特别提示:包括SplintR DNA连接酶在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:SplintR DNA连接酶
英文名称:SplintR DNA Ligase
产品货号:MT0060
产品规格:1250U|5000U
SplintR DNA连接酶能够高效催化相邻的DNA核苷酸的连接,这个连接过程需要一条互补的RNA在两条DNA单链间起“夹板”或“桥梁”的固定作用。PBCV DNA连接酶的这种活性远远优于传统的T4 DNA连接酶,有助于miRNAs和mRNAs,包括SNPs在内的研究方法的创新。另外,在二代测序和分子诊断等众多领域中,PBCV DNA连接酶是富集目的基因的理想选择。它具有稳定的生物活性,对 RNA 介导固定的DNA 底物亲和性强(米氏常数Km = 1nM),能够在复杂的混合物中检测到亚纳摩尔级的特定RNA。因此,在RNA检测技术中,PBCV DNA连接酶不失为最佳选择用酶。
产品组成:
组分 |
1250U |
5000U |
SplintR DNA Ligase(25 U/μl) |
50μl |
200μl |
10×SplintR Ligation Buffer |
250μl |
1ml |
储存条件:-20℃可保存3年。
产品应用:
· 单链DNA的连接
· 基于探针法的miRNA的检测
· SNP或剪接体的检测
· RASL分析
活性定义:1单位指20μl反应体系中,1×SplintR连接酶反应缓冲液,16℃ 条件下,15 分钟内能使 2 pmol的DNA:RNA 杂交底物连接反应完成50%所需的酶量。
反应温度及失活:该酶的最佳反应温度为25度,可在16-37度之间优化,37度可明显提高反应的特异性;该酶在65℃ 加热20分钟即可失活。
使用注意事项:
1.1×SplintR Ligation Buffer:50mM Tris-HCl pH 7.5,5mM MgCl2,10mM DTT。
2.该酶对ATP的要求比较宽泛,10-100uM ATP范围内都可发挥活性,5mM Mg2+可显著增加连接产物的量,最佳ph为7.5~8.0。
3.该酶对一价阳离子非常敏感,如Nacl或KCl的浓度应低于50mM,100mM的Nacl会完全抑制连接反应。
4.该酶的反应温度为16~37℃,随着温度的上升酶活性会提高,但此时腺苷化产物也随之增加,最佳温度为25 ℃。
5.连接效率随着夹板RNA长度的减少而降低,当长度小于等于10nt时,连接效率为零。
6.供体的5’端第一个碱基为“A/T”时连接效率最高。
7.受体的3’端第一个碱基为“T”时连接效率最高,3’端第一个碱基为“G”时连接效率最差。
使用方法:
1.底物和夹板退火
建议反应体系中底物浓度在50 nM~2μM 之间,体系中酶的浓度低于1μM(该SplintR酶为 10μM)。在连接反应中,酶的浓度可设为底物浓度的2~3 倍。将等摩尔浓度的底物混合均匀,75℃ 2分钟后缓慢降温至室温。
2.连接反应
退火后产物(1μM)————————————2μl
10× SplintR Ligation Buffer 2——————2μl
SplintR DNA Ligase————————————1μl
灭菌水——————————————————up to 20μl
25℃反应15~60分钟。
3.65℃加热20分钟,使酶失活。
别名:PBCV DNA连接酶;Chorella病毒DNA连接酶
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产品特点:
1.即开即用,不需要用户单独配置。
2.可用于制备RNase-free的DNase。本产品为粗制品,可能含残留的RNase,不能直接用于清除RNA样品中的DNA。
3.本产品可直接用于DNase I Footprinting实验、缺口平移(Nick Translation)、制备DNA随机片断文库、制备TUNEL检测中的阳性对照。
储存条件:低温运输、-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
本产品可用于DNase I Footprinting实验、缺口平移(Nick Translation)、制备DNA随机片断文库、TUNEL检测中剪切基因组DNA作为阳性对照。具体使用方法请参考相关资料。
注意:本产品浓度较高,如需对其进行稀释,需要自备DNase I储存液。
DNase I储存液的配方:50mM Tris-acetate(pH7.5),10mM CaCl₂,50%(v/v)甘油。
附录:
1.DNase I
活性定义:37℃10分钟内,将能够完全降解1μg pBR322质粒DNA所需的酶量定义为1个活性单位。
2.DNase I活性检测条件:40mM Tris-HCl(pH8.0),10mM MgSO4,1mM CaCl2,1μg of pBR322 DNA。
3.纯度:不含其它DNA内切酶和外切酶。
4.DNase I酶储存溶液:50mM Tris-acetate(pH7.5),10mM CaCl2,50%(v/v)甘油。
5.DNase I酶反应液(10×):100mM Tris-HCl(pH7.5 at 25℃),25mM MgCl2,1mM CaCl2。
6.失活或抑制:加入EDTA至终浓度为2.5mM后,65℃加热10分钟可使DNase I失活。酚氯fǎng抽提也可以使DNase I失活。金属离子螯合剂,达到毫摩尔/升浓度的锌离子、0.1%的SDS、DTT、巯基乙醇等还原剂,50-100mM以上盐浓度均对DNase I有显著抑制作用。
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