CRISPR/Cas9整体实验服务
二、CRISPR-Cas系统介绍
CRISPR-Cas系统 The clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats-associated protein systems)是一个细菌及古细菌进化出来用以抵御病毒和质粒入侵的适应性机制。CRISPR-Cas系统的高效基因组编辑功能已被应用于多种生物,包括斑马鱼、小鼠、大鼠、秀丽隐杆线虫、植物及细菌。多个科研小组的研究都显示,与锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活样效应核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases, TALEN)相比较,CRISPR-Cas系统介导的基因组靶向实验在细胞或斑马鱼中具有相似甚至更高的效率。在 II型CRISPR系统 中,CRISPR RNA(crRNA)与转录激活crRNA(Trans-activating crRNA, tracrRNA)退火形成的复合物能特异识别基因组序列,引导Cas9核酸内切酶在目的片段生成DNA双链断裂(double-strand breaks, DSBs)。 这个识别复合体可以通过融合crRNA与tracrRNA序列形成sgRNA(single-guided RNA)进行简化。基因组的靶序列中有长约20bp的片段与crRNA或sgRNA互补配对;靶序列末端的三核苷酸区域PAM(5’-NGG-3’)为Cas9识别位点,是实现剪切功能的关键。
CRISPR-Cas9体系 的RNA-DNA识别机制为基因 组工程研究提供了一项简便而强大的工具。该体系其中一个最重要的优势是Cas9蛋白可在多个不同的gRNA的引导下同时靶向多个基因组位点图 1. CRISPR/Cas9介导的基因组编辑原理图
优势 | |
RNA导向的基因组DNA识别,无需考虑DNA甲基化 | |
较ZFN和TALEN,有相同或更高的基因编辑效率 | |
可同时编辑多个基因(多重靶向编辑) | |
设计简单快速,无需重复构建核酸内切酶 |
图3: 切口酶在结合链生产单链切口的原理图
TALEN与CRISPR-Cas9体系对比 | ||
特性 | TALEN | CRISPR-Cas9 |
识别方式 | 蛋白质–DNA | RNA-DNA |
甲基化敏感性 | 敏感 | 不敏感 |
染色质结构敏感性 | 敏感 | 敏感 |
脱靶效应 | 较少观察到脱靶效应 | 潜在脱靶效应高于 TALEN 及ZFN |
多靶点操作 | 极少用 | 可用 |
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