蛋白质组

RNA pull down技术服务-高分文章案例多

基本信息
产品名称:
RNA pull down技术服务-高分文章案例多
英文名称:
RNA pull down RNA pulldown
国产/进口:
国产
产地/品牌:
辉骏生物
型号:
d001
参考报价:
12000-22000
总点击数:
2808
更新日期:
2025-05-21
产品类别:

性能参数
辉骏生物提供的RNA pull down服务分为以下两种:

1. RNA pull down WB,用于检测目标RNA与某样本中的待测蛋白是否存在相互作用;

2. RNA pull down MS,用于筛选目标RNA与某样本中的哪些蛋白具有相互作用。

 

RNA Pull down检测服务
服务项目 服务内容 结果交付 实验周期 客户提供
RNA pull down WB 制备RNA正义链和反义链探针 探针电泳图 5-6周

1、实验样本

2、含有目标基因序列的质粒模板及测序文件

3、待测蛋白抗体

4、实验信息表(样本信息、抗体信息、目标RNA和待测蛋白序列)

Western blot检测待测样本中的待测蛋白 Western blot检测图

RNA pull down捕获目标RNA及其结合蛋白

(2组:正义链孵育组、反义链孵育组)
RNA pull down实验报告
Western blot检测RNA Pull down产物中的待测蛋白 Western blot检测图
RNA pull down MS 制备RNA正义链和反义链探针 探针电泳图 8-9周

1、实验样本

2、含有目标基因序列的质粒模板及测序文件

3、实验信息表(样本信息、目标RNA序列)

RNA pull down捕获目标RNA及其结合蛋白

(2组:正义链孵育组、反义链孵育组)
pull down实验报告
SDS-PAGE评估RNA pull down产物中的蛋白含量和数量 SDS-PAGE银染检测图
LC-MS/MS定性检测pull down产物的蛋白、筛选实验组独有蛋白(潜在互作蛋白) 质谱检索表格、互作蛋白筛选表格、检测报告
针对互作蛋白做生物信息学分析(GO、KEGG pathway、String) 生物信息学分析结果和报告 1周

 

 

 

RNA pull-down服务优势*辉骏生物

1、十年服务经验,客户成果发表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。

2、对围绕RNA结合蛋白开展的整体课题提供全方位指导,包括上下游实验设计和结合蛋白的多方法验证等

3、自有蛋白质组学平台,对RNA pull down产物这类微量蛋白的质谱鉴定有十足的把控能力,对后续的生物信息分析有独到的见解

4、售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心进行下游实验及投稿

 

 

RNA pulldown样本要求

 

1. 送样量要求
样本类型 RNA pull down WB建议送样量 RNA pull down MS建议送样量
动物细胞 3*10e7个细胞/组(约3个10cm皿) 5*10e7个细胞/组(约5个10cm皿)
动物组织 1g/组 2g/组
植物叶片 2g/组 4g/组
植物根或果实 4g/组 8g/组
菌体 50ul菌体沉淀/组 100ul菌体沉淀/组

 

▲注意:这里列出的均为每组样本的送样量,如果实验和对照组用的样本一致,此样本量*2。详细送样指南可联系辉骏生物客服或销售索取。

 

2. 样本保存和运输要求:

(1)样本用PBS清洗干净后,离心去掉液体,先放入液氮中速冻,再转移至-80℃冰箱中保存;

(2)样本一定要做好标记,应用油性防冻记号笔或标签纸在管上注明样本名称或编号;

(3)样本较多或需要分批做,要将样本分装;

(4)干冰取样/运输;需要至少在送样前一天通知我方。

 

 

 

RNA pulldown实验结果示例

 

图片.png







RNA pulldown WB:Western blot检测图(阳性)

 

图片.png

RNA pull-down MS:SDS-PAGE银染检测图

 

图片.png

RNA pull down-MS:质谱检索表格(部分展示)

 

 

 

RNA pull-down客户文章

 

 

1. Bao. X.C. et al: The p53-induced lincRNA-p21 derails somatic cell reprogramming by sustaining H3K9me3 and CpG methylation at pluripotency gene promoters.Cell Research.2015, IF=13.9.

【研究内容】:作者通过RNA pull-down、RIP-qPCR、CoIP等技术,证实了lincRNA-p21与HNRNPK结合,并和甲基化酶SETDB1、DNMT1形成复合物。该复合物甲基化了多能性基因的启动子序列及相应组蛋白,并改变了它们的表达量,从而进一步影响体细胞重编程过程。

使用相关技术:rna pull-down、RNA-蛋白相互作用

 

 

2. Bao X.C. et al: Capturing the interactome of newly transcribed RNA. Nature Methods,15(3): 213–220. 2018,IF=28.467.
【研究内容】:辉骏生物为作者单位之一,和客户共同开发了一种全新的RNA pull down,并用质谱鉴定新生RNA结合蛋白的方法。该方法主要是用EU标记新生RNA,再用点击反应-生物素-链霉亲和素系统做RNA-pull down,然后质谱鉴定分离的新生RNA互作蛋白。用该rna pulldown方法,首次鉴定到重要周期蛋白CCK1为RNA结合蛋白。RIP-qPCR、CLIP-Seq等实验进一步证实了CCK1为RBP蛋白,并发挥着重要的细胞。
使用相关技术:RNA pull down WB、RNA pull-down 技术服务

 

 

3. Wang W.T. et al: The lncRNA LAMP5-AS1 drives leukemia cell stemness by directly modulating DOT1L methyltransferase activity in MLL leukemia. Journal of Hematology & Oncology.2020,IF=11.059.
【研究内容】:研究显示高表达的LncRNA LAMP5-AS1能降低MLL白血病患者5年生存率。利用RNA pull down配合蛋白质质谱鉴定技术,作者首次发现LAMP5-AS1和DOT1L蛋白可能形成复合物。DOT1L是表观遗传中非常重要的甲基化酶。作者通过RIP-qPCR进一步确定了MLL细胞存在该复合物,并通过截短型RNA pull down实验进一步确定了DOT1L的结合序列。后续的ChIP-qPCR等实验证实了该复合物能有效影响DOT1L对组蛋白H3K79的甲基化水平,从而影响细胞的增殖分化。
使用相关技术:rna pulldown实验、rna pull down ms、rna pulldown探针

 

 

4. He S.W. et al: AR-induced long non-coding RNA LINC01503 facilitates proliferation and metastasis via the SFPQ-FOSL1 axis in nasopharyngeal carcinoma. Oncogene. 2020,IF=7.971.
【研究内容】:lncRNA LINC01503在鼻咽癌中高表达,并且促进了肿瘤的不良预后。作者在此探讨了LINC01503的作用机理,先用RNA pull down和质谱鉴定,发现SEPQ蛋白可能和LINC01503结合。RIP-qPCR实验确证了鼻炎癌中LINC01503募集了SEPQ基因。基于SFPQ-FOSL1轴在癌症研究中的重要地位,作者后续的工作思路之一也是关注该信号轴,并设计了CHIP-qPCR等实验做出证明。RNA pull down配合质谱鉴定,为此文研究提供了关键性的研究源头。
使用相关技术RNA pulldown实验、rna-pull down 打质谱

公司简介

       广州辉骏生物科技股份有限公司(原“广州辉骏生物科技有限公司”)成立于2008年,是一家为科研机构提供实验技术的专业公司,尤其擅长于蛋白质组学和分子生物学等技术。经过10多的不断努力与开拓进取,随着公司规模不断扩大,总部已经成功入驻广州黄埔区科学城国家级科技企业孵化器。
 

  经过10多的不断努力与开拓进取,辉骏生物已经拥有一支经验丰富、优秀刻苦的蛋白质组学实验及蛋白核酸互作技术队伍。公司各类实验的技术人员均有着深厚的理论基础和丰富的实验经验。本公司秉承着严谨科学、优质高效、不断完善的服务理念,以蛋白质组学为中心,函括各类蛋白核酸互作、分子生物学、抗体测序等实验。面向生物医药企业、院校、科研机构、医院和个人,为生物医药研发、生命科学和医学研究提供全方位蛋白质组学实验解决方案。目前,我们已经与中科院华南植物研究所、广州肿瘤医院、中山大学、浙江大学、武汉大学、上海海洋大学、西南大学、厦门大学等全国60多家科研单位建立了广泛的项目合作。
 

   感谢多年来广大客户对辉骏生物的支持与信任,我们将一如既往地为大家提供优质、高效、精准的各类包括蛋白质组学核酸蛋白互作分子\细胞生物学、免疫沉淀试剂盒抗体测序等着方面实验技术服务。本着客户至上的理念,辉骏生物科技的所有员工将竭诚为您服务,按时按质地向您提供各类实验报告。
 

       欢迎登录公司网站:www.fitgene.com
       实验咨询:  400 699 1663


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