QTL定位
数量性状在遗传上是由很多基因控制的，其中每个基因对表现型具有相对小的效应，但很大程度上受环境因素影响。控制数量性状的主效基因位点通常记为QTL (Quantitative Trait Loci)。分子标记连锁图谱的大量出现，使得我们可以像研究质量性状基因一样研究数量性状基因，也可以把单个数量性状基因定位在染色体上，并估计其遗传效应，这一过程称为QTL作图或定位。

基因组检测方式

基因芯片、全基因组测序、简化基因组测序
群体类型

连锁群体，包括F2群体、BC群体、RIL群体、DH群体、CP群体等等
群体大小

推荐群体大小200左右，不少于150
研究趋势

构建遗传图谱，辅助基因组组装 与GWAS相结合，挖掘候选基因

植物案例分析

提高玉米种子在低温下的出苗能力是一个非常重要的育种目标。该研究利用4个低温发芽能力不同的亲本构建了3个F2:3群体，通过玉米全基因组6K基因分型芯片获得基因型，利用2,693个SNP标记构建一致性遗传连锁图谱，在10℃鉴定5个低温出苗能力相关表型，QTL定位结果获得43个QTL和３个Meta-QTL（mQTL），这些结果为在mQTL区域内克隆基因及发现玉米种子萌发过程的耐寒性分子机制提供了基础。

1、4个玉米自交系亲本和3个F2:3群体
2、低温发芽表型鉴定，遗传力及相关性分析；玉米6K芯片基因分型，2693个SNP构遗传连锁图谱
3、QTL定位及meta-QTL分析
4、Q PCR验证候选基因

水产案例分析

营养性状是长牡蛎(C.gigas)在工业上的重要经济性状，但目前对于其营养特性的遗传研究还很少。本研究通过GBS测序，绘制了一个高密度的C.gigas遗传图谱。基于连锁图谱与牡蛎基因组的高共线性，首次成功将近70%的牡蛎基因组序列组装到染色体上。此外，本研究对生长和营养性状进行QTL定位，后者包括糖原、氨基酸(AA)和脂肪酸(FA)。检测到41个QTLs，在QTL区间鉴定出6个候选基因。本研究将促进长牡蛎重要经济性状的遗传解析和分子育种。

1、2个长牡蛎亲本和169个全同胞F1代

2、生长及营养表型鉴定及分析 ；GBS基因分型，5094个SNP构遗传连锁图谱

3、生长及营养性状
4、QTL定位Q PCR验证候选基因