特别提示:包括溴化乙锭清除剂(EB清除剂)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:溴化乙锭清除剂(EB清除剂)
英文名称:EB scavenger
产品货号:BTN3092
产品规格:100次
本品通过与溴化乙锭(EB)分子中的氨基反应和断开EB分子中的含氮杂环而有效破坏EB的分子结构,达到去除EB污染的目的,适用于清除溶液和物体表面污染的EB。
产品特点:
1. 能消除EB的荧光,并使其致突变性降低99%以上。
2.适用范围广泛,可用于含EB污染的水、氯化铯溶液、电泳缓冲液(TAE、TBE、MOPS等)、有机溶剂(乙醇、异丙醇、异戊醇、异丁醇等)和受污染的多种物体表面(玻璃、不锈钢、塑料、地板、紫外滤光片等)。
3. 使用简单、方便、迅速。
4. 无色或浅黄色透明液体、无毒但有腐蚀性和刺激性气味。
5. 本品暴露于空气中的时间不宜过长,使用完毕请立即密封、保存于避光、通风处。
产品组成:
成分 |
规格 |
溶液A |
100ml |
溶液B |
200ml |
说明书 |
1份 |
储存条件:室温保存及运输,有效期一年。
使用方法:
一:清除水溶性溶液(如水、Tris、MOPS、氯化铯等)中的EB
1. 用水将溶液稀释使其EB浓度低于0.5mg/mL(如果EB浓度已经低于1mg/mL则可以直接进行下一步操作)。
2. 按溶液A:溶液B:被污染溶液=1:2:100的比例将溶液A和溶液B先后加入到溶液中(由于溶液混合初期会产生少量有害气体,所以整个操作必须在化学通风橱中小心操作)。
3. 搅拌五分钟,室温静置20小时。
4. 用自备的饱和碳酸氢钠溶液中和使其pH变为中性。
5. 检查清除程度。
6. 弃废液。
二:清除氯化铯饱和的异丙醇中的EB
1. 用水将氯化铯饱和的异丙醇溶液稀释使其EB浓度低于1mg/mL(如果EB浓度已经低于1mg/mL则可以直接进行下一步操作)。
2. 按氯化铯饱和的异丙醇溶液:EB Scavenger工作液=1:4的比例加入新鲜配制的EB Scavenger工作液(配制方法见五),室温搅拌20小时。
3. 用自备的饱和碳酸氢钠溶液中和,使溶液pH为中性。
4. 倒弃废液。
三:清除异戊醇和丁醇中的EB
1. 用水将溶液稀释使其EB浓度低于1mg/mL(如果EB浓度已经低于1mg/mL则可以直接进行下一步操作)。
2. 按溶液:EB Scavenger工作液=1:4的比例加入新鲜配制的EB Scavenger工作液(配制方法见五),溶液分成两相,室温搅拌72小时。
3. 2克活性炭/100mL混合液的比例加入自备活性炭,再搅拌30分钟。
4. 过滤去活性炭。
5. 用饱和碳酸氢钠中和液体混合液体使pH变为中性。
6. 倒弃废液。
四:清除物体表面的EB
1. 用浸泡过新鲜EB Scavenger工作液(配制方法见五)的纸巾擦洗物体表面污染处5次,每次更换新的纸巾。由于工作液pH为1.8,如果物体表面不耐酸(如玻璃、不锈钢、地板等),直接进入第二步操作。但一般紫外透射滤光片可以直接用工作液处理。
2. 再用浸泡过水的纸巾擦洗物体表面污染处5次,每次更换新的纸巾。
3. 用紫外灯检查清洁效果,如果看不见EB荧光,可以进行下一步操作。如果还有可见的EB荧光,则重复第二步。(对不便于直接用紫外灯照射的污染处,可以将所用的纸巾中的溶液挤出,放置在紫外灯下比较荧光的强弱,一般荧光会逐渐变弱)。
4. 风干清洁过的物体表面。
5. 将用过的纸巾浸泡在EB Scavenger工作液中,静置至少一小时降解EB。
6. 丢弃纸巾。
7. 用自备的饱和碳酸氢钠溶液中和工作液,使其pH为中性。
8. 倒弃废液。
五:新鲜EB Scavenger工作液的配制
1. 估计工作液的用量。
2. 按溶液A:溶液B:水=1:2:30的比例在化学通风橱中先后将水,溶液A和溶液B加入到大小合适的容器中室温搅拌10分钟混匀(由于配制时会产生少量有害气体,所以整个操作必须在化学通风橱中小心操作)。
3. 立即按上面的各种情况使用新鲜配制的工作液。使用者需戴手套,溅到皮肤上后立即用自来水冲洗。
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名称:一站式DNA非变性PAGE电泳套装
货号:BTN100205
规格:30次
本品就是专门用于非变性PAGE的试剂。非变性PAGE电泳是研究SSCP-PCR(single-strand conformation polymorphism-PCR、单链PCR片段构象多态性)和凝胶滞阻(Gel Shift)的重要研究手段,因为在非变性PAGE中,DNA的迁移率除跟长短相关外,还跟其构象和结合的蛋白质相关。
产品特点:
1.一站式,用户只需要准备水和样品,十分方便。
2. 安全,免去了实验人员接触粉末状的剧毒物品。
3. 灵活,高浓度的溶液可用于配制各种浓度的PAGE胶,分开提供的和甲叉双可用于配制各种交联度的PAGE胶。
4. PAGE电泳后可直接用于银染等后续试验。
产品组成:
成分 |
规格 |
保存 |
|
60g |
室温 |
甲叉双 |
2g |
室温 |
TEMED |
1.5ml |
4℃,避光 |
过硫酸铵(干粉) |
1g |
室温 |
非变性PAGE上样液,2× |
1ml |
4℃ |
10×TBE(BTN90313) |
250ml |
室温 |
说明书 |
1份 |
|
储存条件:常温运输,保存条件见上表,有效期一年。
使用方法:
用于SSCP-PCR分析的非变性PAGE电泳(其他应用请相应修改参数)
一、PAGE浓度的选择:最好使用浓度为5-12%的胶,因为SSCP-PCR的扩增长度一般在150-200bp之间,而5%的PAGE的有效分辨范围为80-500bp、8%的PAGE的有效分辨范围为60-400bp、12%的PAGE的有效分辨范围为40-200bp。
二、PAGE交联度的选择:交联度越低,孔径越大,对DNA分子构象的变化越灵敏,SSCP分辨率越高,但过低则胶太软,不好进行电泳后的后续操作,所以一般选择1-2%的交联度(即:甲叉双在49:1到48:2之间)。
三、体积的选择:SSCP-PCR检测需要长约30-40cm的测序胶板,可以结合梳子的厚度,计算胶的体积。
操作:
1. 配制PAGE胶(这是配制100mL胶的用量,配制更大体积的胶则需以此用量为基础按比例增加)
A:新鲜配制10%的APS(过硫酸铵):按每0.1克过硫酸铵干粉加1mL超纯水的比例将水加到装有硫酸铵干粉的1.5mL EP管中,摇晃到粉末全部溶解。配制好的10%的APS溶液可以在4℃存放一周。
B:新鲜配制适当交联度29:1的30%的-甲叉双溶液(AB溶液,下同):在本产品提供的装有60 g干粉的塑料瓶中加入146mL自备的去离子水和全部的甲叉双,充分摇晃直到溶解(约需10-20分钟),即得到30%的AB(29:1)溶液。此溶液最好在一个月内用完,必须4℃避光保存。
C:配SSCP PAGE胶:在一个250mL的三角瓶中,先按下表的用量加入去离子水、30% AB溶液溶液和10×TBE缓冲液。单体溶液具有神经毒性,一定要戴手套操作。
PAGE胶浓度 |
各成分用量(单位:ml) |
总体积(ml) |
去离子水 |
30%AB溶液 |
10×TBE缓冲液 |
5% |
73.4 |
16.6 |
10.0 |
100 |
6% |
70.0 |
20.0 |
10.0 |
100 |
7% |
66.7 |
23.3 |
10.0 |
100 |
8% |
63.3 |
26.7 |
10.0 |
100 |
9% |
60.0 |
30.0 |
10.0 |
100 |
10% |
56.7 |
33.3 |
10.0 |
100 |
11% |
53.3 |
36.7 |
10.0 |
100 |
12% |
50.0 |
40.0 |
10.0 |
100 |
注:有大量文献报道PAGE胶中加入5%-10%的甘油能提高某些位点的分辨率。如果选择加入10%的甘油,则减少去离子水的用量10mL,同时加入10mL甘油。
D:摇晃混匀。最好能抽真空10-15分钟以去除溶液中的氧气(氧气能抑制聚合反应),无条件也可以不脱氧。
E:加入500μL 10%APS和100μL TEMED,迅速摇匀后倒胶。
F:在胶的液面距离达到顶部时停止灌胶,插入梳子。
G:室温聚合30-60分钟(低温抑制聚合反应)。
H: 拔出梳子,用1×TEB液冲洗加样孔。
I: 放4℃冰箱预冷30分钟-12小时。为了防止胶收缩,最好顶部加少量1×TBE缓冲液。预冷的胶有利于保持单链DNA的构型。
2. 将预冷的凝胶板固定在电泳装置上,往上槽和下槽中加入足够1×TEB电泳液。
3. 取3-5μl SSCP-PCR样品,加入等体积2×非变性PAGE上样液,85℃处理5分钟后冰浴。用前短暂离心后取2μl上样。
4.连接电源线,打开电源开关。如果PAGE中不含甘油,则使用25W的功率,电泳5-7小时(对3—40cm长的PAGE胶而言)。如果使用含甘油的PAGE,则使用8W的功率,电泳16-18小时。由于温度变化过大会改变DNA构型,所以电泳时最好能保持恒温。对不含甘油的PAGE,最好恒温在4℃、对含甘油的PAGE,最好恒温在25℃。
5. 终止电泳,取出凝胶进行后续的处理(如银染)。
疑难解答:
一、为何SSCP-PCR带型有复合条带?
原因之一:可能是残留的PCR引物跟单链的DNA结合形成迁移率不同的条带。解决方法是稀释PCR或电泳前将PCR产物进行纯化。
原因之二:可能是PCR产物用量过高,彼此复性。解决办法是将PCR产物稀释后4-8倍后使用。
二、如何提高电泳分辨率?
可以在配胶时加入甘油(终浓度为5%-10%),因为甘油是弱变性剂,能部分展开DNA折叠结构,增加表面积,增加电泳时位移差异。但加入甘油后粘性变大,电泳速度变慢,因此只适合室温电泳使用,不要4℃电泳。如果条件允许,最好同时做加甘油和不加甘油的电泳实验。
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