空间转录组测序-欧易生物--性能参数，报价/价格，图片

基本信息

服务名称：

空间转录组测序-欧易生物

英文名称：

空间转录组测序-欧易生物

参考报价：

服务商：

上海欧易生物医学科技有限公司

总点击数：

4840

更新日期：

2023-10-20

服务类别：

测序/合成

服务详情

空间转录组是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术，从而解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着，使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。

单细胞RNA测序或组织样本RNA测序，均无法为研究人员提供精确的空间信息。通过空间转录组技术可获取组织中具体位置的转录信息，为研究和诊断提供有效数据支撑。

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△ 欧易生物空间转录组测序技术已通过10x Genomics CSP官方认证

应用方向

10x Genomics空间转录组技术可以应用于肿瘤、免疫、发育、神经和病理等研究方向

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技术优势

广泛的样本适用性：适合大多数组织类型

简单的操作流程：一个工作日内可完成从组织切片到文库的工作流程

较高的分辨率：每个捕获区域包含 5000 个 spots，每个 spots 捕获平均 1-10 个细胞

易于与组织学分析的实验室方法和工具集成

实验原理

10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcoded spots），每个点的直径为55 μm，点和点之间中心的距离为100 μm，并且每个点都有一个唯一的barcode序列。

组织切片的细胞中会释放出mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列，然后进行文库构建并进行测序。

最后，根据数据的条形码信息对数据进行分析，以确定哪些数据来自哪个位置，从而实现空间基因表达的可视化。

实验流程

10X Visium的实验主要分为两部分：组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像，记录切片的形态学信息；组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序，记录切片的转录本信息和空间位置信息。

具体实验流程如下：

A、切片制备和优化：取新鲜组织、冷冻、切片，并进行HE染色成像，优化确定切片是否覆盖靶向区域。

B、切片固定和透化：将组织切片放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上，并进行固定和透化，使细胞中的 mRNA 得到释放，并结合到相应的捕获探针上，从而获取基因表达信息。

C、逆转和文库构建：以捕获的 RNA 为模板，进行 cDNA 合成，和测序文库制备。

D、高通量上机测序：对制备好的测序文库，进行二代高通量短读长测序。

E、数据可视化分析：结合HE结果，确定哪些基因有表达，表达量高低，以及这些基因的空间位置信息

联系我们：www.oenbiotech.com

公司简介

上海欧易生物医学科技有限公司（简称：“欧易生物”），成立于2009年，经过十多年稳健发展，已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司，600名以上员工的生物科技领域集团型企业。

公司为大生命科学、大健康相关研究领域，以及医药、食品及日化企业的客户，提供从基础研究到药物靶点发现、药理药效及安全性评价、疾病分子标志物筛选、致病菌及耐药菌溯源等相关技术服务，全力加速客户研究、开发进程，大大提升客户研究、开发价值。

公司现已建成完整齐备的多组学检测服务平台和多组学联合大数据分析平台，提供基因组、转录组、表观组、微生物组、蛋白组、代谢组等全组学检测服务；并不断跟踪组学技术进展，近几年在单细胞测序技术、空间多组学技术（空间代谢组、空间转录组）、单细胞蛋白组技术、多组学联合分析等方面逐渐取得综合优势。

2017年，基于多组学领域多年的技术积累与沉淀，进入分子诊断领域，聚焦生殖遗传，主攻染色体遗传病、单基因遗传病以及不孕不育相关遗传病，搭建闭环式的出生缺陷防控分子诊断技术体系与产品体系，致力于优生优育，幸福中国家庭。 ${xunruicms_img_title}$ 欧易生物先后与中国海洋大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所等机构建立了紧密的产学研合作，与日立诊断产品有限公司共建联合研发实验室，与华东师范大学合作建立院士专家工作站，并陆续获得闵行区研发机构、闵行区科技小巨人企业、上海市科技小巨人企业等资质。还获得知识产权管理体系认证企业资质，总授权发明专利27项、在审发明专利36项、授权软件著作权143项。