特别提示:包括实时荧光定量PCR的预混体系(探针法)(高含量ROX校正染料)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:实时荧光定量PCR的预混体系(探针法)(高含量ROX校正染料)
英文名称:BaldStar TaqMan Mixture(High ROX)
产品货号:WE0146
产品规格:5ml
本品是专用于探针法(TaqMan,Molecular Beacon等)实时荧光定量PCR的预混体系,浓度为2×,包含BaldStar Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、dNTPs和Mg2+,操作简单方便。主要用于基因组DNA靶序列和RNA反转录后cDNA靶序列检测,如基因表达分析,拷贝数分析,SNP基因型分析等,适用于不同类型探针法荧光定量。本品含有的BaldStar Taq DNA Polymerase是一种经化学修饰的、全新高效热启动酶,在常温下没有聚合酶活性,有效避免了在常温条件下由引物和模板非特异性结合或引物二聚体而产生的非特异性扩增,酶的激活须在95℃下孵育10分钟。独特的PCR缓冲体系与热启动酶的组合,显著提高了PCR的扩增效率,荧光信号更强,灵敏度更高,可以检测单拷贝的模板。使用本产品可以得到更广的线性范围,对目的基因定量更准确。适用于无需ROX作为校正染料的所有荧光定量PCR仪。
ROX染料用于校正定量PCR仪孔与孔之间产生的荧光信号误差,一般用于ABI、Stratagene等公司的Real Time PCR 扩增仪。不同仪器的激发光学系统有所不同,因此ROX染料的浓度必须与相应的荧光定量PCR仪相匹配。
不需要ROX校正的仪器(WE0144):
Roche LightCycler 480,Roche LightCyler 96,Bio-rad iCyler iQ,iQ5,CFX96等。
需要Low ROX校正的仪器(WE0145):
ABI Prism7500/7500 Fast,QuantStudio® 3 System,QuantStudio® 5 System,QuantStudio® 6 Flex System,QuantStudio® 7 Flex System,ViiA 7 system,Stratagene Mx3000/Mx3005P,Corbett Rotor Gene 3000等。
需要High ROX校正的仪器(WE0146):
ABI Prism7000/7300/7700/7900,Eppendorf,ABI Step One/Step One Plus等。
产品组成:
组份 |
WE0144-5ml |
WE0145-5ml |
WE0146-5ml |
2×BaldStar TaqMan Mixture |
5×1ml |
5×1ml |
5×1ml |
50×Low ROX |
- |
200μl |
- |
50×High ROX |
- |
- |
200μl |
ddH2O |
5×1ml |
5×1ml |
5×1ml |
注意事项:
1.使用前请上下颠倒轻轻混匀,尽量避免起泡,并经短暂离心后使用。
2.避免反复冻融本品,反复冻融可能使产品性能下降。本产品长期保存可置于-20℃,避光。如果在短期内需要频繁使用,可在2~8℃保存。
使用方法:
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系:
试剂 |
50μl反应体系 |
终浓度 |
2×BaldStar Taq Man Mixture |
25μl |
1× |
Forward Primer,10μM |
1μl |
0.2μM |
Reverse Primer,10μM |
1μl |
0.2μM |
Probe,10μM |
1μl |
0.2μM |
Template DNA |
2μl |
|
50×Low ROX or High ROX(可选) |
1μl |
1× |
ddH2O |
up to 50μl |
|
注意:
1)通常引物浓度以0.2μM可以得到较好结果,可以在0.1-1.0μM作为设定范围的参考。
2)使用的探针浓度,与使用的荧光定量PCR仪、探针种类、荧光标记物质种类有关,实际使用时请参照仪器说明书,或各荧光探针的具体使用要求进行浓度的调节。
3)通常DNA模板的量以10-100ng基因组DNA或1-10ng cDNA为参照,因不同物种的模板中含有的目的基因拷贝数不同,可对模板进行梯度稀释,以确定最佳的模板使用量。
4)不同仪器的激发光学系统有所不同,根据使用荧光定量的仪器选择加入50× Low ROX or 50×High ROX。
2、PCR反应程序:
注意!本产品预变性反应必须在95℃ 10分钟下完成!
两步法PCR:
步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
预变性 |
95℃ |
10 min |
|
变性 |
95℃ |
15 s |
35-40个循环 |
退火/延伸 |
60℃ |
1 min |
注意:
1)本产品所采用的热启动酶须在预变性95℃、10 min条件下实现酶的活化。
2)建议采用两步法PCR反应程序,若因使用Tm值较低的引物等原因,得不到良好的实验结果时,可尝试进行三步法PCR扩增,退火温度请以 56℃-64℃的范围作为设定参考。
储存条件:-20℃,避免反复冻融
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名称:SP6体外转录试剂盒
货号:BTN91107
规格:50次
本试剂盒是基于SP6 RNA聚合酶的RNA体外转录试剂盒,它利用含有SP6启动子的模版DNA,以NTP为底物,从SP6启动子下游开始合成与模版DNA中一条链互补的RNA,简单快速获得大量的RNA分子。
产品特点:
1. 即开即用,用户只需提供含SP6启动子的DNA模板即可以进行体外转录实验,不需要单独准备每一个成份。
2. 单溶液预配液,减少加样次数,避免了操作误差,增加了可重复性。
3. 模版DNA可以是线性化的质粒DNA,也可以是PCR扩增产物。
4.可以合成的RNA的最佳长度在20nt到2000nt之间。
5.产品配方经过精心优化,每μg DNA模版可以合成2-6μg RNA。
得到的RNA可以用于RNA 结构研究、核酶生物化学、体外翻译、RNA-蛋白质相互作用、反义技术、SELEX技术和RNA干扰(RNAi)等实验。
试剂盒组成:
成分 |
规格 |
转录预配液(2×) |
0.5mL |
阳性对照DNA(1.3 kb片段) |
20μL(10 ng/μL) |
SP6 RNA聚合酶混合液 |
50μl |
RNase-free水 |
1ml |
说明书 |
1份 |
储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一、制备DNA模板
PCR片段和质粒DNA都可以用作体外转录的模板,但是必须注意以下几点。一是必须使用线性化的DNA。如果是质粒DNA,则必须先用适当的限制性内切酶切成线状。二是需要转录的DNA序列的上游必须有SP6启动子。如果模板是PCR产物,则可以在设计引物时将SP6启动子序列(5′ATT TAG GTG ACA CTA TAG AGN G 3′)加上,转录其实是从3端G AGN G中的第一个G开始。如果是将DNA片段克隆到载体上,则需要选择有SP6启动子的载体,并且克隆位点必须位于SP6启动子下游。三是需要转录的DNA序列的下游端最好不要是3′突出。如果是3′突出(如选择了Pst I来线性化质粒),则最好用T4 DNA聚合酶修平。四是必须保证DNA模板中没有RNase。由于提取质粒DNA的过程中一般要使用大量的RNase A,因此质粒DNA一般都有严重的RNase A污染,所以在用作模板前,最好采取胶回收得方法回收质粒DNA。并且加入少量总RNA一起保温,然后电泳检测RNA是否被降解,以此判断纯化的DNA模板是否有残留RNase A。
二、体外转录反应
1.在一个RNase-free的塑料离心管中,在室温下(不是在4℃下)按次序加入下列成分:
成分 |
加入量 |
备注 |
DNA模板 |
xμL |
总量在50 ng-1μg(如果模板是PCR片段,建议用50 ng左右;如果模板是质粒DNA,建议用1μg左右;如果用本产品提供的阳性对照,建议用4μL) |
SP6转录预配液(2×) |
10μl |
本成分还含其他促进剂,所以是混合物 |
RNase-free水 |
补水到20μL |
|
注:此为20μL反应体系的用量,对其他反应体系,各成分的用量可以按比例增减。如果需要标记RNA探针,则需要订购NTP分开的试剂盒。如果需要得到加帽RNA,则需要加入自备的加帽修饰核苷酸(本公司有各种加帽修饰核苷酸)。
2. 37℃保温1-2小时。注意:延长保温时间并不能提高产量。
3. 70℃加热10分钟灭活SP6 RNA聚合酶。
4. 取1-3μL电泳检测转录效果。一般1μg DNA可以合成 5-10μg的RNA。
5. 得到的RNA可以放-80℃保存。
若需进一步
去除DNA模板,可参考下列操作步骤,但所用试剂需另行购买,本试剂盒不提供。
1.在体外转录体系中加入3-5U自备的RNase-free DNase(BTN90903;3-5U/μL)。
2. 37℃保温15-30分钟。
3. 补水到100μL。
4. 用等体积(100μL)的Tris饱和酚-lǜ仿抽提一次去除残留的DNase和RNA聚合酶。
5.在上清中加200μL自备的微量核酸沉淀剂(BTN50903;用前需要摇晃混匀),振荡后15000rpm离心3~5分钟,弃上清。
6. 加入1mL 75%乙醇,震荡10秒后15000rpm离心3~5分钟,弃上清。
7. 短暂离心数秒,用枪头吸弃上清。
8. 晾干半分钟,所得沉淀即去除DNA模板后的RNA。可溶于RNase-free水中后立即使用或放-80℃长期保存。
疑难解答:
1. 没有RNA产物。最常见原因是模板有RNase污染,可用纯化的RNA跟模板DNA一起保温,再检测RNA是否降解。还可以增加RNase Inhibitor用量,本试剂盒缓冲液和酶混合液中有RNase inhibitor,如果模板RNase污染严重,可能需要用户补加RNase inhibitor。
2. RNA产量低。最常见的原因是DNA模板。在转录序列的第一个和第二个碱基最好都是G,在前14个碱基内避免有U存在。
3. RNA长度比预期的短。可能是模板序列中有SP6 RNA聚合酶的终止序列。可以改用SP6体外转录试剂盒(启动子也必须改成SP6启动子)。
4. RNA长度比预计的长。SP6 RNA聚合酶跟Taq DNA聚合酶一样,有不依赖于模板的加尾功能,最多有一半的RNA可以带一个或两个碱基的尾巴。如果RNA长度比预计的长很多,使用的模板又是质粒DNA,则可能是质粒DNA线性化不彻底。
5. 5′单磷酸还是三磷酸。如果使用GTP,则得到的RNA是三磷酸,体外转录时如果保温时间太长(如12小时),则有50%的三磷酸会变成单磷酸。如果在转录体系中加入GMP,则SP6 RNA聚合酶将优先使用GMP,所得RNA产物中5′端是单磷酸的比例将大大增加。
6. 如何得到带帽RNA?需加入带帽NTP类似物即可,本公司提供5种供选择。
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