与产品体系,致力于优生优育,幸福中国家庭。欧易生物先后与中国海洋大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所等机构建立了紧密的产学研合作,与日立诊断产品有限公司共建联合研发实验室,与华东师范大学合作建立院士专家工作站,并陆续获得闵行区研发机构、闵行区科技小巨人企业、上海市科技小巨人企业等资质。还获得知识产权管理体系认证企业资质,总授权发明专利27项、在审发明专利36项、授权软件著作权143项。
“欧易生物”始终坚守“硬数据,好服务”的价值理念,高度重视数据质量及客户服务体验,不断打造自身的“服务力”,倾听客户心声,珍视客户委托,始终将客户满意作为工作质量评价的首要标准,全力打造“创新多组学”优势品牌。
秉承“正直、开放、务实、奋进”价值观的欧易人,正努力践行“以生物科技,成就他人,造福大众”的企业使命,在生命科学及大健康领域奋发有为,以先进的组学技术服务助力基础研究,推动科技创新;以优秀的精准产品造福大众健康,幸福千万家庭。并为将“欧易生物”打造成“受人尊敬的生物科技公司”而奋斗不息!
产品架构
单细胞测序
单细胞转录组测序
空间转录组测序
Xenium 组织空间原位分析技术
FLEX单细胞转录组测序
单细胞免疫组库(VDJ)
单细胞多模态(ATAC+转录组)
单细胞样本制备试剂盒
酵母文库
泛素E3文库筛选
膜体系文库构建
核体系文库构建
转录因子文库筛选
酵母文库筛选
筛库配套试剂
转录组学
Small RNA测序
真核生物转录组测序
全转录组测序
基因组学
低深度重测序(LcWGS)
简化基因组测序(2b-RAD/Super-GBS)
基因组重测序
外显子测序
微生物组学
单细胞微生物基因组测序
微生物多样性测序
宏基因组测序
疑难样本微生物多样性测序(2bRAD-M)
细菌基因组 de novo 测序
表观组学
RNA甲基化测序(m6A)
935k甲基化芯片
全基因组甲基化测序(WGBS)
简化基因组甲基化测序(MethylRAD)
CUT&Tag测序
蛋白质组学
靶向蛋白质组学(PRM)
修饰蛋白质组学
标记定量蛋白质组学(iTRAQ/TMT)
代谢组学
空间代谢组学
非靶向代谢组学
靶向代谢组
拟靶向代谢组(脂质代谢组学)
多组学服务
多组学联合分析
合作服务平台
RACS-Seq 单细胞拉曼分选-测序耦合系统
细胞服务平台