【产品规格】
BPMPro100 100 Reactions/盒
【产品说明】
支原体(Mycoplasma):目前发现的最小原核生物,据统计约15~35% 的细胞被支原体污染。支原体污染会改变宿主细胞的结构与功能,易致实验结果不稳定,须对培养细胞定期进行支原体检测。
本试剂盒采用双色荧光 qPCR (TaqMan 探针法) 检测支原体DNA。检测对象为细胞培养的上清液,细胞沉淀或其他生物制品。该试剂盒具有以下特点:
灵敏:配合推荐使用的核酸抽提方案,检测灵敏度达到10CFU/ml。
可靠:抽提加入内标核酸,全过程质量控制。
稳定:全程闭管操作,无交叉污染。
方便:操作简单,无需电泳步骤。
【有效期】
规定储存条件下6个月。
-20 ℃取出后,可避光存放于4 ℃继续使用1周。
【产品组分】
表1 产品组分
组分名称 |
装量 |
储存条件 |
Biowing® MyqPCR Reaction Mix1 |
475 ul×2管 |
-20 ℃,避光 |
Biowing®MyPrimer&Probe Mix2 |
25 ul×2管 |
-20 ℃,避光 |
阳性质控(PC) |
50 ul×2管 |
-20 ℃ |
内部质控(IC) |
50 ul×2管 |
-20 ℃ |
RNase Free Water |
50 ul×2管 |
-20 ℃ |
石蜡油 |
750 ul×2管 |
-20 ℃ |
注:
1、阳性质控含有支原体DNA和内标DNA。
- 内部质控含有内标DNA。
在实验前请完整阅读本说明书,务必重视注意事项和无菌操作规范!
【操作步骤】
1.样本制备
- 样本的标准制备方案:请配合使用高效无微生物污染的DNA抽提试剂盒提取样本DNA。整个过程需要遵守无菌操作规范。本公司目前推荐抽提试剂盒见附录3。直接取20 µL待测样本DNA,作为模板进行 qPCR 反应。
- 前处理阴性样本准备方案:将RNase Free Water当成样本,加入内部质控,进行核酸抽提。
2. qPCR 反应液的准备
- 根据所要检测样品的数量,计算所需反应孔数,每个样本做3个重复孔。
- =1个阳性PCR质控+1个阴性PCR质控+1个前处理阴性质控+样本数× 3
- 根据反应孔数计算所需的qPCR Mix 总量(需有1孔的加样损失量):
Mix =(反应孔数+1)×10 μl
各试剂放室温融化,并根据下表所示准备 qPCR Mix:
表2 qPCR Mix的配制
组分/样品管 |
Biowing® MyqPCR Reaction Mix1 (µL) |
MyPrimer&
Probe Mix2
(µL) |
总体积
(µL) |
1人份 |
9.5 |
0.5 |
10 |
N人份 |
9.5N |
0.5N |
10N |
1.加样
(1)震荡混匀 qPCR Mix,低速离心,将管盖残留液体收集至管底。
(2)向每孔反应管中分装 10 μL qPCR Mix。
(3)向已分装过 qPCR Mix 的反应管中加入15 ul石蜡油。
(4)向反应管中加入样品后短暂离心,加样示例如下:
表 3 加样示例
PCR模板 |
qPCR Mix |
总体积 |
PC 20 μL |
10 μL |
30 μL |
qPCR 阴性20 μL |
10 μL |
30 μL |
前处理阴性20 μL |
10 μL |
30 μL |
样本A重复1 20ul |
10 μL |
30 μL |
样本A重复2 20ul |
10 μL |
30 μL |
样本A重复3 20ul |
10 μL |
30 μL |
【注】:此时每个反应孔的体积为30μL。
qPCR 阴性的PCR模板为20 ul RNase Free Water。
PCR 仪设置以 ABI 7500 为例,相对定量模式,选择
TaqMan 探针法:
步骤 |
循环数 |
温度 |
时间 |
1 |
预变性 |
1 |
94℃ |
5 min |
2 |
变性 |
15 |
95℃ |
10 s |
退火与延伸 |
65℃ |
90 s |
3 |
变性 |
25 |
95℃ |
10 s |
退火与延伸 |
65℃ |
30 s |
65℃延伸时收集荧光信号 |
通道选择:样本检测通道-FAM;内参检测通道-HEX,无
HEX 通道,可使用VIC 通道。ABI 系列荧光定量 PCR 仪
需 ROX 校准,Passive reference 选择ROX。 |
- 1、该程序为两阶段扩增法,如荧光定量PCR仪可以两阶段收集荧光,按照正常Ct值判断结果;如果只能最后一步收集荧光,需要在原数据的基础上加15个Ct值。
- ROX设置是以7500为例,但也存在例外,例如StepOne。
【阈值设置】
以ABI 7500 为例,扩增曲线选择 log 法,如果不能两阶段收集荧光,基线设置1~2个循环;如果可以,基线设置3-15个循环。建议用 log 法扩增曲线保证结果稳定可靠。
- 内参(HEX/VIC)阈值设定:以阳性对照定内参扩增曲线阈值,将内参的Ct 值定为 28±2。
- 支原体(FAM)阈值设定:以阳性对照定支原体扩增曲线阈值,将支原体(FAM)的 Ct 值定为 28±2 。
【实验质量控制】:
如果阳性对照管的支原体(FAM)Ct 值>30,但阳性对照管及前处理阴性对照管的内参(HEX)Ct 值正常,表明阳性支原体对照模板有降解。
如果样品前处理阴性的内参(HEX/VIC)Ct 值>30,阳性对照管的内参(HEX)Ct 值>30 ,表明内参DNA存在降解或PCR体系扩增效率下降。
【结果判读】
根据支原体(FAM) Ct 值、内标(VIC) Ct 值判定,具体标准如下:
PCR 模板 |
支原体(FAM)Ct 值 |
内标(VIC) Ct 值 |
判定说明 |
阳性对照 |
≤30 |
- |
阳性成立 |
>30 |
- |
阳性不成立 |
qPCR阴性对照 |
≥37.5 |
≥37.5 |
阴性成立 |
<37.5 |
<37.5 |
阴性不成立 |
样本前处理阴性 |
≥37.5 |
≤30 |
阴性成立 |
待测样品反应孔 |
<37.5 |
≤30 |
阳性 |
≥37.5 |
≤30 |
阴性 |
要求每个检测样品做3重复,如果3复孔中,两重复为阳性,则判读为阳性;建议做样本前处理阴性,可以质控整个抽提过程。
注:检测结果异常时:
- 样品前处理阴性:内参Ct值过大,表明抽提效率低;支原体检测通道Ct值小于37.5,可能前处理抽提过程存在污染。
- qPCR阴性:支原体和内参检测通道Ct值小于37.5,操作过程存在污染。
- 样本前处理阴性质控和PCR阳性质控内参差1±1个Ct值属于正常现象。
【 PCR过程注意事项】
由于 PCR 反应非常灵敏,实验操作中应注意以下事项,以免发生DNA 污染:
- 试剂盒开启后,阳性质控和内部质控与试剂Biowing® MyqPCR Reaction Mix1、Biowing®MyPrimer&Probe Mix2、RNase Free Water、石蜡油分开存放。
- 每个组分在使用前都应先低速离心后小心开启。使用时请上下轻柔颠倒十次混匀,避免起泡,并低速短暂离心后使用。
- 要求核酸抽提和qPCR过程都符合无菌操作规范。
- 建议自备转运盒,用于将配制分装好的Mix从配置Mix超净工作台转运到加样超净工作台。
- 建议在 qPCR 反应板上阳性对照的排布应远离待测样本和阴性对照。
- 建议 qPCR 配置与分装在一个无菌操作台,样本的加样在另外一个无菌操作台。
- 建议使用不同的移液器添加阳性对照与待测样本、阴性对照,并使用带滤芯的枪头进行加样。
- 应按照先加阴性,再加样本,最后加阳性的顺序加样。且阳性用专门的加样器。建议阳性在专门的无菌操作台加样。
- qPCR 反应板封膜或盖盖子时须反复压紧。
- 上机扩增前,反应管短时低速离心,将管壁液体收集至管底
- 盖上反应管盖子或者贴上光学膜后,为避免影响荧光信号读取,请注意不要在管盖或者膜上做标记,或者用刮板反复摩擦。
- 本产品仅作科研用途。