多空间组学分析
我们对不同的组织类型和细胞标记方法发展了多套空间转录组策略,针对(1)速冻+H&E染色(2)速冻+抗体荧光标记(3)速冻+PFA固定+抗体荧光标记(4)PFA灌注+蔗糖沉淀+冰冻切片+抗体染色(5)石蜡切片+H&E染色等。特别是针对抗体荧光标记识别的细胞,突破组织RNA酶在抗体长时间标记时对RNA的降解瓶颈,保证RNA在激光显微切割后还保持高质量的RNA,从而实现高质量转录组测序,平均每个样品获得约15000个基因的定量表达数据。
由于组织的高度异质性,研究者经常需要对组织中的特定细胞类型进行研究,这就对技术提出了单细胞分辨的需求,LCMomics 技术是目前少有的具有单细胞分辨的空间多组学技术。
目前市场上提供的空间多组学技术服务主要集中于空间转录组,需要直接在组织切片上进行生化反应。LCMomics技术原理是先将目标细胞分选出来,下游可以接各类的多组学技术,是灵活度技术策略。
LCMomics技术能对不同制样方法的组织,如液氮速冻组织、石蜡包埋组织和RNAlater保存组织进行空间多组学分析,分析的细胞可以采用各种标记方法,如H&E染色,抗体荧光标记,荧光蛋白标记基因等。
LCMomics 技术是目前可以兼容所有物种分析的平台。