单细胞测序方案
近年来,已有多种单细胞测序技术及平台应运而生,BD Rhapsody™基于芯片原理,
可在极短时间内同时获得数十万个单细胞转录组信息,而且相较于其他平台,成本大大降低。
广泛应用于血液病、肿瘤细胞异质性、鉴定罕见细胞类型、免疫细胞分型、疾病分型等领域;主要
是针对大量细胞进行亚型分类,可结合传统全长序列的扩增进行精确定量,精准揭秘疾病分子机制。

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

分析流程是针对BD Rhapsody™单细胞转录组测序开发的完整分析
流程,包括数据拆分、对细胞数目进行统计、基因表达定量、聚类及差异分析等。
| 1. 基本数据分析,细胞数目统计,单个细胞 reads 数目统计等; |
| 2. 质控分析,通过对 UMI 分析判定 PCR 扩增效率; |
| 3. 基因表达定量,获得表达基因及其表达量数据; |
| 4. 聚类分析,选用 tSNE 进行聚类分析。 |
BD Rhapsody™采用先进的HiSeq测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
山河生物高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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