PacBio、Nanopore 三代测序平台
基本信息
产品名称：
PacBio、Nanopore 三代测序平台
英文名称：
国产/进口：
国产
产地/品牌：
北京/诺禾致源
型号：
PacBio Nanopore
参考报价：
询价
销售商：
总点击数：
16596
更新日期：
2020-12-17
产品类别：
性能参数
走近有灵魂的测序，三代测序平台重磅升级！
测序的灵魂是什么？更快、更准、更高通量！
PacBio 与Nanopore 推出重磅升级，邀您感受有灵魂的测序！
官方数据
新芯片在CCS 测序中（构建11 Kb 文库），运行30 h，单芯片达到 Q20 的9~13 Kb 的 HiFi reads 产出约20 Gb（图3，左）；
新芯片在 Continuous Long Read Sequencing (CLR) 模式下（构建35 Kb 文库），运行 15h，单芯片产出达到160 Gb，且有一半以上的reads 大于50 Kb（图3，右）。
作为和 PacBio 分庭抗礼，以纳米孔单分子实时测序技术为核心的Oxford Nanopore 公司，也积极准备了海量更新，意在现有超长读长、超高通量的基础上，重点优化测序准确度，全面升华 Nanopore 测序的“灵魂”。
纳米孔升级
新版 R10 纳米孔拥有两对 Reader heads，通过两次碱基识别的互证来达到更高的准确度，尤其在同
聚物区域的识别准确度大大增加。
碱基识别软件升级
“flip-flop”软件的碱基识别准确性较现有的软件来说，有了不小的提升。对 R9 版本数据重新进行碱基识别，一致准确性可达到Q37。
Nanopore 目前通量最大的平台PromethION 48 能够单次运行48张芯片，72 h 的最大产出能达到7 T。同时，Nanopore 测序在读长上具有明显优势，实际项目中平均读长能达到20~30 Kb，N50 长度更是能达到40~50 Kb。所以当 Nanopore 的超长读长、超大通量两项先天优势，遇上软硬件升级后的高准确性，前途不可限量！
我们的实力
诺禾动植物研究部有丰富的PacBio 及Nanopore 建库测序项目服务经验，已成功交付千余个项目。
PacBio 平 台
目前我们 PacBio 平台单芯片产出能达到20 Gb，而且插入片段长度可以达到18 Kb，Subreads N50 更是能达到25 Kb。此外，我们的PacBio 平台也强势推出了插入片段长度超过20 Kb、Subreads N50突破30 Kb的超长文库，助您解决组装难题（表1，图4）。
诺禾的Nanopore 测序平台采用的是通量最大的型号⸺PromethION，单芯片产出平均能达50 Gb，最高可超过100 Gb，而且平均 读长可达到25 Kb以上，Read length N50更是能超过40 Kb。此外，我们的 Nanopore 平台也有平均读长超40 Kb，Read lengthN50 达到50 Kb以上的Ultra long reads 文库，用更长的读长助您组装更完整的基因组（表2，图5）。
测序的灵魂是什么？更快、更准、更高通量！
PacBio 与Nanopore 推出重磅升级，邀您感受有灵魂的测序！
PacBio 测序平台
PacBio 平台一步步发展，从早期的 RS、RS Ⅱ 平台，到当下市场占有率最高的 Sequel 平台，它的实力有目共睹。首先介绍更富有灵魂的PacBio 测序平台⸺Sequel Ⅱ（图1）。
PacBio 平台一步步发展，从早期的 RS、RS Ⅱ 平台，到当下市场占有率最高的 Sequel 平台，它的实力有目共睹。首先介绍更富有灵魂的PacBio 测序平台⸺Sequel Ⅱ（图1）。
图1 Sequel Ⅱ 平台及其两种模式下读长与准确度的比较
通量升级
PacBio Sequel Ⅱ 平台在一代的基础上，将测序芯片从 SMRT Cell 1M 升级到了 SMRT Cell 8M，用8倍数量的纳米级小孔带给你更高通量的享受，进一步降低了测序成本。
CCS优化
PacBio 公 司 对 Circular Consensus Sequencing（CCS） 模式进行了优化，平衡了 CCS 模式下的读长和准确性， 让我们在享受 CCS 模式带来的 HiFi reads（高准确度reads，环形测序4圈的准确性能达到 99%，如图2）的同时，也能体验到长读长带来的优势。
PacBio Sequel Ⅱ 平台在一代的基础上，将测序芯片从 SMRT Cell 1M 升级到了 SMRT Cell 8M，用8倍数量的纳米级小孔带给你更高通量的享受，进一步降低了测序成本。
CCS优化
PacBio 公 司 对 Circular Consensus Sequencing（CCS） 模式进行了优化，平衡了 CCS 模式下的读长和准确性， 让我们在享受 CCS 模式带来的 HiFi reads（高准确度reads，环形测序4圈的准确性能达到 99%，如图2）的同时，也能体验到长读长带来的优势。
新芯片在CCS 测序中（构建11 Kb 文库），运行30 h，单芯片达到 Q20 的9~13 Kb 的 HiFi reads 产出约20 Gb（图3，左）；
新芯片在 Continuous Long Read Sequencing (CLR) 模式下（构建35 Kb 文库），运行 15h，单芯片产出达到160 Gb，且有一半以上的reads 大于50 Kb（图3，右）。
图3 Sequel Ⅱ 两种测序模式的数据对比
Nanopore 测序平台作为和 PacBio 分庭抗礼，以纳米孔单分子实时测序技术为核心的Oxford Nanopore 公司，也积极准备了海量更新，意在现有超长读长、超高通量的基础上，重点优化测序准确度，全面升华 Nanopore 测序的“灵魂”。
纳米孔升级
新版 R10 纳米孔拥有两对 Reader heads，通过两次碱基识别的互证来达到更高的准确度，尤其在同
聚物区域的识别准确度大大增加。
“flip-flop”软件的碱基识别准确性较现有的软件来说，有了不小的提升。对 R9 版本数据重新进行碱基识别，一致准确性可达到Q37。
测序模式升级
线性测序模式比较类似于 PacBio CCS 测序的概念，这种方法能够将一条链的数条拷贝结合在一起，以获得更高的一致准确度。
线性测序模式比较类似于 PacBio CCS 测序的概念，这种方法能够将一条链的数条拷贝结合在一起，以获得更高的一致准确度。
我们的实力
诺禾动植物研究部有丰富的PacBio 及Nanopore 建库测序项目服务经验，已成功交付千余个项目。
PacBio 平 台
目前我们 PacBio 平台单芯片产出能达到20 Gb，而且插入片段长度可以达到18 Kb，Subreads N50 更是能达到25 Kb。此外，我们的PacBio 平台也强势推出了插入片段长度超过20 Kb、Subreads N50突破30 Kb的超长文库，助您解决组装难题（表1，图4）。
| 物种 | 产出（Gb） | 酶读长 | 插入片段长度 | Subreads N50 |
| 昆虫 | 18.97 | 33028 | 18572 | 25220 |
| 水产1 | 17.48 | 33389 | 17774 | 21075 |
| 水产2 | 18.48 | 34653 | 17194 | 19373 |
| 植物1 | 18.44 | 32339 | 17249 | 20862 |
| 植物2 | 21.27 | 42824 | 15315 | 15813 |
表1 PacBio 下机数据展
Nanopore 平台诺禾的Nanopore 测序平台采用的是通量最大的型号⸺PromethION，单芯片产出平均能达50 Gb，最高可超过100 Gb，而且平均 读长可达到25 Kb以上，Read length N50更是能超过40 Kb。此外，我们的 Nanopore 平台也有平均读长超40 Kb，Read lengthN50 达到50 Kb以上的Ultra long reads 文库，用更长的读长助您组装更完整的基因组（表2，图5）。
| 物种 | 产出（Gb） | 平均读长 | 平均质量值 | Read length N50 | 最长reads 长度及质量值 |
| 植物1 | 43.50 | 25633.0 | 8.2 | 32374 | 218713（7.3） |
| 植物2 | 48.55 | 27914.1 | 8.9 | 40242 | 275138（9.4） |
| 植物3 | 50.48 | 27808.9 | 8.1 | 36547 | 200564（7.7） |
| 哺乳动物 | 47.67 | 26318.2 | 9.0 | 33547 | 234689（9.5） |
| 水产1 | 56.65 | 29296.7 | 9.0 | 42597 | 263591（9.4） |
| 水产2 | 53.59 | 27000.8 | 9.0 | 40023 | 353708（7.2） |
图5 Nanopore reads 长度与质量值分布
作为领先的基因组学产品和服务提供者，我们承诺，用科学的方案设计、领先的测序平台、专业的信息分析及完善的售后服务来确保每一个项目环节都能出色地完成，助力您的科学研究。公司简介
北京诺禾致源科技股份有限公司于2011年3月在北京中关村生命科学园注册成立，专注于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究和人类健康领域的应用，致力于成为全球领先的基因科技产品和服务提供者。企业总部位于北京，在天津、南京、美国、英国和新加坡设有实验室或实验基地，并在香港、美国和英国设有子公司，办公面积逾40'000m2。目前，诺禾致源现已建立一支来自海内外顶级名校、多学科交叉型的高素质综合团队，其中硕士及其以上学历占比60%以上。公司建立了通量规模领先的基因测序平台和高性能计算平台，有效地支撑着生命科学研究和医疗健康两大领域对大数据分析和存储的需求。公司业务覆盖全球6大洲超过60个国家和地区，服务客户超过2,000家，成为基因测序科研服务领域的领先企业。诺禾致源在全球范围内与众多学术机构建立了广泛的合作关系，完成多项具有国际先进水平的基因组学研究工作，截止2019年4月，诺禾致源与项目伙伴合作发表SCI文章总计429篇，累积影响因子大于2838；目前已取得软件著作权149项，专利22项；合作伙伴遍布全球，包括超过1920家科研院所和高校、720余家医院、1430余家医药和农业企业等。
作为目前国内基因测序领域的佼佼者，诺禾致源的业务覆盖生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务，为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。
自成立以来，诺禾致源先后获得国家高新技术企业、北京市科技研究开发机构、北京市专利试点单位、北京市企业技术中心及国家发改委基因检测技术应用示范中心等多项资质与荣誉，并建设有北京市工程实验室。
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