10x Genomics的Visium空间基因表达是一种新颖的分析方法，它将组织学与空间分辨的全转录组基因表达谱分析相结合，可在组织背景下对基因表达进行定位和定量。这种分析基于空间转录组学方法。如今已被广泛采用，并被近40篇同 行评审文献和50多篇预印本引用。目前，Visium空间基因表达分析与任何物种的新鲜冷冻组织切片均兼容。它在文库制 备过程中采用poly A捕获和独特的空间条形码技术。10x Genomics还提供了一种与人和小鼠的福尔马林固定石蜡包埋 （FFPE）组织切片兼容的Visium空间基因表达分析。该方法利用靶向基因的探针对的RNA模板连接，对全转录组进行高度特异且灵敏的检测。这两种分析都采用相同的分析工具和流程（如Space Ranger和Loupe Browser），对Visium空间 数据进行处理和可视化。此外，研究人员可联系10x Genomics的技术专家，专家会就科学和技术咨询、流程优化和故障排查提供支持。

Visium空间基因表达流程实现了全转录组分析（新鲜冷冻组织和FFPE组织）和靶向分析（新鲜冷冻组织），同时保留了空间信息。它在组织结构、组织微环境和细胞群体的背景下提供了基因表达数据。
 

在您的研究中使用Visium空间基因表达的理由

Visium空间基因表达分析具有多个优势，使其成为空间转录组学的最佳产品。具体优势包括：
• 空间分辨率的全转录组检测
– Visium新鲜冷冻组织空间基因表达分析捕获聚腺苷化的mRNA分子，减少因靶向扩增子测序或序列特异性的杂交技术引入的偏好性。Visium FFPE组织空间基因表达分析则采用靶向基因的探针对的RNA模板 连接，对人和小鼠FFPE组织切片中的全转录组进行高度特异且灵敏的检测。
• 久经考验的技术
– Visium空间基因表达解决方案作为一种基本技术，被多篇同行评审的论文所引用，出现在高质量的 期刊上，包括《Science》、《Cell》、《Nature Neuroscience》、《Nature Communications》和《Nature Protocols》。
• 无需特殊的设备
– Visium空间基因表达不需要任何特殊的设备，可在拥有标准的切片设备、带有图像捕获功能的显微镜 以及测序仪器的任何实验室或中心实验室中采用。
• 完整的数据分析解决方案
– Visium空间基因表达包含数据分析流程以及先进的数据可视化软件。后者与大多数台式算机兼容，且包含差异基因表达分析的工具。
• 高重复性和高灵敏度
– 使用Visium核心技术的文献已证明，相邻组织切片之间的数据重复性r = 0.97 (2)。将采用Visium流程测序的mRNA与通过传统
RNA测序的mRNA进行比较后发现，95%的转录本在两种检测方法中都能发现，突出了该流程的检测灵敏度。
• 高空间分辨率
– Visium玻片上的每个捕获区域含有约5,000个带有条形码的mRNA基因表达数据点，而每个数据点平均 可捕获1-10个细胞，具体取决于组织类型。Visium玻片上的每个捕获区域大小为6.5 x 6.5 mm，为研究许多不同的生物 和组织类型带来了灵活性。
• 适用于几十种组织的优化条件
– Visium新鲜冷冻组织空间基因表达流程已针对多个物种的健康和疾病组织进行了优化， 包括人、小鼠、大鼠和斑马鱼。关于针对Visium分析优化的新鲜冷冻组织的最新列表，请访问我们的支持网页。Visium FFPE空间基因表达流程不需要单独的组织优化，已在多种人和小鼠的健康和疾病组织中进行了检验。
• 广泛的支持资源
– 10x Genomics提供了广泛的支持资源，从经过Visium空间基因表达培训的技术专家，到免费提供的 视频和文档，这些视频和文档可指导新用户完成Visium流程。
• 认证服务供应商
– 通过认证服务供应商更加轻松地实现完整的Visium空间基因表达流程，这些第三方机构经过10x Genomics的专门培训和认证，可支持空间基因表达分析的研究项目。
• 产品质量经过认证 – 10x Genomics的产品开发和制造工艺已通过ISO 9001:2015认证。
• 灵活的选择，适合大型数据集或概念验证研究
– 10x Genomics提供入门级的Gateway玻片，让您能够在两个组织样本 上体验空间转录组学带来的丰富数据，以便了解这项技术如何让您的研究受益。这让研究人员能够灵活开展他们的概念验证研究，而无需浪费资源。对于较大的数据集，我们提供单张和四张玻片的试剂盒，分别可以运行4个和16个样本。

北京怡美通德科技发展有限公司是10x Genomics的官方授权代理商，同时也是10x Genomics 2022年金牌代理商，代理美国10x Genomics公司生产的Chromium单细胞测序建库系列产品，Visium空间转录组系列产品以及Xenium组织空间原位分析系统，提供仪器配套的试剂耗材供货、产品演示实验、产品安装、使用培训以及售前售后技术咨询、生物信息学分析等相关技术服务。如果您想了解更多关于10x Genomics的信息，欢迎联系我们，电话: 010-84409661，Email: marketing@emtd.com.cn。