Illumina DNA Prep with Enrichment
规格
分析时间 | 约6.5小时 |
手动操作时间 | 约2小时 |
起始量 | 10-1000 ng 高质量基因组DNA或5—1000 ng FFPE DNA(直接样本血液和唾液,可查看参考手册) |
说明 | 一种快速、灵活的研究解决方案,可实现全外显子组、定制和固定基因集panel靶向测序。 |
内容说明 | 外显子组:45 Mb外显子内容(RefSeq、CCDS和Ensembl编码内容数据库覆盖≥ 98%)。 定制:0.5-15 Mb感兴趣基因组内容。 固定panel:内容因panel而异。 |
On-Target Reads | ≥85% (for exome panel) |
Uniformity | ≥90% (% coverage at 20x for 4 Gb; for exome panel) |
作用机制 | 磁珠结合的转座酶和杂交捕获化学技术 |
多重分析 | 多达384个可用的唯一双标签。对多达12重预富集文库混合池进行测试。 |
反应次数 | Custom workflow: 16 or 96 samples |
方法 | 靶向富集, 定制测序, 外显子组测序, 靶向DNA测序 |
物种类别 | 人类, 其它 |
特殊的样本类型 | 唾液, 血液, FFPE组织 |
变异种类 | 杂合性缺失 (LOH), 体细胞变异, 生殖系变异, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) |
系统兼容性 | NovaSeq X, NextSeq 550Dx in Research Mode, 研究模式下的MiSeqDx, HiSeq 3000, HiSeq 4000, iSeq 100, MiniSeq, NextSeq 2000, NovaSeq 6000, MiSeq, NextSeq 550 |
自动化功能 | 液体处理机器人 |
核酸类型 | DNA |
技术 | 测序 |
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
iSeq 100 System | TruSight Cancer:每次运行4个样本(基于280x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为99%) | 2 x 100 bp |
TruSight Cardio:每次运行4个样本(基于170x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为100%) | 2 x 100 bp | |
MiniSeq System | TruSight Cancer(每次运行的样本数):中通量:8,高通量:25(基于280x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为99%) | 2 x 100 bp |
TruSight Cardio(每次运行的样本数):中通量:8,高通量:25(基于170x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为100%) | 2 x 100 bp | |
MiSeq System | TruSight Cancer(每次运行的样本数):v2试剂:15,v3试剂:25(基于280x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为99%) | 2 x 100 bp |
TruSight Cardio(每次运行的样本数):v2试剂:15,v3试剂:25(基于170x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为100%) | 2 x 100 bp | |
TruSight One(每次运行的样本数):v2试剂:1,v3试剂:3(基于120x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为95%) | 2 x 100 bp (最高可达2 x 150 bp) | |
NextSeq 550 System | 外显子组(每次运行的样本数):中通量:5,高通量:16(基于50x平均靶标覆盖度;20X下的靶标覆盖度为90%) | 2 x 100 bp |
TruSight One(每次运行的样本数):中通量:12,高通量:36(基于120x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为95%) | 2 x 100 bp (最高可达2 x 150 bp) | |
TruSight One Expanded(每次运行的样本数):中通量:7,高通量:24(基于130x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为97%) | 2 x 100 bp (最高可达2 x 150 bp) | |
HiSeq 4000 System | TruSight One Expanded(每次运行的样本数,单流动槽):151(基于130x平均靶标覆盖度;20x下的靶标覆盖度为97%) | 2 x 100 bp |
NovaSeq 6000 System | 外显子组(每次运行的样本数,按流动槽类型):S1:128,S2:164,S4:400(基于50x平均靶标覆盖度;20X下的靶标覆盖度为90%;S4流动槽受可用标签数的限制) | 2 x 100 bp |
单位名称: |
详细地址:
宜山路1999号科技绿洲三期23号楼12-13楼
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