名称：三代纳米孔测序仪
品牌：Oxford Nanopore Technologies
型号：Mk1
产地：英国

GridION MK1是一款桌面测序仪，利用最先进的纳米孔测序技术，实现对DNA和RNA分子的高通量单分子实时测序。
1.原理：单分子纳米孔测序技术。
2.应用类型：全基因组测序、靶向测序、RNA测序、宏基因组测序、研究等。
3.样本类型：DNA和RNA、扩增子、cDNA等。
4.环境要求：
4.1 储存环境：
1)温度要求：10~30℃
2)湿度要求：5%~95%
4.2 工作环境：固定实验室室内、移动实验车辆内操作
1)温度要求：18~25℃
2)湿度要求：10%~80%
3)电源要求：100~240 VAC (50/60Hz)，650W
4)其他要求：网络
5.主机一年质保。
6.仪器外观参数：
流动槽（flow cell）：5个
体积：22*36.5*37 cm （H220 x W 365x D 370 mm）
重量：11kg
7.系统硬件参数：
Linux（ubuntu）系统
Intel i7 7700K CPU 
64 GB RAM
4 TB internal SSD
Nvidia Volta GV100
8.仪器性能：
1)起始样品量：10pg~5ug；
2)测序样品上样量：75ul、≥50ng；
3)测序速度：450bp/s（DNA）、70bp/s（RNA）；
4)运行时间：1min~72hrs（可控）；
5)芯片使用寿命：72 hrs；
6)运行数：1~5个独立的flow cell实验；
7)功率：650W
9.性能指标
1)文库制备时间：10min~2hrs；
2)获取序列时间：运行≥2min、实时；
3)序列条数：20 Million(百万)reads（以10kb长度计算）；
4)读长长度：200bp-2Mb；
5)测序数据产量：50~150 Gb/run（30 Gb/flow cell）；
6)碱基质量：99%；
7)碱基修饰：直接检测碱基修饰信息（甲基化检测）；
8)分析工具：≥30种开源；
9)可完成原始电信号碱基读取（Fast5→FastQ）、数据质量控制（QC）、barcode拆分（Demultiplexing）、序列比对（Alignment）、基因组组装（Assembly）、宏基因组分析（Metagenomics）、扩增子分析（Amplicon）、测序错误校正（Error correction）、变异分析（Variant calling）、碱基修饰（Base modification）等
10.性能介绍
1)实时单分子纳米孔测序技术：借助单个分子通过纳米孔时引起孔两侧电位差来实现信号检测，纳米孔的直径仅允许单个核苷酸聚合物通过，而ATCG四种碱基的带电性质不同，因此通过电信号差异特征即可检测出通过纳米孔的碱基类型，从而实现测序。
2)单分子测序：DNA/RNA直接测序，无需PCR扩增，免除PCR扩增带来的错误和GC偏差，DNA平均测序速度为450bp/s，快速、实时。
3)读长长：读长为核酸片段长度，最长超过2Mbp。
4)数据量大：理论可产生250G数据，用户目前最好可产生150G数据。
5)直接RNA测序：提取RNA无需转换成cDNA即可进行测序。
6)甲基化检测：碱基修饰基于电信号的差异检测碱基，在DNA/RNA测序同时可直接检测碱基修饰。
7)分析软件丰富：数据分析工作站预先安装了30多种可用于分析Nanopore测序数据的常用工具。
8)集成设备：仪器本身为高性能计算机，可用于数据获取，原始数据存储以及碱基转换（basecalling）。
9)安装简便：没有复杂的激光或光路系统，插电即可使用，无需日常维护。
10)产生数据快速：提供最先进的单分子实时测序，上机后2分钟产生碱基序列数据。并可以根据实验需求设置测序反应时间，可选范围在几分钟到48小时之间。
11)模块化设计：允许同时运行多至5个独立的实验，也可以单独运行1个测序实验，为用户提供了实验设计上的最大便利。

GridION MK1一款极具成本效益的高通量桌面测序系统，提供按需测序，并带有集成实时数据处理功能。

产品、技术优点
1)应用广泛：全基因组测序、靶向测序、RNA测序、宏基因组测序、表型研究等。样本类型包括人类基因组、动植物基因组、微生物基因组以及各种临床标本的DNA和RNA；
2)测序起始量需求从pg级到ug级都可以进行建库；
3)使用简便：仪器插电就可使用，没有复杂的激光或光路系统，无需日常维护；
4)配合快速建库试剂盒使用，可以在10分钟之内完成文库的制备；
5)对实验环境要求低，建库方法简便快捷，人员配置灵活，适用于实验室或现场条件；
6)实时数据：提供最先进的单分子实时测序，上机后2分钟产生碱基序列数据（其他技术都要等整个Run跑完）。并可以根据实验需求设置测序反应时间，可选范围在几分钟到48小时之间。
7)单分子测序：支持直接原始DNA/RNA测序，无需PCR扩增，免除PCR扩增带来的错误和GC偏差；
8)读长长：读长为核酸片段长度，最长超过2Mbp。测序片段在200bp~2Mbp，无需进行片段化（二代测序通病）和片段回收（Pacbio 丢弃短片段），数据真实；
9)全长转录本测序：一条Reads可跨越全长转录本，无需拼接、不因引物设计丢失片段两端碱基数据（二代存在这个问题、测不通全长）；
10)高通量：理论可产生250G数据，用户目前最好可产生150G数据；
11)按需测序：10~30 Gb/flow cell，支持多样本混样上机，支持测序随时停止、清洗芯片重复使用；
12)模块化设计：允许同时或单独运行五个flow cell，可随时在同一台机器上进行不同实验，为用户提供了实验设计上的最大便利；
13)直接RNA测序：提取RNA无需逆转录成cDNA即可进行测序（唯一技术）；
14)甲基化检测：碱基修饰基于电信号的差异检测碱基，在DNA/RNA测序同时可直接检测碱基修饰；
15)分析软件丰富：数据分析工作站预先安装了30多种可用于分析Nanopore测序数据的常用工具；
16)集成设备：仪器本身为高性能计算机，可用于数据获取，原始数据存储以及碱基转换（basecalling）。集成高性能数据处理减少了对复杂IT基础设施的需要。