产品简介:
本产品是采用SYBR Green I染料嵌合荧光法进行Real Time PCR的专用试剂,含有抗体封闭型热启动酶,能够有效抑制低温条件下引物非特异性退火或者引物二聚体引起的非特异性扩增,提高扩增反应的特异性。本产品具备扩增效率高、检测特异性及灵敏度强、稳定性好、操作使用简便等特点,可以在较宽的定量区域内得到良好的标准曲线,准确进行定量,同时与多数厂家的荧光定量PCR仪兼容,如Applied Biosystems、Eppendorf、Bio-Rad和Roche等。
试剂内容:
2×SYBR Green qPCR Mix 1 ml
自备:
ROX Reference Dye I(50×)
ROX Reference Dye II(100×)
注意:
ROX Reference Dye用以校正部分公司Real Time PCR扩增仪的孔间荧光信号误差。
ROX Reference Dye I (50×) 适用于:ABI PRISM 7000/ 7700/ 7300/ 7900HT、Step One Plus Real-Time PCR System。
ROX Reference Dye II (100×) 适用于:7500 Real-Time PCR System、7500 Fast Real -Time PCR System、Stratagene Mx3000P、Mx3005P、Mx4000。
ROX Reference Dye I、II反应终浓度均为1×。
LightCycler、Thermal Cycler Dice Real Time System II、Smart Cycler System等Real Time PCR 扩增仪不需使用。
操作方法:
1)
配制PCR反应体系:
解冻后使用前应充分颠倒混匀,瞬时离心后使用,避免产生大量气泡,请勿涡旋振荡混匀。避免反复多次冻融,若经常使用请避光保存在4℃。反应液的配制、分装时请使用新的(无污染的)枪头、离心管等,尽量避免污染。
按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行):
| 试剂 |
25 μl体系 |
终浓度 |
| 2×SYBR Green qPCR Mix |
12.5 μl |
1× |
| Primer 1 (10 μM) |
0.5-2.5 μl |
0.2-1.0 μM |
| Primer 2 (10 μM) |
0.5-2.5 μl |
0.2-1.0 μM |
| ROX Reference Dye I or ROX Reference Dye II |
0.5 μl or 0.25 μl |
1× |
| Template DNA |
2 μl as required |
- |
| ddH2O |
Up to 25 μl |
- |
注意:
1、请根据引物选择合适的退火(延伸)温度,通常引物的T
m值设计在60℃左右;对于退火温度较低的引物,建议采用三步法;使用的引物终浓度可在0.2~1.0 μM范围内调整;DNA模板可根据浓度进行适当调整。
2、SYBR Green I染料是非特异性染料,可与双链DNA(dsDNA)结合后发出荧光,同时其强光下易分解,因此在设计引物时需要尽量避免引物二聚体的产生,使用时避免长时间强光照射,以提高检测结果准确性、灵敏度及特异性。
3、提高镁离子浓度可以降低SYBR Green I对PCR反应的抑制作用,建议在使用本产品进行荧光PCR反应优化时,可适当增加镁离子浓度(比普通PCR反应高出0.5-3.0 mM)。
4、扩增前后要使用专用的区域和移液器,戴手套操作并经常更换,PCR反应完成后切勿打开反应管。以最大限度的减少PCR产物对检测环境的污染。2)
PCR反应程序:
通常情况下,可以采用两步法进行反应;如果两步法扩增不理想,可以采用三步法设置PCR反应程序。
| 方法/步骤 |
两步法real-time PCR |
三步法real-time PCR |
循环数 |
| 95℃(预变性) |
2-5 min |
2-5 min |
1 |
| 95℃(变性) |
10 sec |
10 sec |
35-45 Cycles |
| 55℃-60℃(退火) |
20 sec - 1 min(采集荧光) |
10-20 sec |
| 72℃(延伸) |
— |
20 sec - 1 min(采集荧光) |
| 熔解曲线 |
— |
— |
— |
注:熔解曲线程序可根据所使用的Real Time PCR 扩增仪默认程序进行适配选择。
3)
实验结果分析:
反应结束后,对扩增曲线及熔解曲线结果进行分析。详细分析方法参见Real Time PCR 扩增仪操作手册。