RNA pull down技术服务-高分文章案例多
1. RNA pull down WB,用于检测目标RNA与某样本中的待测蛋白是否存在相互作用;
2. RNA pull down MS,用于筛选目标RNA与某样本中的哪些蛋白具有相互作用。
RNA Pull down检测服务 | ||||
服务项目 | 服务内容 | 结果交付 | 实验周期 | 客户提供 |
RNA pull down WB | 制备RNA正义链和反义链探针 | 探针电泳图 | 5-6周 |
1、实验样本 2、含有目标基因序列的质粒模板及测序文件 3、待测蛋白抗体 4、实验信息表(样本信息、抗体信息、目标RNA和待测蛋白序列) |
Western blot检测待测样本中的待测蛋白 | Western blot检测图 | |||
RNA pull down捕获目标RNA及其结合蛋白 (2组:正义链孵育组、反义链孵育组)
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RNA pull down实验报告 | |||
Western blot检测RNA Pull down产物中的待测蛋白 | Western blot检测图 | |||
RNA pull down MS | 制备RNA正义链和反义链探针 | 探针电泳图 | 8-9周 |
1、实验样本 2、含有目标基因序列的质粒模板及测序文件 3、实验信息表(样本信息、目标RNA序列) |
RNA pull down捕获目标RNA及其结合蛋白 (2组:正义链孵育组、反义链孵育组)
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pull down实验报告 | |||
SDS-PAGE评估RNA pull down产物中的蛋白含量和数量 | SDS-PAGE银染检测图 | |||
LC-MS/MS定性检测pull down产物的蛋白、筛选实验组独有蛋白(潜在互作蛋白) | 质谱检索表格、互作蛋白筛选表格、检测报告 | |||
针对互作蛋白做生物信息学分析(GO、KEGG pathway、String) | 生物信息学分析结果和报告 | 1周 |
1、十年服务经验,客户成果发表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。
2、对围绕RNA结合蛋白开展的整体课题提供全方位指导,包括上下游实验设计和结合蛋白的多方法验证等。
3、自有蛋白质组学平台,对RNA pull down产物这类微量蛋白的质谱鉴定有十足的把控能力,对后续的生物信息分析有独到的见解。
4、售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心进行下游实验及投稿。
RNA pulldown样本要求
样本类型 | RNA pull down WB建议送样量 | RNA pull down MS建议送样量 |
动物细胞 | 3*10e7个细胞/组(约3个10cm皿) | 5*10e7个细胞/组(约5个10cm皿) |
动物组织 | 1g/组 | 2g/组 |
植物叶片 | 2g/组 | 4g/组 |
植物根或果实 | 4g/组 | 8g/组 |
菌体 | 50ul菌体沉淀/组 | 100ul菌体沉淀/组 |
▲注意:这里列出的均为每组样本的送样量,如果实验和对照组用的样本一致,此样本量*2。详细送样指南可联系辉骏生物客服或销售索取。
(1)样本用PBS清洗干净后,离心去掉液体,先放入液氮中速冻,再转移至-80℃冰箱中保存;
(2)样本一定要做好标记,应用油性防冻记号笔或标签纸在管上注明样本名称或编号;
(3)样本较多或需要分批做,要将样本分装;
(4)干冰取样/运输;需要至少在送样前一天通知我方。
RNA pulldown WB:Western blot检测图(阳性)
RNA pull-down MS:SDS-PAGE银染检测图
RNA pull down-MS:质谱检索表格(部分展示)
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【研究内容】:作者通过RNA pull-down、RIP-qPCR、CoIP等技术,证实了lincRNA-p21与HNRNPK结合,并和甲基化酶SETDB1、DNMT1形成复合物。该复合物甲基化了多能性基因的启动子序列及相应组蛋白,并改变了它们的表达量,从而进一步影响体细胞重编程过程。 使用相关技术:rna pull-down、RNA-蛋白相互作用 |
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2. Bao X.C. et al: Capturing the interactome of newly transcribed RNA. Nature Methods,15(3): 213–220. 2018,IF=28.467. |
3. Wang W.T. et al: The lncRNA LAMP5-AS1 drives leukemia cell stemness by directly modulating DOT1L methyltransferase activity in MLL leukemia. Journal of Hematology & Oncology.2020,IF=11.059. |
4. He S.W. et al: AR-induced long non-coding RNA LINC01503 facilitates proliferation and metastasis via the SFPQ-FOSL1 axis in nasopharyngeal carcinoma. Oncogene. 2020,IF=7.971. |
广州辉骏生物科技股份有限公司(原“广州辉骏生物科技有限公司”)成立于2008年,是一家为科研机构提供实验技术的专业公司,尤其擅长于蛋白质组学和分子生物学等技术。经过10多的不断努力与开拓进取,随着公司规模不断扩大,总部已经成功入驻广州黄埔区科学城国家级科技企业孵化器。
经过10多的不断努力与开拓进取,辉骏生物已经拥有一支经验丰富、优秀刻苦的蛋白质组学实验及蛋白核酸互作技术队伍。公司各类实验的技术人员均有着深厚的理论基础和丰富的实验经验。本公司秉承着严谨科学、优质高效、不断完善的服务理念,以蛋白质组学为中心,函括各类蛋白核酸互作、分子生物学、抗体测序等实验。面向生物医药企业、院校、科研机构、医院和个人,为生物医药研发、生命科学和医学研究提供全方位蛋白质组学实验解决方案。目前,我们已经与中科院华南植物研究所、广州肿瘤医院、中山大学、浙江大学、武汉大学、上海海洋大学、西南大学、厦门大学等全国60多家科研单位建立了广泛的项目合作。
感谢多年来广大客户对辉骏生物的支持与信任,我们将一如既往地为大家提供优质、高效、精准的各类包括蛋白质组学、核酸蛋白互作、分子\细胞生物学、免疫沉淀试剂盒、抗体测序等着方面实验技术服务。本着客户至上的理念,辉骏生物科技的所有员工将竭诚为您服务,按时按质地向您提供各类实验报告。
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