特别提示:包括DNA Marker(100~5000bp)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:DNA Marker(100~5000bp)
英文名称:DNA Ladder (100~5000bp)
产品货号:GS0028
产品规格:500μl
储存条件:冷冻(-20℃)
概述
DNA分子量标准(100-5000 bp)为即用型产品,混合有9条单一的DNA条带,分别为:100,250,500,750,1000,1500,2000,3000,5000 bp。其中500 bp条带亮度增强。
特点
- 条带亮度均匀,带型清晰、稳定性强,-20℃保存2年以上,经常使用可4℃甚至室温放置。Marker已含上样缓冲液和示踪染料,可直接电泳,方便使用。
应用
琼脂糖凝胶电泳
使用说明
推荐使用:3-5μl/孔,可以根据胶孔大小,酌情加减用量。
组份
10mMTris-HCl(pH 7.6);10mMEDTA;0.01%Bromophenol Blue and 5%glycerol
技术规格
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关注
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名称:一站式DNA非变性PAGE电泳套装
货号:BTN100205
规格:30次
本品就是专门用于非变性PAGE的试剂。非变性PAGE电泳是研究SSCP-PCR(single-strand conformation polymorphism-PCR、单链PCR片段构象多态性)和凝胶滞阻(Gel Shift)的重要研究手段,因为在非变性PAGE中,DNA的迁移率除跟长短相关外,还跟其构象和结合的蛋白质相关。
产品特点:
1.一站式,用户只需要准备水和样品,十分方便。
2. 安全,免去了实验人员接触粉末状的剧毒物品。
3. 灵活,高浓度的溶液可用于配制各种浓度的PAGE胶,分开提供的和甲叉双可用于配制各种交联度的PAGE胶。
4. PAGE电泳后可直接用于银染等后续试验。
产品组成:
成分 |
规格 |
保存 |
|
60g |
室温 |
甲叉双 |
2g |
室温 |
TEMED |
1.5ml |
4℃,避光 |
过硫酸铵(干粉) |
1g |
室温 |
非变性PAGE上样液,2× |
1ml |
4℃ |
10×TBE(BTN90313) |
250ml |
室温 |
说明书 |
1份 |
|
储存条件:常温运输,保存条件见上表,有效期一年。
使用方法:
用于SSCP-PCR分析的非变性PAGE电泳(其他应用请相应修改参数)
一、PAGE浓度的选择:最好使用浓度为5-12%的胶,因为SSCP-PCR的扩增长度一般在150-200bp之间,而5%的PAGE的有效分辨范围为80-500bp、8%的PAGE的有效分辨范围为60-400bp、12%的PAGE的有效分辨范围为40-200bp。
二、PAGE交联度的选择:交联度越低,孔径越大,对DNA分子构象的变化越灵敏,SSCP分辨率越高,但过低则胶太软,不好进行电泳后的后续操作,所以一般选择1-2%的交联度(即:甲叉双在49:1到48:2之间)。
三、体积的选择:SSCP-PCR检测需要长约30-40cm的测序胶板,可以结合梳子的厚度,计算胶的体积。
操作:
1. 配制PAGE胶(这是配制100mL胶的用量,配制更大体积的胶则需以此用量为基础按比例增加)
A:新鲜配制10%的APS(过硫酸铵):按每0.1克过硫酸铵干粉加1mL超纯水的比例将水加到装有硫酸铵干粉的1.5mL EP管中,摇晃到粉末全部溶解。配制好的10%的APS溶液可以在4℃存放一周。
B:新鲜配制适当交联度29:1的30%的-甲叉双溶液(AB溶液,下同):在本产品提供的装有60 g干粉的塑料瓶中加入146mL自备的去离子水和全部的甲叉双,充分摇晃直到溶解(约需10-20分钟),即得到30%的AB(29:1)溶液。此溶液最好在一个月内用完,必须4℃避光保存。
C:配SSCP PAGE胶:在一个250mL的三角瓶中,先按下表的用量加入去离子水、30% AB溶液溶液和10×TBE缓冲液。单体溶液具有神经毒性,一定要戴手套操作。
PAGE胶浓度 |
各成分用量(单位:ml) |
总体积(ml) |
去离子水 |
30%AB溶液 |
10×TBE缓冲液 |
5% |
73.4 |
16.6 |
10.0 |
100 |
6% |
70.0 |
20.0 |
10.0 |
100 |
7% |
66.7 |
23.3 |
10.0 |
100 |
8% |
63.3 |
26.7 |
10.0 |
100 |
9% |
60.0 |
30.0 |
10.0 |
100 |
10% |
56.7 |
33.3 |
10.0 |
100 |
11% |
53.3 |
36.7 |
10.0 |
100 |
12% |
50.0 |
40.0 |
10.0 |
100 |
注:有大量文献报道PAGE胶中加入5%-10%的甘油能提高某些位点的分辨率。如果选择加入10%的甘油,则减少去离子水的用量10mL,同时加入10mL甘油。
D:摇晃混匀。最好能抽真空10-15分钟以去除溶液中的氧气(氧气能抑制聚合反应),无条件也可以不脱氧。
E:加入500μL 10%APS和100μL TEMED,迅速摇匀后倒胶。
F:在胶的液面距离达到顶部时停止灌胶,插入梳子。
G:室温聚合30-60分钟(低温抑制聚合反应)。
H: 拔出梳子,用1×TEB液冲洗加样孔。
I: 放4℃冰箱预冷30分钟-12小时。为了防止胶收缩,最好顶部加少量1×TBE缓冲液。预冷的胶有利于保持单链DNA的构型。
2. 将预冷的凝胶板固定在电泳装置上,往上槽和下槽中加入足够1×TEB电泳液。
3. 取3-5μl SSCP-PCR样品,加入等体积2×非变性PAGE上样液,85℃处理5分钟后冰浴。用前短暂离心后取2μl上样。
4.连接电源线,打开电源开关。如果PAGE中不含甘油,则使用25W的功率,电泳5-7小时(对3—40cm长的PAGE胶而言)。如果使用含甘油的PAGE,则使用8W的功率,电泳16-18小时。由于温度变化过大会改变DNA构型,所以电泳时最好能保持恒温。对不含甘油的PAGE,最好恒温在4℃、对含甘油的PAGE,最好恒温在25℃。
5. 终止电泳,取出凝胶进行后续的处理(如银染)。
疑难解答:
一、为何SSCP-PCR带型有复合条带?
原因之一:可能是残留的PCR引物跟单链的DNA结合形成迁移率不同的条带。解决方法是稀释PCR或电泳前将PCR产物进行纯化。
原因之二:可能是PCR产物用量过高,彼此复性。解决办法是将PCR产物稀释后4-8倍后使用。
二、如何提高电泳分辨率?
可以在配胶时加入甘油(终浓度为5%-10%),因为甘油是弱变性剂,能部分展开DNA折叠结构,增加表面积,增加电泳时位移差异。但加入甘油后粘性变大,电泳速度变慢,因此只适合室温电泳使用,不要4℃电泳。如果条件允许,最好同时做加甘油和不加甘油的电泳实验。