Respiratory Pathogen ID/AMR Panel
借助IDbyDNA Explify平台进行有效、简单的数据分析
IDbyDNA Explify RPIP Analysis应用程序为Illumina Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit提供了匹配和定制的数据分析解决方案。 该应用程序提供的信息包括样本组成、宿主和微生物丰度以及靶向与非靶向序列比例。
可在BaseSpace Sequence Hub中获取该应用。 用户最多可以选择35个独立样本或包含任意样本数量的项目文件夹进行分析。 报告包括详细的文本(JSON)和PDF格式。
规格
说明 | 同时全面检测呼吸道病原体和抗菌素耐性药标志物的一体化工作流程。支持研究人员鉴定呼吸道感染和合并感染、鉴定抗菌素耐药性以及对重要病原体(SARS-CoV-2和流感病毒)进行菌株分型,以研究病毒进化和传播。 |
分析时间 | 文库制备时间< 9小时 |
手动操作时间 | 文库制备时间< 2小时 |
起始量 | 10-100 ng |
作用机制 | 磁珠固化转座酶后开展一步杂交 |
多重分析 | 使用唯一双标签序列,单次运行最多可分析384个样本 |
物种详情 | 检测呼吸道病原体(180多种细菌、50多种真菌和40多种病毒,包括SARS-CoV-2)和抗菌药物耐药性等位基因(1200多种)。 |
样本类型详情 | ZymoBiomics DNA/RNA mini prep kit(来自Zymo)或AllPrep DNA/RNA提取试剂盒(来自Qiagen) |
物种类别 | 真菌, 细菌, 病毒 |
自动化功能 | 液体处理机器人 |
核酸类型 | RNA, DNA |
方法 | 靶向RNA测序, 靶向富集, 靶向DNA测序 |
系统兼容性 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 |
技术 | 测序 |
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit (Powered by Explify) | Respiratory Virus Oligo Panel | |
分析时间 | 文库制备时间< 9小时 | 文库制备时间< 9小时 |
多重分析 | 使用唯一双标签序列,单次运行最多可分析384个样本 | 使用唯一双标签序列,单次运行最多可分析384个样本 |
手动操作时间 | 文库制备时间< 2小时 | 文库制备时间< 2小时 |
物种类别 | 真菌, 细菌, 病毒 | 病毒, 人类 |
物种详情 | 检测呼吸道病原体(180多种细菌、50多种真菌和40多种病毒,包括SARS-CoV-2)和抗菌药物耐药性等位基因(1200多种)。 | 检测常见呼吸道病毒,包括最近的流感毒株和SARS-CoV-2。还包含作为阳性对照的人类探针,每个样本中均含有人类探针。 |
系统兼容性 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
说明 | 同时全面检测呼吸道病原体和抗菌素耐性药标志物的一体化工作流程。支持研究人员鉴定呼吸道感染和合并感染、鉴定抗菌素耐药性以及对重要病原体(SARS-CoV-2和流感病毒)进行菌株分型,以研究病毒进化和传播。 | 用于检测和分析SARS-CoV-2和其他常见呼吸道病毒的一体化工作流程,联合使用了RNA Prep for Enrichment与Respiratory Virus Oligo Panel(用于文库制备)、成熟的Illumina测序和简化的数据分析(在BaseSpace Sequencing Hub使用Pathogen Detection App或IDbyDNA Explify RVOP App)。 |
单位名称: |
详细地址:
宜山路1999号科技绿洲三期23号楼12-13楼
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