科研用small/microRNA文库制备试剂盒
基本信息
产品名称：
科研用small/microRNA文库制备试剂盒
英文名称：
Balancer NGS Library Preparation Kit for small/microRNA
国产/进口：
国产
产地/品牌：
南京/科维思
型号：
K02420-S/L
参考报价：
销售商：
总点击数：
1055
更新日期：
2019-08-27
产品类别：
性能参数
Balancer NGS Library Preparation Kit for small/microRNA – Illumina Compatible
流程介绍
small/microRNA文库制备试剂盒能有效去除引物二聚体，并在同样数据量中获得更多种类的小RNA。具有单一试管反应、一天工作流程的特点。整个流程从总RNA开始，经过接头连接、反转录、PCR和切胶回收的过程，可构建适合Illumina测序仪的small/microRNA文库。通过优化实验流程，有效减少了接头的二聚体，可以从最少10ng 总RNA中成功完成文库构建，同时有效降低了连接反应的偏好性（bias），使得客户能够在同样的测序深度来发现更多的小RNA和microRNA，产生更好的科研发现。该产品可被广泛应用于分析各类临床样品（如FFPE样品和血清/血浆样本）的总RNA。
流程图
流程优势
• 更多地发现——有效去除连接偏好性（bias）；
• 更优的数据质量——显著去除接头二聚体；
• 优化的实验流程——单管一天实验流程。
• 以总RNA作为起始反应物——无须进一步的纯化；
• 10ng总RNA便可进行；
• 可应用于血清和FFPE样品；
• 适合自动化操作。
产品信息
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货号 |
产品名 |
规格 |
|---|---|---|
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K02420-S |
Balancer NGS Library Preparation Kit for small/microRNA – Illumina Compatible |
12 rxn |
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K02420-L |
Balancer NGS Library Preparation Kit for small/microRNA – Illumina Compatible |
48 rxn |
常见问题解答
1. 你们是否处理过血清样本，对于血清样本你们是否有什么建议？需要多少血清能够提取出足够建库的total RNA？
我们处理过大量血清样本，有优化过的total RNA纯化的流程。通常0.5－1ml血清就可以得到建库足够的total RNA。当然，这也和血清样本的保存状况有关。
2. 你们的barcode序列在哪个位置？barcode有多少种？
我们的barcode序列存在于PCR 引物上，有48种。
3. 在实验过程中比较重要的步骤是哪几个步骤？
只要样本中存在小RNA，按照我们的protocol操作一般是不会出现问题的。需要注意的只有一点：我们建议大家在建库时做一个不加样本的负对照，这样可以清晰的观察到小RNA的条带电泳的位置，并和可能产生的引物二聚体区分，这样不会错误回收引物二聚体片段。胶尽量跑远，割胶前后都要照相。不只一条条带时分别切胶回收等也都是减少无用数据的方法。
4. 你们两端的接头加起来长度是多少？所切的片段大小是多少？
micro RNA试剂盒5’和3’接头加起来长度是118bp。在切胶回收的时候，会切取140bp-160bp之间的片段。建议做阴性对照，这样可以清楚的识别出所需要的小RNA。
5. 在高通量测序中，小RNA 建库过程中是通过什么方式来减少引物二聚体的形成的？
这是我们小RNA文库制备的试剂盒的另一个主要优势：在小RNA与3’接头连接后，加入RT-primer。RT- primer可以与3’接头互补结合，形成RNA：DNA双链杂合体。这些双链杂合体不能作为RNA连接酶的底物，和后期加入的5’接头连接，从而减少了引物二聚体的形成。
6. 在高通量测序中，小RNA 建库过程中怎么去除mRNA及rRNA的？在哪步去除？
小RNA 建库过程中mRNA和rRNA不需要去除，因为它们不干扰整个反应。在小RNA 接头连接的时候，所用的RNA连接酶对于长的片段的连接效率低，两端同时连上接头的品种大多数是小RNA。少数掺入的mRNA或rRNA会因分子量的不同，在根据片段长度切胶纯化的过程中，自然而然地去除了。如果mRNA存在降解，并且降解的mRNA条带在小RNA条带附近，在测序结果中会看到这些降解mRNA的存在。
7. 在高通量测序中，small RNA文库构建是怎么解决序列偏好性（bias）的？
这是我们小RNA文库制备的试剂盒的主要优势之一：在5’接头的连接序列处序列进行了调整，有效去除了序列偏好性。在相同的数据量下，可以找到更多种类的小RNA，去发现别的技术可能丢失的信息。
8. 在高通量测序中，small RNA 文库构建是从total RNA起始的吗？一般 total RNA 需要的量是多少？最低起始量是多少？
small RNA 文库构建是从total RNA起始的。在建库中，一般total RNA的用量是1ug，最低起始量是10ng。small RNA 建库的关键之处是提取的RNA中是否有small RNA，及含有的small RNA 的多少。不同物种不同样品提取的small RNA的含量都不同，一般情况下，样品起始量为1ug total RNA，PCR进行12个循环。
公司简介
南京科维思生物科技股份有限公司创立于2012年，是一家新兴的基因检测技术生物企业，总部位于南京市江宁区，拥有GMP洁净厂房以及获批CLIA认证的临床实验室，在美国加州圣地亚哥设有技术开发和海外市场中心。科维思定位于肿瘤液体活检，专注于肿瘤的液体活检这一细分领域，同时拥有高通量测序和数字PCR这两个适用于液体活检的技术平台的技术能力和产品开发能力，以基于游离DNA的肿瘤相关突变无创检测及肿瘤抗药性早期预警的试剂和技术的开发为市场主营业务方向。在商业模式上专注于做基因检测行业技术和产品的供应商，目标是将自主研发和最终获得cFDA临检资质的肿瘤液体活检产品推向临床，成为拥有多项知识产权、不断创新的临床分子诊断企业。科维思在成立后短短3年时间，形成了以下核心产品和服务：
NGS产品包括正在申报的肺癌EGFR，ALK，cMET等多基因分子标志物检测试剂盒、乳腺癌Her2检测试剂盒；已经获得一类医疗器械备案和生产备案的游离DNA纯化及文库构建试剂盒、目标序列测序反应通用试剂盒；针对临床科研用的文库构建试剂盒完整的产品线。NGS产品同时针对Life和Illumina测序平台，形成对测序上游需求的覆盖。
数字PCR相关产品包括预计于2016年3月启动注册申报肺癌EGFR 3个热点位点检测试剂盒，ALK Fusion 基因检测试剂盒，乳腺癌／胃癌HER2基因扩增检测试剂盒；目前这几类检测均完成前期研发，进入临床样本验证阶段。白血病BCR-ABL融合基因检测试剂盒进入研发阶段。
同时，科维思面向临床单位等提供科研服务，聚焦于肿瘤的基于外周血游离DNA的研究。研究方向涉及多种肿瘤，在新辅助治疗，辅助治疗，晚期解救治疗等不同的病程阶段在外周血中进行肿瘤分子标志物的检测并和临床治疗结果进行相关分析，在回答疗效、耐药等肿瘤医生关心的科研问题的同时，完成新产品开发和初步的临床验证，并为后期申报积累专家和样品资源。
科维思通过和跨国企业的合作，进入仪器国产化的通道，生产，申报并上市科维思品牌的文库构建，高通量测序，及数字PCR的相关仪器。
NGS产品包括正在申报的肺癌EGFR，ALK，cMET等多基因分子标志物检测试剂盒、乳腺癌Her2检测试剂盒；已经获得一类医疗器械备案和生产备案的游离DNA纯化及文库构建试剂盒、目标序列测序反应通用试剂盒；针对临床科研用的文库构建试剂盒完整的产品线。NGS产品同时针对Life和Illumina测序平台，形成对测序上游需求的覆盖。
数字PCR相关产品包括预计于2016年3月启动注册申报肺癌EGFR 3个热点位点检测试剂盒，ALK Fusion 基因检测试剂盒，乳腺癌／胃癌HER2基因扩增检测试剂盒；目前这几类检测均完成前期研发，进入临床样本验证阶段。白血病BCR-ABL融合基因检测试剂盒进入研发阶段。
同时，科维思面向临床单位等提供科研服务，聚焦于肿瘤的基于外周血游离DNA的研究。研究方向涉及多种肿瘤，在新辅助治疗，辅助治疗，晚期解救治疗等不同的病程阶段在外周血中进行肿瘤分子标志物的检测并和临床治疗结果进行相关分析，在回答疗效、耐药等肿瘤医生关心的科研问题的同时，完成新产品开发和初步的临床验证，并为后期申报积累专家和样品资源。
科维思通过和跨国企业的合作，进入仪器国产化的通道，生产，申报并上市科维思品牌的文库构建，高通量测序，及数字PCR的相关仪器。
售后服务
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联系方式
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