riboPOOL 核糖体RNA去除--性能参数，报价/价格，图片

基本信息

产品名称：

riboPOOL 核糖体RNA去除

英文名称：

riboPOOL 6 reactions probes

国产/进口：

进口

产地/品牌：

siTOOLs Biotech

型号：

6rxn

参考报价：

询价

销售商：

蓝景科信河北生物科技有限公司

总点击数：

430

更新日期：

2025-12-10

产品类别：

分子生物学试剂

性能参数

ribo POOL 灵活高效的去除核糖体RNA

核糖体RNAs(rRNA)约占RNA-Seq数据读取量的90%,去除后可大大节省RNA-seq的测序成本。

riboPOOL可以高效和特异性地去除rRNAs,适合各种模式和非模式物种或RNA序列。

产品特点：

种类丰富：丰富的成品型目录可供选择，目录持续更新中；目录以外物种或RNA可以定制
工作流程快：一步法，完整工作流程仅用时70min
起始量范围广泛：在100 ng到5μg的RNA起始量之间都有很好的去除效率
针对特殊应用定向优化：ibosome profiling样本；环境转录组学（如土壤、污泥）
高效的去除：去除效率高，结果稳定可重复
搭配灵活：兼容各种RNA纯化和RNA建库方法
探针法：没有酶切偏好,可以均一的覆盖转录本；无打断样本风险；适用于无polyA结构的RNA（如snoRNA,LncRNA, 组蛋白）
兼容多种下游分析方法：如RNA-Seq、微阵列分析和实时定量PCR等
可混合使用：客户可根据样本的组成比例，混合使用2-4种riboPOOL，如病原体感染的人体组织（人源+原核通用型）、人血液样本（人源+人血珠蛋白）、植物微生物群研究（植物通用型+原核通用型）

目录成品型 riboPOOLs

通用型riboPOOLs	真核生物riboPOOLs
003 原核通用型	005　酿酒酵母
026 细菌通用型	006　丝状真菌
031 植物通用型	007　果蝇
032 鸟类通用型	008　拟南芥
027 古细菌通用型	009　水稻
035 放线菌通用型	010　斑马鱼
041 哺乳动物通用型	011　堡礁海绵
044 海绵通用型	014　丝毛鼠(龙猫）
050　人鼠Ribo-seq	017　蛤蜊
053　人鼠高质量样本	019　毕氏酵母
056　人鼠（低质量/FFPE样本）	020　珀蝽
原核生物riboPOOLs	024　玉蜀黍黑粉菌
004　大肠杆菌	028　涡虫
012　枯草芽孢杆菌	029　家蚕
013　新月柄杆菌	030　扁虱
015　产气荚膜梭菌	033　石藻
016　盐富饶菌	047　伊蚊
018　铜绿假单胞菌	059　裂殖酵母
021　金黄色葡萄球菌	060　鸡
022　沙门氏菌	061　果蝇（降解样本）
023　寡氧单胞菌	062　线虫
高丰度mRNA	063　牡蛎
025　人血珠蛋白
034　Poly-A
038　SARS-CoV-2

riboPOOL 工作流程：

实验数据：

ribo POOL 有效起始量范围(100ng-5ug)

ribo POOL 可混合使用（复合型）

复合型ribo POOL，可根据客户样本组成混合2-4种成品型riboPOOL。

测试样本为（a）SW48 细胞 (人源), NIH3T3细胞 (小鼠)和DH10B株大肠杆菌RNA混合物。

实验比较（b）单独使用人源、鼠源、原核通用型riboPOOL和（c）使用复合型riboPOOL（由1：1：1的人源、鼠源、原核通用型riboPOOL混合构成），两者均可有效去除1μg RNA混合样本中的rRNA.

rRNA的去除效率用生物分析仪,或rtqPCR分析评估（用rRNA或GAPDH（管家基因）特异性的引物进行实时定量PCR ）。

riboPOOLs应用方向：

高丰度RNA的消耗

除了rRNA外，在测序数据中发现的丰富的组织特异性mRNA（如珠蛋白）或其他丰富的RNA的去除也可以用riboPOOLs来进行。

转录组测序（RNA-seq）

RNA-seq是一种高度准确且灵敏的转录组追踪工具。然而，一些丰度很高的RNA种类却影响了NGS文库制备，浪费了宝贵的测序资源。在提取的总RNA中，核糖体RNA（rRNA）占比最大，约90%-95%，mRNA占2-3%，还有2-3%是非编码RNA（lncRNA、tRNA、microRNA等）。所以，在RNA测序的过程当中，首先要解决的问题，是如何去除核糖体RNA。riboPOOLs能够高效去除与研究无关的RNA，让研究人员更高效地利用测序资源。

核糖体图谱分析（Ribo-seq）

核糖体分析涉及核糖体结合RNA的测序，以评估翻译组。在RNA-Seq之前，需将受核糖体保护的RNA片段分离出来，并进行rRNA去除。由于这些片段的范围为17-35个核苷酸，rRNA的去除效率预计将低于典型的RNA样本。人类riboPOOL已被应用，且rRNA去除效率在50-80%之间。为了进一步增强rRNA的去除能力，在rRNA去除后，还可以采用定制化riboPOOL进一步去除残余rRNA序列。

宏转录组(Metatranscriptomics)测序分析

Pan-Prokaryote riboPOOL被设计用来从所有主要门的广谱微生物中去除rRNA，使其成为一种通用的微生物rRNA去除工具。它可用于含有已知和未知微生物（如土壤、污泥、病原体感染组织）的复杂环境混合物或微生物组样本的rRNA去除。

用组合riboPOOLs去除多个物种的rRNA

为了从含有多个物种的样本中去除rRNA，或为便于在包含多个物种的样本中使用一种试剂盒，可以使用组合riboPOOLs。这些可由客户指定以一定比例进行组合，至多可实现四种现成riboPOOLs的混合物。对高质量RNA样本的内部测试显示，组合riboPOOLs（人类/小鼠/泛原核生物）从人类、小鼠和大肠杆菌RNA中去除rRNA的表现与物种特异性 riboPOOLs效果类似。然而，siTOOLs不能确保组合riboPOOLs在所有样品类型中具有相似的去除效率，因为去除效率也高度依赖于样品的质量。

公司简介

技术服务：
1、DAP-seq：高通量检测转录因子或DNA结合蛋白在基因组上的结合位点。
2、酵母单杂交：研究蛋白质和特定DNA序列相互作用。
3、酵母双杂交：检测已知蛋白质之间的相互作用，鉴定与已知蛋白相互作用的未知蛋白。
4、EMSA：鉴定或验证DNA结合蛋白和DNA序列的相互作用。
5、ChIP-seq：高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点。
6、DAP-seq与RNA-seq联合分析：分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化，深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据，增加转录组测序的分析深度。
7、DNA-pull down：鉴定与DNA结合的蛋白。
欢迎企业和课题组洽谈合作，电话：15632249798（微信同号），QQ：2522026793

售后服务