10x Genomics 单细胞转录组测序
单细胞转录组测序是在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项新技术,能够有效解决细胞异质性以及bulk RNA-seq被掩盖的细胞群内转录组异质性难题,有助于发现新的稀有细胞类型,深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。
基于10x Genomics和BD RhapsodyTM平台可以实现单个样本数千甚至上万个单细胞群体分析,解决传统单细胞测序在通量或扩展性方面存在的不足,为单细胞研究开拓了新的思路。
△ 欧易生物单细胞转录组测序技术已通过10x Genomics CSP官方认证
技术优势
通量高:一次可以同时测8个样本,每个样本最多可以检测到上万个细胞
周期短:17分钟内完成上万个细胞封装,一天之内完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增以及建库
捕获效率高:细胞捕获效率高达65 %
应用范围广:动物细胞和植物细胞均可以进行单细胞测序,已广泛应用于肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测和胚胎发育研究等
10x Genomics的Chromium系统利用8通道的微流体“双十字”交叉系统,将含barcode的凝胶珠(Gel Beads)、细胞和酶的混合物、油三者混合,形成GEMs(油包水的微体系)GEMs形成后,细胞裂解,凝胶珠自动溶解释放大量barcode序列。
随后mRNA逆转录产生带有10× barcode和UMI信息的cDNA,构建标准测序文库。
(1)凝胶珠进入第一个进样口与细胞悬液和酶等混合,通过第二个进样口时被油滴包裹,形成GEMs,随后细胞裂解,凝胶珠溶解,进行逆转录
(2)油滴破裂,收集cDNA产物,进行cDNA扩增
(3)构建测序文库进行测序
(1)样品总量:制备成细胞悬浮液,一个样本的细胞起始量需大于1x10 5个;
(2)样品浓度:最终上样前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL;
(3)细胞活性:活细胞数目在85 %以上;
(4)细胞大小:直径小于40 μm;
(5)细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质;
(6)组织需解离成单细胞悬液,植物细胞需制成原生质体。
上海欧易生物医学科技有限公司(简称:“欧易生物”),成立于2009年,经过十多年稳健发展,已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司,600名以上员工的生物科技领域集团型企业。
公司为大生命科学、大健康相关研究领域,以及医药、食品及日化企业的客户,提供从基础研究到药物靶点发现、药理药效及安全性评价、疾病分子标志物筛选、致病菌及耐药菌溯源等相关技术服务,全力加速客户研究、开发进程,大大提升客户研究、开发价值。
公司现已建成完整齐备的多组学检测服务平台和多组学联合大数据分析平台,提供基因组、转录组、表观组、微生物组、蛋白组、代谢组等全组学检测服务;并不断跟踪组学技术进展,近几年在单细胞测序技术、空间多组学技术(空间代谢组、空间转录组)、单细胞蛋白组技术、多组学联合分析等方面逐渐取得综合优势。
2017年,基于多组学领域多年的技术积累与沉淀,进入分子诊断领域,聚焦生殖遗传,主攻染色体遗传病、单基因遗传病以及不孕不育相关遗传病,搭建闭环式的出生缺陷防控分子诊断技术体系与产品体系,致力于优生优育,幸福中国家庭。欧易生物先后与中国海洋大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所等机构建立了紧密的产学研合作,与日立诊断产品有限公司共建联合研发实验室,与华东师范大学合作建立院士专家工作站,并陆续获得闵行区研发机构、闵行区科技小巨人企业、上海市科技小巨人企业等资质。还获得知识产权管理体系认证企业资质,总授权发明专利27项、在审发明专利36项、授权软件著作权143项。
“欧易生物”始终坚守“硬数据,好服务”的价值理念,高度重视数据质量及客户服务体验,不断打造自身的“服务力”,倾听客户心声,珍视客户委托,始终将客户满意作为工作质量评价的首要标准,全力打造“创新多组学”优势品牌。
秉承“正直、开放、务实、奋进”价值观的欧易人,正努力践行“以生物科技,成就他人,造福大众”的企业使命,在生命科学及大健康领域奋发有为,以先进的组学技术服务助力基础研究,推动科技创新;以优秀的精准产品造福大众健康,幸福千万家庭。并为将“欧易生物”打造成“受人尊敬的生物科技公司”而奋斗不息!
产品架构
单细胞测序
单细胞转录组测序
空间转录组测序
Xenium 组织空间原位分析技术
FLEX单细胞转录组测序
单细胞免疫组库(VDJ)
单细胞多模态(ATAC+转录组)
单细胞样本制备试剂盒
酵母文库
泛素E3文库筛选
膜体系文库构建
核体系文库构建
转录因子文库筛选
酵母文库筛选
筛库配套试剂
转录组学
Small RNA测序
真核生物转录组测序
全转录组测序
基因组学
低深度重测序(LcWGS)
简化基因组测序(2b-RAD/Super-GBS)
基因组重测序
外显子测序
微生物组学
单细胞微生物基因组测序
微生物多样性测序
宏基因组测序
疑难样本微生物多样性测序(2bRAD-M)
细菌基因组 de novo 测序
表观组学
RNA甲基化测序(m6A)
935k甲基化芯片
全基因组甲基化测序(WGBS)
简化基因组甲基化测序(MethylRAD)
CUT&Tag测序
蛋白质组学
靶向蛋白质组学(PRM)
修饰蛋白质组学
标记定量蛋白质组学(iTRAQ/TMT)
代谢组学
空间代谢组学
非靶向代谢组学
靶向代谢组
拟靶向代谢组(脂质代谢组学)
多组学服务
多组学联合分析
合作服务平台
RACS-Seq 单细胞拉曼分选-测序耦合系统
细胞服务平台
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上海市闵行区联航路
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