土壤RNAout
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产品及特点 |
由于土壤中有机质含量丰富,尤其是其中的腐殖酸对 RT-PCR 等后续反应有 极大的抑制作用,所以从土壤微生物提取高纯度的 RNA 一直是十分棘手的问题。 它具有下列特点: 1. 操作简单快速,处理一个样品只需要约十几分钟。 2. 去污染效果好,RNA 纯度更高,平均 OD260/280 一般都在 2.0 左右。 3. 得到的 RNA 可直接用于 RT-PCR、Northern 杂交、cDNA 合成等实验。 4. 性价比高于进口的土壤 RNA 提取产品。 5. 试剂无毒无害, 环保。 |
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规格及成分 |
成 份 50 次包装 (CAT#:90704-50) 溶液 A 50 mL 溶液 B 15 mL 溶液 C 25 mL 溶液 D 25 mL RNA 溶解液 10mL 使用手册 1 份 |
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运输及保存 |
常温运输,4℃保存,有效期一年。 |
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自备试剂 |
氯仿,RNase-free 收集管。 |
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使用方法 |
1. 称取 0.1-0.5 g 的土壤,加入 1 mL 溶液 A,震荡器上剧烈震荡 5-10 分钟。 注意:一定要让管底的土壤震荡起来。注意:溶解溶液 A 沉淀。溶液 A 在 4℃ 放置后可能会产生沉淀,使用前必须放在 65℃水浴使沉淀彻底溶解并充分摇 匀后再取用。 2. 稍微静置后将上清液转移至一个干净的 1.5 mL 塑料离心管中。 3. 在离心管中加入 0.3 mL 的溶液 B 和 0.2 mL 自备氯仿,在振荡器上振荡 30 秒混匀。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。 4. 室温 12000 rpm 离心 3-5 分钟。 5. 将上清液(约 0.6 mL)转移到另一干净的 1.5 mL 塑料离心管中,下层有机 相和中间层含有 DNA、蛋白质和其他杂质,避免触及或吸取。最好留下 100 μL 上清液不取。 6. 在上清液中加入 0.5 mL 的溶液 C 和 0.2 mL 的自备氯仿,用手上下颠倒或振 荡器振荡 30 秒混匀,此时溶液呈均匀的乳浊状。振荡器振荡时必须使管底溶 液震荡起来。 |
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7. 室温 12000 rpm 离心 3 分钟,两相间将有白色膜状物(蛋白质)形成。 |
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8. 将上清液(约 1 mL)转移到另一干净的 1.5 mL 塑料离心管中,避免触及或吸 |
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取有机相及其上面的白色膜状物。 |
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9. 在上清液中加入 0.5 倍体积的溶液 D,用手上下颠倒或振荡器振荡 30 秒混匀, |
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此时溶液呈白色浑浊状。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。 |
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10. 13000-15000 g 室温离心 5-30 分钟,小心移弃上清液,避免触及管底大量的 |
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白色 RNA 沉淀。 |
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11. 在离心管中加入 1 mL 75%乙醇,振荡器上振荡混均 30 秒。室温离心 |
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13000-15000 g 1 分钟,RNA 此时在管底形成细小沉淀。小心吸弃上清液, |
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注意不要吸弃 RNA 沉淀。 |
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12. 重复第 11 步的 75%乙醇清洗步骤一次。 |
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13. 短暂快速离心数秒使管壁上残留液体沉到管底(约 50 μL),用移液枪小心吸 |
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弃,注意不要吸弃沉淀。此步十分重要,因为残留的乙醇会影响后续反应。 |
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14. 室温短暂放置 2 分钟,立即加入适量(一般为 10-30 μL)RNA 溶解液使 RNA |
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沉淀溶解。注意:千万不要用真空离心法使 RNA 沉淀过于干燥,否则 RNA 将 |
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变得十分难溶。RNA 样品可以直接使用,也可以存放于-80℃长期保存。 |
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15. RNA 完整性的电泳检测:如果需要做 Northern 杂交,强烈建议用户使用甲醛 |
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变性胶 进行 RNA 电泳 ,因为非变性胶不能分离所有 的 RNA 分子 |
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(BioTechniques,28:414,2000)。 |
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16. RNA 产量产率测定:将 5-10 μL RNA 溶于 TE 缓冲液中(pH7.5-8.2 之间) |
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检测其在 OD260 的光吸收。通过光吸收可以得出 RNA 浓度(1 OD260 的 |
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RNA=40 μg/mL),进而计算出 RNA 的产量(浓度 X 体积)和产率(RNA |
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产量/组织用量)。 |
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17. RNA 纯度测定:无污染的总 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8-2.1 之间(具 |
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体数值与其碱基组成和溶液成分等多种因素有关),高于此范围则分别表示样 |
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品可能有蛋白质污染,但一般不影响 RT-PCR 等反应。 |
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关联产品 |
柱式土壤 RNAout(CAT#:90705-50) |
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北京天恩泽生物技术有限公司拥有国内最齐全的核酸纯化类产品线,专门从事分子生物学试剂的研究、开发和销售,承接各种定向产品开发、OEM生产和分子生物学技术服务,包括疑难样品的核酸纯化、PCR、克隆、DNA测序、引物合成和全基因合成。
北京天恩泽是由留美十年的归国博士徐堤先生2004年底创建。徐堤博士1985年毕业于四川大学遗传学专业并获得遗传学学士学位,1991年毕业于北京协和医科大学(即后来的中国协和医科大学)并获得生物化学硕士学位,参与过地贫基因的PCR和测序工作。1997年毕业于美国德克萨斯州University of Texas Medical School并获Microbiology and Molecular Genetics博士学位。1998-2001在美国加州Roche Molecular Systems,Inc.(瑞士Roche药业集团购买Cetus公司及其PCR专利后专门成立的开发PCR临床诊断产品的子公司)担任开发部Principal Scientist和HBV血筛项目经理(2000-2001年),对分子生物学产品的开发有丰富的实战经验。
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